Fungal Genome Data



Species
Strain		 GenBank Accession Funding
Agency 		Citation
Allomyces macrogynus ATCC 38327 ACDU01000000 NHGRI  
Anncaliia algerae PRA109 AOMV00000000 NIAID  
Anncaliia algerae PRA339 AOMW00000000 NIAID  
Aspergillus nidulans FGSC A4 AACD01000000 NHGRI Galagan et al 2005
Aspergillus terreus NIH2624 AAJN01000000 NIAID  
Batrachochytrium dendrobatidis JEL423 AATT01000000 NHGRI Farrer et al 2017
Batrachochytrium salamandrivorans AM2013 LYON00000000 UK NERC Farrer et al 2017
Blastomyces dermatitidis ATCC18188 ADMK01000000 NIAID Munoz et al 2015
Blastomyces dermatitidis ATCC26199 AEII01000000 NIAID Munoz et al 2015
Blastomyces dermatitidis SLH-14081 ACBU01000000 NIAID Munoz et al 2015
Blastomyces dermatitidis ER-3 ACBT01000000 NIAID Munoz et al 2015
Botrytis cinerea B05.10 AAID01000000 Syngenta AG Amselem et al 2011
Candida albicans WO-1 AAFO01000000 NHGRI Butler et al 2009
Candida albicans 12C AJIQ01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans 19F AJIV01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans GC75 AJIW01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans L26 AJIR01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P34048 AJIZ01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P37005 AJIU01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P37037 AJJA01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P37039 JSXQ01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P57055 AJJB01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P57072 AJIY01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P60002 JSXP00000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P75010 JSXR01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P75016 JPEV00000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P75063 AJJC01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P76055 AJJD01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P76067 AJJE01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P78042 JPEW00000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P78048 AJIX01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P87 AJIT01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans P94015 AJIS01000000 NIAID Hirakawa et al 2015
Candida albicans 529L ASHC01000000 NIAID  
Candida albicans CHN1 AVAW01000000 NIAID  
Candida auris B8441 PEKT00000000 NIAID  
Candida auris B11221 PGLS00000000 NIAID  
Candida duobushaeumulonii B09383      
Candida guilliermondii ATCC 6260 AAFM01000000 NHGRI Butler et al 2009
Candida haemulonii B11899      
Candida krusei 81-B-5 NHMM00000000 NIAID Cuomo et al 2017
Candida pseudohaemulonii B12108      
Candida tropicalis MYA-3404 AAFN01000000 NHGRI Butler et al 2009
Candida lusitaniae ATCC 42720 AAFT01000000 NHGRI Butler et al 2009
Capronia coronata CBS 617.96 AMWN01000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Capronia epimyces CBS 606.96 AMGY01000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Capronia semiimmersa CBS 27337 JYCC00000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Chaetomium globosum CBS 148.51 AAFU01000000 NHGRI Cuomo et al 2015
Cladophialophora bantiana CBS 173.52 JYBT00000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Cladophialophora carrionii CBS 160.54 AOFF01000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Cladophialophora immunda CBS834.96 JYBZ00000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Cladophialophora psammophila CBS 110553 AMGX01000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Cladophialophora yegresii CBS 114405 AMGW01000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Coccidioides immitis RS AAEC03000000 NHGRI Sharpton et al 2009
