You are here

Eric Lander

S. R. Grossman, Engreitz, J. , Ray, J. P. , Nguyen, T. H. , Hacohen, N. , and Lander, E. S. , Positional specificity of different transcription factor classes within enhancers., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 115, no. 30, pp. E7222-E7230, 2018.
M. Yassour, Jason, E. , Hogstrom, L. J. , Arthur, T. D. , Tripathi, S. , Siljander, H. , Selvenius, J. , Oikarinen, S. , Hyöty, H. , Virtanen, S. M. , Ilonen, J. , Ferretti, P. , Pasolli, E. , Tett, A. , Asnicar, F. , Segata, N. , Vlamakis, H. , Lander, E. S. , Huttenhower, C. , Knip, M. , and Xavier, R. J. , Strain-Level Analysis of Mother-to-Child Bacterial Transmission during the First Few Months of Life., Cell Host Microbe, vol. 24, no. 1, pp. 146-154.e4, 2018.
R. K. Khajuria, Munschauer, M. , Ulirsch, J. C. , Fiorini, C. , Ludwig, L. S. , McFarland, S. K. , Abdulhay, N. J. , Specht, H. , Keshishian, H. , Mani, D. R. , Jovanovic, M. , Ellis, S. R. , Fulco, C. P. , Engreitz, J. M. , Schütz, S. , Lian, J. , Gripp, K. W. , Weinberg, O. K. , Pinkus, G. S. , Gehrke, L. , Regev, A. , Lander, E. S. , Gazda, H. T. , Lee, W. Y. , Panse, V. G. , Carr, S. A. , and Sankaran, V. G. , Ribosome Levels Selectively Regulate Translation and Lineage Commitment in Human Hematopoiesis., Cell, vol. 173, no. 1, pp. 90-103.e19, 2018.
C. S. Grasso, Giannakis, M. , Wells, D. K. , Hamada, T. , Mu, X. Jasmine, Quist, M. , Nowak, J. A. , Nishihara, R. , Qian, Z. Rong, Inamura, K. , Morikawa, T. , Nosho, K. , Abril-Rodriguez, G. , Connolly, C. , Escuin-Ordinas, H. , Geybels, M. S. , Grady, W. M. , Hsu, L. , Hu-Lieskovan, S. , Huyghe, J. R. , Kim, Y. Joo, Krystofinski, P. E. , Leiserson, M. Dm, Montoya, D. J. , Nadel, B. B. , Pellegrini, M. , Pritchard, C. C. , Puig-Saus, C. , Quist, E. H. , Raphael, B. J. , Salipante, S. J. , Shin, D. Sanghoon, Shinbrot, E. , Shirts, B. , Shukla, S. , Stanford, J. L. , Sun, W. , Tsoi, J. , Upfill-Brown, A. , Wheeler, D. A. , Wu, C. J. , Yu, M. , Zaidi, S. H. , Zaretsky, J. M. , Gabriel, S. B. , Lander, E. S. , Garraway, L. A. , Hudson, T. J. , Fuchs, C. S. , Ribas, A. , Ogino, S. , and Peters, U. , Genetic mechanisms of immune evasion in colorectal cancer., Cancer Discov, 2018.
R. Tewhey, Kotliar, D. , Park, D. S. , Liu, B. , Winnicki, S. , Reilly, S. K. , Andersen, K. G. , Mikkelsen, T. S. , Lander, E. S. , Schaffner, S. F. , and Sabeti, P. C. , Direct Identification of Hundreds of Expression-Modulating Variants using a Multiplexed Reporter Assay., Cell, vol. 172, no. 5, pp. 1132-1134, 2018.