Coccidioides immitis H538.4 AASO01000000 NIAID Neafsey et al 2010
Coccidioides immitis RMSCC 2394 AATX01000000 NIAID Neafsey et al 2010
Coccidioides immitis RMSCC 3703 ABBC01000000 NIAID Neafsey et al 2010
Coccidioides posadasii str. Silveira ABAI01000000 NIAID Neafsey et al 2010
Coccidioides posadasii RMSCC 3488 ABBB01000000 NIAID Neafsey et al 2010
Coccidioides posadasii RMSCC 2133 ABFM01000000 NIAID Neafsey et al 2010
Coccidioides posadasii RMSCC 3700 ABFN01000000 NIAID Neafsey et al 2010
Coccidioides posadasii CPA 0001 ABFO01000000 NIAID Neafsey et al 2010
Coccidioides posadasii RMSCC 1037 ABIS01000000 NIAID Neafsey et al 2010
Coccidioides posadasii RMSCC 1038 ABIT01000000 NIAID Neafsey et al 2010
Coccidioides posadasii RMSCC 1040 ABIU01000000 NIAID Neafsey et al 2010
Coccidioides posadasii CPA 0020 ABIV01000000 NIAID Neafsey et al 2010
Coccidioides posadasii CPA 0066 ABIW01000000 NIAID Neafsey et al 2010
Colletotrichum graminicola M1.001 ACOD01000000 USDA CSREES O'Connell et al 2012
Coniosporium apollinis CBS 100218 AJKL01000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Coprinopsis cinerea okayama7#130 AACS01000000 NHGRI Stajich et al 2010
Cryptococcus bestiolae CBS 10118 ASCK01000000 NHGRI  
Cryptococcus dejecticola CBS 10117 ASCJ01000000 NHGRI  
Cryptococcus gattii R265 (VGII) AAFP01000000; AAFP02000000 NHGRI D'Souza et al 2011
Cryptococcus gattii 2001/935-1 (VGII) AVEX01000000 NHGRI Farrer et al 2015
Cryptococcus gattii 99/473 (VGII) ASCP01000000 NHGRI Farrer et al 2015
Cryptococcus gattii CA1014 (VGII) ASCS01000000 NHGRI Farrer et al 2015
Cryptococcus gattii CA1280 (VGIII) ASCN01000000 NHGRI Farrer et al 2015
Cryptococcus gattii CA1873 (VGIII) ASCQ01000000 NHGRI Farrer et al 2015
Cryptococcus gattii CBS 10090 (VGII) AVEY01000000 NHGRI Farrer et al 2015
Cryptococcus gattii E566 (VGI) ASCT01000000 NHGRI Farrer et al 2015
Cryptococcus gattii EJB2 (VGI) ATAL01000000 NHGRI Farrer et al 2015
Cryptococcus gattii IND107 (VGIV) ATAM01000000 NHGRI Farrer et al 2015
Cryptococcus gattii LA55 (VGI) AZGW01000000 NHGRI Farrer et al 2015
Cryptococcus gattii MMRL2647 (VGII) ATAN01000000 NHGRI Farrer et al 2015
Cryptococcus gattii NT-10 (VGI) AZGX01000000 NHGRI Farrer et al 2015
Cryptococcus gattii Ram5 (VGII) ASCM01000000 NHGRI Farrer et al 2015
Cryptococcus gattii Ru294 (VGI) ASCO01000000 NHGRI Farrer et al 2015
Cryptococcus heveanesis BCC83 ASQB01000000 NHGRI  
Cryptococcus heveanesis CBS 569 ASQC01000000 NHGRI  
Cryptococcus neoformans H99 (VNI) AACO02000000 NHGRI Janbon et al 2014
Cryptococcus neoformans C45 (VNII) AMKX01000000 NHGRI Rhodes et al 2017
Cryptococcus neoformans Bt1 (VNB) AMKS01000000 NHGRI Rhodes et al 2017
Cryptococcus neoformans Bt85 (VNB) AMKP01000000 NHGRI Rhodes et al 2017
Cryptococcus pinus CBS 10737 ASCL01000000 NHGRI  
Cyphellophora europaea CBS 101466 AOBU01000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Encephalitozoon cuniculi EcI, EcII, EcIII AEWD01000000, AEWQ01000000, AEWR01000000 NIAID Pombert et al 2013
Edhazardia aedis USNM 41457 AFBI01000000 NIAID Desjardins et al 2015
Emergomyces africana (Emmonsia africana) CBS 136260 LGUA00000000   Dukik et al 2017
Emmonsia crescens UAMH3008 LCZI00000000   Munoz et al 2015
Emmonsia crescens UAMH4076 PDND00000000   Munoz et al 2017
Blastomyces percursus (Emmonsia israeliensis) BP222 LGTZ00000000   Dukik et al 2017
Blastomyces sp. 2 (Emmonsia parva) UAMH139 LDEV00000000   Munoz et al 2015
Emmonsia parva UAMH130 PDNC00000000   Munoz et al 2017
Emergomyces pasteurianus (Emmonsia pasteuriana) UAMH 9510 LGRN00000000   Dukik et al 2017
Exophiala aquamarina CBS 119918 AMGV01000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Exophiala mesophila CBS402.95 JYBW00000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Exophiala oligosperma CBS725.88 JYCA00000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Exophiala sideris CBS121828 JYBR00000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Exophiala spinifera CBS 89968 JYBY00000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Exophiala xenobiotica CBS118157 JYCB00000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Fonsecaea multimorphosa CBS 102226 JYBV00000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Fonsecaea pedrosoi CBS 271.37 JYBS00000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Fusarium graminearum PH-1 (NRRL 31084) AACM01000000 USDA CSREES Cuomo et al 2007
Fusarium verticillioides 7600 AAIM02000211 USDA CSREES Ma et al 2010
Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici 4287 AAXH01000000 USDA CSREES Ma et al 2010
Fusarium oxysporum f. sp. melonis NRRL 26406 AGNE00000000 USDA Ma et al 2014
Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici 26381 AGNB01000000 USDA  
Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum 25433 AGNC01000000 USDA  
Fusarium oxysporum Fo47 AFMM01000000 USDA  
Fusarium oxysporum f. sp. pisi HDV247 AGBI01000000 USDA  
Fusarium oxysporum f. sp. cubense tropical race 4 54006 AGND01000000 USDA  
Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici MN25 AGBH01000000 USDA  
Fusarium oxysporum f. sp. conglutinans race 2 54008 AGNF01000000 USDA  
Fusarium oxysporum f. sp. raphani 54005 AGNG01000000 USDA  
Fusarium oxysporum FOSC 3-a NRRL32931 AFML01000000 USDA  
Gaeumannomyces graminis var. tritici R3-111a-1 ADBI01000000 NSF Okagaki et al 2015
Geomyces destructans 20631-21 AEFC01000000 NHGRI and USGS  
 Helicocarpus griseus UAMH5409 PDNB00000000   Munoz et al 2017
Histoplasma capsulatum NAm1 AAJI01000000 NHGRI  
Histoplasma capsulatum G186AR ABBS02000000 NIAID  
Histoplasma capsulatum H143 ABRK01000000 NIAID  
Lacazia loboi EDM7   NIAID  
Lodderomyces elongisporus NRRL YB-4239 AAPO01000000 NHGRI Butler et al 2009
Magnaporthe oryzae 70-15 AACU02000000 NSF Dean et al 2005
Magnaporthe poae ATCC 64411 ADBL01000000 NSF Okagaki et al 2015
Microbotryum violaceum isolate p1A1 Lamole AEIJ01000000 NSF Perlin et al 2015
Microsporum canis CBS113480 ABVF01000000 NHGRI Martinez et al 2012
Microsporum gypseum CBS118893 ABQE01000000 NHGRI Martinez et al 2012
Mortierella verticulata NRRL 6337 AEVJ01000000 NHGRI  
Mucor circinelloides f. sp circinelloides 1006PhL AOCY00000000 NHGRI Lee et al 2014
Nematocida parisii ERTm1 AEFF01000000 NIAID Cuomo et al 2012
Nematocida sp1 ERTm2 AERB01000000 NIAID Cuomo et al 2012
Nematocida parisii ERTm3 AEOO01000000 NIAID Cuomo et al 2012
Nematocida sp1 ERTm6 AKIJ00000000 NIAID Bakowski et al 2014
Neurospora crassa OR74A AABX02000000 NSF Galagan et al 2003
Ochroconis gallopava CBS437.64 JYBX00000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Paracoccidioides brasiliensis PS2 Pb03 ABHV01000000 NIAID Desjardins et al 2011