J. Flannick, Fuchsberger, C. , Mahajan, A. , Teslovich, T. M. , Agarwala, V. , Gaulton, K. J. , Caulkins, L. , Koesterer, R. , Ma, C. , Moutsianas, L. , McCarthy, D. J. , Rivas, M. A. , Perry, J. R. B. , Sim, X. , Blackwell, T. W. , Robertson, N. R. , N Rayner, W. , Cingolani, P. , Locke, A. E. , Tajes, J. Fernandez, Highland, H. M. , Dupuis, J. , Chines, P. S. , Lindgren, C. M. , Hartl, C. , Jackson, A. U. , Chen, H. , Huyghe, J. R. , van de Bunt, M. , Pearson, R. D. , Kumar, A. , Müller-Nurasyid, M. , Grarup, N. , Stringham, H. M. , Gamazon, E. R. , Lee, J. , Chen, Y. , Scott, R. A. , Below, J. E. , Chen, P. , Huang, J. , Go, M. Jin, Stitzel, M. L. , Pasko, D. , Parker, S. C. J. , Varga, T. V. , Green, T. , Beer, N. L. , Day-Williams, A. G. , Ferreira, T. , Fingerlin, T. , Horikoshi, M. , Hu, C. , Huh, I. , Ikram, M. Kamran, Kim, B. - J. , Kim, Y. , Kim, Y. Jin, Kwon, M. - S. , Lee, J. , Lee, S. , Lin, K. - H. , Maxwell, T. J. , Nagai, Y. , Wang, X. , Welch, R. P. , Yoon, J. , Zhang, W. , Barzilai, N. , Voight, B. F. , Han, B. - G. , Jenkinson, C. P. , Kuulasmaa, T. , Kuusisto, J. , Manning, A. , C Y Ng, M. , Palmer, N. D. , Balkau, B. , Stančáková, A. , Abboud, H. E. , Boeing, H. , Giedraitis, V. , Prabhakaran, D. , Gottesman, O. , Scott, J. , Carey, J. , Kwan, P. , Grant, G. , Smith, J. D. , Neale, B. M. , Purcell, S. , Butterworth, A. S. , Howson, J. M. M. , Lee, H. Man, Lu, Y. , Kwak, S. - H. , Zhao, W. , Danesh, J. , Lam, V. K. L. , Park, K. Soo, Saleheen, D. , So, W. Yee, Tam, C. H. T. , Afzal, U. , Aguilar, D. , Arya, R. , Aung, T. , Chan, E. , Navarro, C. , Cheng, C. - Y. , Palli, D. , Correa, A. , Curran, J. E. , Rybin, D. , Farook, V. S. , Fowler, S. P. , Freedman, B. I. , Griswold, M. , Hale, D. Esten, Hicks, P. J. , Khor, C. - C. , Kumar, S. , Lehne, B. , Thuillier, D. , Lim, W. Yen, Liu, J. , Loh, M. , Musani, S. K. , Puppala, S. , Scott, W. R. , Yengo, L. , Tan, S. - T. , Taylor, H. A. , Thameem, F. , Wilson, G. , Wong, T. Yin, Njølstad, P. Rasmus, Levy, J. C. , Mangino, M. , Bonnycastle, L. L. , Schwarzmayr, T. , Fadista, J. , Surdulescu, G. L. , Herder, C. , Groves, C. J. , Wieland, T. , Bork-Jensen, J. , Brandslund, I. , Christensen, C. , Koistinen, H. A. , Doney, A. S. F. , Kinnunen, L. , Esko, T. , Farmer, A. J. , Hakaste, L. , Hodgkiss, D. , Kravic, J. , Lyssenko, V. , Hollensted, M. , Jørgensen, M. E. , Jørgensen, T. , Ladenvall, C. , Justesen, J. Marie, Käräjämäki, A. M. , Kriebel, J. , Rathmann, W. , Lannfelt, L. , Lauritzen, T. , Narisu, N. , Linneberg, A. , Melander, O. , Milani, L. , Neville, M. , Orho-Melander, M. , Qi, L. , Qi, Q. , Roden, M. , Rolandsson, O. , Swift, A. , Rosengren, A. H. , Stirrups, K. , Wood, A. R. , Mihailov, E. , Blancher, C. , Carneiro, M. O. , Maguire, J. , Poplin, R. , Shakir, K. , Fennell, T. , DePristo, M. , de