Paracoccidioides brasiliensis S1 Pb18 ABKI01000000 NIAID Desjardins et al 2011
Paracoccidioides lutzii Pb01 ABKH01000000 NIAID Desjardins et al 2011
Paracoccidioides brasiliensis PS3 PbCNH LYUC00000000   Munoz et al 2016
Paracoccidioides brasiliensis PS4 Pb300 LZYO00000000   Munoz et al 2016
Pneumocystis carinii rat isolate LFVZ00000000 NHGRI Ma et al 2016
Pneumocystis jirovecii RU7 human isolate LFWA01000000 NHGRI Ma et al 2016
Pneumocystis murina mouse isolate AFWA00000000 NHGRI Ma et al 2016
Polytolypa hystricis UAMH7299 PDNA00000000   Munoz et al 2017
Puccinia graminis f. sp. tritici CRL 75-36-700-3 AAWC01000000 NSF Duplessis et al 2011
Puccinia striiformis isolate 2K041-Yr9 race PST-78 AJIL00000000 USDA Cuomo et al 2017
Puccinia triticina 1:1a ADAS00000000 USDA Cuomo et al 2017
Pyrenophora tritici-repentis Pt-1C-BFP AAXI01000000 USDA CSREES Manning et al 2013
Rhinocladiella mackenziei CBS 650.93 JYBU00000000 NHGRI Teixeira et al 2017
Rhizopus delemar RA 99-880 AACW02000000 NHGRI Ma et al 2009
Saccharomyces cerevisiae RM11-1a AAEG01000000 NHGRI  
Schizosaccharomyces cryophilus OY26 ACQJ02000000 NHGRI Rhind et al 2011
Schizosaccharomyces japonicus yFS275 AATM01000000 NHGRI Rhind et al 2011
Schizosaccharomyces octosporus yFS286 ABHY02000020 NHGRI Rhind et al 2011
Sclerotinia sclerotiorum 1980 AAGT01000000 USDA CSREES Amselem et al 2011
Spizellomyces punctatus BR117 ACOE01000000 NHGRI Russ et al 2016
Sporothrix schenckii ATCC 58251 AWEQ01000000 NHGRI Cuomo et al 2014
Stagonospora nodorum SN15 AAGI01000000 Australian Grains Research and
Development Corporation		 Hane et al 2007
Trichophyton equinum CBS127.97 ABWI01000000 NHGRI Martinez et al 2012
Trichophyton interdigitale H6 AOKS00000000 NHGRI Persinoti et al 2018
Trichophyton interdigitale MR816 AOKY00000000 NHGRI Persinoti et al 2018
Trichophyton rubrum CBS118892  ACPH01000000 NHGRI Martinez et al 2012
Trichophyton rubrum D6 AOLB00000000 NHGRI Persinoti et al 2018
Trichophyton rubrum MR850 AOKR00000000 NHGRI Persinoti et al 2018
Trichophyton rubrum MR1448 AOKZ00000000 NHGRI Persinoti et al 2018
Trichophyton rubrum MR1459 AOLC00000000 NHGRI Persinoti et al 2018
Trichophyton rubrum (morphotype fischeri) CBS 100081 AOKT00000000 NHGRI Persinoti et al 2018
Trichophyton rubrum (morphotype fischeri) CBS 288.86 AOKU00000000 NHGRI Persinoti et al 2018
Trichophyton rubrum (morphotype kanei) CBS 289.86 AOKV00000000 NHGRI Persinoti et al 2018
Trichophyton rubrum (morphotype megninii) CBS 735.88 JHQM00000000 NHGRI Persinoti et al 2018
Trichophyton rubrum (morphotype raubitschekii) CBS 202.88 AOKX00000000 NHGRI Persinoti et al 2018
Trichophyton rubrum (morphotype soudanense) CBS 452.61 AOKW00000000 NHGRI Persinoti et al 2018
Trichophyton tonsurans CBS112818  ACPH01000000 NHGRI Martinez et al 2012
Uncinocarpus reesii UAMH 1704 AAIW01000000 NHGRI Sharpton et al 2009
Ustilago maydis 521 AACP01000000 NHGRI Kamper et al 2006
Vavraia culicis isolate floridensis AEUG01000000 NIAID Desjardins et al 2015
Verticillium dahliae VdLs.17 ABJE01000000 USDA CSREES Klosterman et al 2011
Verticillium albo-atrum VaMs.102 ABPE01000000 USDA CSREES Klosterman et al 2011
Vittaforma corneae ATCC 50505 AEYK01000000 NIAID Cuomo et al 2012
Wangiella (Exophilia) dermatitidis NIH/UT8656 AFPA01000000 NHGRI Chen et al 2014

 

 

This page was last updated: March 20, 2018.

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