Angelis, M. Hrabe, Deloukas, P. , Gjesing, A. P. , Jun, G. , Nilsson, P. , Murphy, J. , Onofrio, R. , Thorand, B. , Hansen, T. , Meisinger, C. , Hu, F. B. , Isomaa, B. , Karpe, F. , Liang, L. , Peters, A. , Huth, C. , O'Rahilly, S. P. , Palmer, C. N. A. , Pedersen, O. , Rauramaa, R. , Tuomilehto, J. , Salomaa, V. , Watanabe, R. M. , Syvänen, A. - C. , Bergman, R. N. , Bharadwaj, D. , Bottinger, E. P. , Cho, Y. Shin, Chandak, G. R. , Chan, J. Cn, Chia, K. Seng, Daly, M. J. , Ebrahim, S. B. , Langenberg, C. , Elliott, P. , Jablonski, K. A. , Lehman, D. M. , Jia, W. , Ma, R. C. W. , Pollin, T. I. , Sandhu, M. , Tandon, N. , Froguel, P. , Barroso, I. , Teo, Y. Ying, Zeggini, E. , Loos, R. J. F. , Small, K. S. , Ried, J. S. , DeFronzo, R. A. , Grallert, H. , Glaser, B. , Metspalu, A. , Wareham, N. J. , Walker, M. , Banks, E. , Gieger, C. , Ingelsson, E. , Im, H. Kyung, Illig, T. , Franks, P. W. , Buck, G. , Trakalo, J. , Buck, D. , Prokopenko, I. , Mägi, R. , Lind, L. , Farjoun, Y. , Owen, K. R. , Gloyn, A. L. , Strauch, K. , Tuomi, T. , Kooner, J. Singh, Lee, J. - Y. , Park, T. , Donnelly, P. , Morris, A. D. , Hattersley, A. T. , Bowden, D. W. , Collins, F. S. , Atzmon, G. , Chambers, J. C. , Spector, T. D. , Laakso, M. , Strom, T. M. , Bell, G. I. , Blangero, J. , Duggirala, R. , E Tai, S. , McVean, G. , Hanis, C. L. , Wilson, J. G. , Seielstad, M. , Frayling, T. M. , Meigs, J. B. , Cox, N. J. , Sladek, R. , Lander, E. S. , Gabriel, S. , Mohlke, K. L. , Meitinger, T. , Groop, L. , Abecasis, G. , Scott, L. J. , Morris, A. P. , Kang, H. Min, Altshuler, D. , Burtt, N. P. , Florez, J. C. , Boehnke, M. , and McCarthy, M. I. , Sequence data and association statistics from 12,940 type 2 diabetes cases and controls., Sci Data, vol. 4, p. 170179, 2017.
Y. Zhou, Castonguay, P. , Sidhom, E. - H. , Clark, A. R. , Dvela-Levitt, M. , Kim, S. , Sieber, J. , Wieder, N. , Jung, J. Yong, Andreeva, S. , Reichardt, J. , Dubois, F. , Hoffmann, S. C. , Basgen, J. M. , Montesinos, M. S. , Weins, A. , Johnson, A. C. , Lander, E. S. , Garrett, M. R. , Hopkins, C. R. , and Greka, A. , A small-molecule inhibitor of TRPC5 ion channels suppresses progressive kidney disease in animal models., Science, vol. 358, no. 6368, pp. 1332-1336, 2017.
A. Regev, Teichmann, S. A. , Lander, E. S. , Amit, I. , Benoist, C. , Birney, E. , Bodenmiller, B. , Campbell, P. , Carninci, P. , Clatworthy, M. , Clevers, H. , Deplancke, B. , Dunham, I. , Eberwine, J. , Eils, R. , Enard, W. , Farmer, A. , Fugger, L. , Göttgens, B. , Hacohen, N. , Haniffa, M. , Hemberg, M. , Kim, S. , Klenerman, P. , Kriegstein, A. , Lein, E. , Linnarsson, S. , Lundberg, E. , Lundeberg, J. , Majumder, P. , Marioni, J. C. , Merad, M. , Mhlanga, M. , Nawijn, M. , Netea, M. , Nolan, G. , Pe'er, D. , Phillipakis, A. , Ponting, C. P. , Quake, S. , Reik, W. , Rozenblatt-Rosen, O. , Sanes, J. , Satija, R. , Schumacher, T. N. , Shalek, A. , Shapiro, E. , Sharma, P. , Shin, J. W. , Stegle, O. , Stratton, M. , Stubbington, M. J. T. , Theis, F. J. , Uhlen, M. , van Oudenaarden, A. , Wagner, A. , Watt, F. , Weissman, J. , Wold, B. , Xavier, R. , and Yosef, N. , The Human Cell Atlas., Elife, vol. 6, 2017.
B. Cleary, Cong, L. , Cheung, A. , Lander, E. S. , and Regev, A. , Efficient Generation of Transcriptomic Profiles by Random Composite Measurements., Cell, vol. 171, no. 6, pp. 1424-1436.e18, 2017.
A. Brantley Hall, Yassour, M. , Sauk, J. , Garner, A. , Jiang, X. , Arthur, T. , Lagoudas, G. K. , Vatanen, T. , Fornelos, N. , Wilson, R. , Bertha, M. , Cohen, M. , Garber, J. , Khalili, H. , Gevers, D. , Ananthakrishnan, A. N. , Kugathasan, S. , Lander, E. S. , Blainey, P. , Vlamakis, H. , Xavier, R. J. , and Huttenhower, C. , A novel Ruminococcus gnavus clade enriched in inflammatory bowel disease patients., Genome Med, vol. 9, no. 1, p. 103, 2017.
O. O. Abudayyeh, Gootenberg, J. S. , Essletzbichler, P. , Han, S. , Joung, J. , Belanto, J. J. , Verdine, V. , Cox, D. B. T. , Kellner, M. J. , Regev, A. , Lander, E. S. , Voytas, D. F. , Ting, A. Y. , and Zhang, F. , RNA targeting with CRISPR-Cas13., Nature, vol. 550, no. 7675, pp. 280-284, 2017.
S. S. P. Rao, Huang, S. - C. , St Hilaire, B. Glenn, Engreitz, J. M. , Perez, E. M. , Kieffer-Kwon, K. - R. , Sanborn, A. L. , Johnstone, S. E. , Bascom, G. D. , Bochkov, I. D. , Huang, X. , Shamim, M. S. , Shin, J. , Turner, D. , Ye, Z. , Omer, A. D. , Robinson, J. T. , Schlick, T. , Bernstein, B. E. , Casellas, R. , Lander, E. S. , and Aiden, E. Lieberman, Cohesin Loss Eliminates All Loop Domains., Cell, vol. 171, no. 2, pp. 305-320.e24, 2017.
G. Tiao, Improgo, M. R. , Kasar, S. , Poh, W. , Kamburov, A. , Landau, D. - A. , Tausch, E. , Taylor-Weiner, A. , Cibulskis, C. , Bahl, S. , Fernandes, S. M. , Hoang, K. , Rheinbay, E. , Kim, H. T. , Bahlo, J. , Robrecht, S. , Fischer, K. , Hallek, M. , Gabriel, S. , Lander, E. S. , Stilgenbauer, S. , Wu, C. J. , Kiezun, A. , Getz, G. , and Brown, J. R. , Rare germline variants in ATM are associated with chronic lymphocytic leukemia., Leukemia, vol. 31, no. 10, pp. 2244-2247, 2017.
P. Polak, Kim, J. , Braunstein, L. Z. , Karlić, R. , Haradhavala, N. J. , Tiao, G. , Rosebrock, D. , Livitz, D. , Kübler, K. , Mouw, K. W. , Kamburov, A. , Maruvka, Y. E. , Leshchiner, I. , Lander, E. S. , Golub, T. R. , Zick, A. , Orthwein, A. , Lawrence, M. S. , Batra, R. N. , Caldas, C. , Haber, D. A. , Laird, P. W. , Shen, H. , Ellisen, L. W. , D'Andrea, A. D. , Chanock, S. J. , Foulkes, W. D. , and Getz, G. , A mutational signature reveals alterations underlying deficient homologous recombination repair in breast cancer., Nat Genet, vol. 49, no. 10, pp. 1476-1486, 2017.
J. Joung, Engreitz, J. M. , Konermann, S. , Abudayyeh, O. O. , Verdine, V. K. , Aguet, F. , Gootenberg, J. S. , Sanjana, N. E. , Wright, J. B. , Fulco, C. P. , Tseng, Y. - Y. , Yoon, C. H. , Boehm, J. S. , Lander, E. S. , and Zhang, F. , Genome-scale activation screen identifies a lncRNA locus regulating a gene neighbourhood., Nature, vol. 548, no. 7667, pp. 343-346, 2017.
P. A. Ott, Hu, Z. , Keskin, D. B. , Shukla, S. A. , Sun, J. , Bozym, D. J. , Zhang, W. , Luoma, A. , Giobbie-Hurder, A. , Peter, L. , Chen, C. , Olive, O. , Carter, T. A. , Li, S. , Lieb, D. J. , Eisenhaure, T. , Gjini, E. , Stevens, J. , Lane, W. J. , Javeri, I. , Nellaiappan, K. , Salazar, A. M. , Daley, H. , Seaman, M. , Buchbinder, E. I. , Yoon, C. H. , Harden, M. , Lennon, N. , Gabriel, S. , Rodig, S. J. , Barouch, D. H. , Aster, J. C. , Getz, G. , Wucherpfennig, K. , Neuberg, D. , Ritz, J. , Lander, E. S. , Fritsch, E. F. , Hacohen, N. , and Wu, C. J. , An immunogenic personal neoantigen vaccine for patients with melanoma., Nature, vol. 547, no. 7662, pp. 217-221, 2017.
E. Rheinbay, Parasuraman, P. , Grimsby, J. , Tiao, G. , Engreitz, J. M. , Kim, J. , Lawrence, M. S. , Taylor-Weiner, A. , Rodriguez-Cuevas, S. , Rosenberg, M. , Hess, J. , Stewart, C. , Maruvka, Y. E. , Stojanov, P. , Cortés, M. L. , Seepo, S. , Cibulskis, C. , Tracy, A. , Pugh, T. J. , Lee, J. , Zheng, Z. , Ellisen, L. W. , A Iafrate, J. , Boehm, J. S. , Gabriel, S. B. , Meyerson, M. , Golub, T. R. , Baselga, J. , Hidalgo-Miranda, A. , Shioda, T. , Bernards, A. , Lander, E. S. , and Getz, G. , Recurrent and functional regulatory mutations in breast cancer., Nature, vol. 547, no. 7661, pp. 55-60, 2017.
V. Rusu, Hoch, E. , Mercader, J. M. , Tenen, D. E. , Gymrek, M. , Hartigan, C. R. , DeRan, M. , von Grotthuss, M. , Fontanillas, P. , Spooner, A. , Guzman, G. , Deik, A. A. , Pierce, K. A. , Dennis, C. , Clish, C. B. , Carr, S. A. , Wagner, B. K. , Schenone, M. , C Y Ng, M. , Chen, B. H. , Centeno-Cruz, F. , Zerrweck, C. , Orozco, L. , Altshuler, D. M. , Schreiber, S. L. , Florez, J. C. , Jacobs, S. B. R. , and Lander, E. S. , Type 2 Diabetes Variants Disrupt Function of SLC16A11 through Two Distinct Mechanisms., Cell, vol. 170, no. 1, pp. 199-212.e20, 2017.
A. Nomura, Won, H. - H. , Khera, A. V. , Takeuchi, F. , Ito, K. , McCarthy, S. , Emdin, C. A. , Klarin, D. , Natarajan, P. , Zekavat, S. M. , Gupta, N. , Peloso, G. M. , Borecki, I. B. , Teslovich, T. M. , Asselta, R. , Duga, S. , Merlini, P. A. , Correa, A. , Kessler, T. , Wilson, J. G. , Bown, M. J. , Hall, A. S. , Braund, P. S. , Carey, D. J. , Murray, M. F. , H Kirchner, L. , Leader, J. B. , Lavage, D. R. , J Manus, N. , Hartze, D. N. , Samani, N. J. , Schunkert, H. , Marrugat, J. , Elosua, R. , McPherson, R. , Farrall, M. , Watkins, H. , Juang, J. - M. J. , Hsiung, C. A. , Lin, S. - Y. , Wang, J. - S. , Tada, H. , Kawashiri, M. - A. , Inazu, A. , Yamagishi, M. , Katsuya, T. , Nakashima, E. , Nakatochi, M. , Yamamoto, K. , Yokota, M. , Momozawa, Y. , Rotter, J. I. , Lander, E. S. , Rader, D. J. , Danesh, J. , Ardissino, D. , Gabriel, S. , Willer, C. J. , Abecasis, G. R. , Saleheen, D. , Kubo, M. , Kato, N. , Chen, Y. - D. Ida, Dewey, F. E. , and Kathiresan, S. , Protein-Truncating Variants at the Cholesteryl Ester Transfer Protein Gene and Risk for Coronary Heart Disease., Circ Res, vol. 121, no. 1, pp. 81-88, 2017.
M. Mitt, Kals, M. , Pärn, K. , Gabriel, S. B. , Lander, E. S. , Palotie, A. , Ripatti, S. , Morris, A. P. , Metspalu, A. , Esko, T. , Mägi, R. , and Palta, P. , Improved imputation accuracy of rare and low-frequency variants using population-specific high-coverage WGS-based imputation reference panel., Eur J Hum Genet, vol. 25, no. 7, pp. 869-876, 2017.
N. O. Stitziel, Khera, A. V. , Wang, X. , Bierhals, A. J. , A Vourakis, C. , Sperry, A. E. , Natarajan, P. , Klarin, D. , Emdin, C. A. , Zekavat, S. M. , Nomura, A. , Erdmann, J. , Schunkert, H. , Samani, N. J. , Kraus, W. E. , Shah, S. H. , Yu, B. , Boerwinkle, E. , Rader, D. J. , Gupta, N. , Frossard, P. M. , Rasheed, A. , Danesh, J. , Lander, E. S. , Gabriel, S. , Saleheen, D. , Musunuru, K. , and Kathiresan, S. , ANGPTL3 Deficiency and Protection Against Coronary Artery Disease., J Am Coll Cardiol, vol. 69, no. 16, pp. 2054-2063, 2017.
D. Saleheen, Natarajan, P. , Armean, I. M. , Zhao, W. , Rasheed, A. , Khetarpal, S. A. , Won, H. - H. , Karczewski, K. J. , O'Donnell-Luria, A. H. , Samocha, K. E. , Weisburd, B. , Gupta, N. , Zaidi, M. , Samuel, M. , Imran, A. , Abbas, S. , Majeed, F. , Ishaq, M. , Akhtar, S. , Trindade, K. , Mucksavage, M. , Qamar, N. , Zaman, K. Shah, Yaqoob, Z. , Saghir, T. , Rizvi, S. Nadeem Has, Memon, A. , Mallick, N. Hayyat, Ishaq, M. , Rasheed, S. Zahed, Memon, F. - U. - R. , Mahmood, K. , Ahmed, N. , Do, R. , Krauss, R. M. , MacArthur, D. G. , Gabriel, S. , Lander, E. S. , Daly, M. J. , Frossard, P. , Danesh, J. , Rader, D. J. , and Kathiresan, S. , Human knockouts and phenotypic analysis in a cohort with a high rate of consanguinity., Nature, vol. 544, no. 7649, pp. 235-239, 2017.
O. Dudchenko, Batra, S. S. , Omer, A. D. , Nyquist, S. K. , Hoeger, M. , Durand, N. C. , Shamim, M. S. , Machol, I. , Lander, E. S. , Aiden, A. Presser, and Aiden, E. Lieberman, De novo assembly of the Aedes aegypti genome using Hi-C yields chromosome-length scaffolds., Science, vol. 356, no. 6333, pp. 92-95, 2017.
A. Ram Kim, Ulirsch, J. C. , Wilmes, S. , Unal, E. , Moraga, I. , Karakukcu, M. , Yuan, D. , Kazerounian, S. , Abdulhay, N. J. , King, D. S. , Gupta, N. , Gabriel, S. B. , Lander, E. S. , Patiroglu, T. , Ozcan, A. , Ozdemir, M. Akif, K Garcia, C. , Piehler, J. , Gazda, H. T. , Klein, D. E. , and Sankaran, V. G. , Functional Selectivity in Cytokine Signaling Revealed Through a Pathogenic EPO Mutation., Cell, vol. 168, no. 6, pp. 1053-1064.e15, 2017.
A. V. Khera, Won, H. - H. , Peloso, G. M. , O'Dushlaine, C. , Liu, D. , Stitziel, N. O. , Natarajan, P. , Nomura, A. , Emdin, C. A. , Gupta, N. , Borecki, I. B. , Asselta, R. , Duga, S. , Merlini, P. Angelica, Correa, A. , Kessler, T. , Wilson, J. G. , Bown, M. J. , Hall, A. S. , Braund, P. S. , Carey, D. J. , Murray, M. F. , H Kirchner, L. , Leader, J. B. , Lavage, D. R. , J Manus, N. , Hartzel, D. N. , Samani, N. J. , Schunkert, H. , Marrugat, J. , Elosua, R. , McPherson, R. , Farrall, M. , Watkins, H. , Lander, E. S. , Rader, D. J. , Danesh, J. , Ardissino, D. , Gabriel, S. , Willer, C. , Abecasis, G. R. , Saleheen, D. , Dewey, F. E. , and Kathiresan, S. , Association of Rare and Common Variation in the Lipoprotein Lipase Gene With Coronary Artery Disease., JAMA, vol. 317, no. 9, pp. 937-946, 2017.
T. Wang, Yu, H. , Hughes, N. W. , Liu, B. , Kendirli, A. , Klein, K. , Chen, W. W. , Lander, E. S. , and Sabatini, D. M. , Gene Essentiality Profiling Reveals Gene Networks and Synthetic Lethal Interactions with Oncogenic Ras., Cell, vol. 168, no. 5, pp. 890-903.e15, 2017.
S. R. Grossman, Zhang, X. , Wang, L. , Engreitz, J. , Melnikov, A. , Rogov, P. , Tewhey, R. , Isakova, A. , Deplancke, B. , Bernstein, B. E. , Mikkelsen, T. S. , and Lander, E. S. , Systematic dissection of genomic features determining transcription factor binding and enhancer function., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 114, no. 7, pp. E1291-E1300, 2017.
R. J. Park, Wang, T. , Koundakjian, D. , Hultquist, J. F. , Lamothe-Molina, P. , Monel, B. , Schumann, K. , Yu, H. , Krupzcak, K. M. , Garcia-Beltran, W. , Piechocka-Trocha, A. , Krogan, N. J. , Marson, A. , Sabatini, D. M. , Lander, E. S. , Hacohen, N. , and Walker, B. D. , A genome-wide CRISPR screen identifies a restricted set of HIV host dependency factors., Nat Genet, vol. 49, no. 2, pp. 193-203, 2017.
M. H. Guo, Nandakumar, S. K. , Ulirsch, J. C. , Zekavat, S. M. , Buenrostro, J. D. , Natarajan, P. , Salem, R. M. , Chiarle, R. , Mitt, M. , Kals, M. , Pärn, K. , Fischer, K. , Milani, L. , Mägi, R. , Palta, P. , Gabriel, S. B. , Metspalu, A. , Lander, E. S. , Kathiresan, S. , Hirschhorn, J. N. , Esko, T. , and Sankaran, V. G. , Comprehensive population-based genome sequencing provides insight into hematopoietic regulatory mechanisms., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 114, no. 3, pp. E327-E336, 2017.
C. A. Emdin, Khera, A. V. , Natarajan, P. , Klarin, D. , Won, H. - H. , Peloso, G. M. , Stitziel, N. O. , Nomura, A. , Zekavat, S. M. , Bick, A. G. , Gupta, N. , Asselta, R. , Duga, S. , Merlini, P. Angelica, Correa, A. , Kessler, T. , Wilson, J. G. , Bown, M. J. , Hall, A. S. , Braund, P. S. , Samani, N. J. , Schunkert, H. , Marrugat, J. , Elosua, R. , McPherson, R. , Farrall, M. , Watkins, H. , Willer, C. , Abecasis, G. R. , Felix, J. F. , Vasan, R. S. , Lander, E. , Rader, D. J. , Danesh, J. , Ardissino, D. , Gabriel, S. , Saleheen, D. , and Kathiresan, S. , Phenotypic Characterization of Genetically Lowered Human Lipoprotein(a) Levels., J Am Coll Cardiol, vol. 68, no. 25, pp. 2761-2772, 2016.
A. Dixit, Parnas, O. , Li, B. , Chen, J. , Fulco, C. P. , Jerby-Arnon, L. , Marjanovic, N. D. , Dionne, D. , Burks, T. , Raychowdhury, R. , Adamson, B. , Norman, T. M. , Lander, E. S. , Weissman, J. S. , Friedman, N. , and Regev, A. , Perturb-Seq: Dissecting Molecular Circuits with Scalable Single-Cell RNA Profiling of Pooled Genetic Screens., Cell, vol. 167, no. 7, pp. 1853-1866.e17, 2016.
C. P. Fulco, Munschauer, M. , Anyoha, R. , Munson, G. , Grossman, S. R. , Perez, E. M. , Kane, M. , Cleary, B. , Lander, E. S. , and Engreitz, J. M. , Systematic mapping of functional enhancer-promoter connections with CRISPR interference., Science, vol. 354, no. 6313, pp. 769-773, 2016.
O. O. Abudayyeh, Gootenberg, J. S. , Konermann, S. , Joung, J. , Slaymaker, I. M. , Cox, D. B. T. , Shmakov, S. , Makarova, K. S. , Semenova, E. , Minakhin, L. , Severinov, K. , Regev, A. , Lander, E. S. , Koonin, E. V. , and Zhang, F. , C2c2 is a single-component programmable RNA-guided RNA-targeting CRISPR effector., Science, vol. 353, no. 6299, p. aaf5573, 2016.
C. Fuchsberger, Flannick, J. , Teslovich, T. M. , Mahajan, A. , Agarwala, V. , Gaulton, K. J. , Ma, C. , Fontanillas, P. , Moutsianas, L. , McCarthy, D. J. , Rivas, M. A. , Perry, J. R. B. , Sim, X. , Blackwell, T. W. , Robertson, N. R. , N Rayner, W. , Cingolani, P. , Locke, A. E. , Tajes, J. Fernandez, Highland, H. M. , Dupuis, J. , Chines, P. S. , Lindgren, C. M. , Hartl, C. , Jackson, A. U. , Chen, H. , Huyghe, J. R. , van de Bunt, M. , Pearson, R. D. , Kumar, A. , Müller-Nurasyid, M. , Grarup, N. , Stringham, H. M. , Gamazon, E. R. , Lee, J. , Chen, Y. , Scott, R. A. , Below, J. E. , Chen, P. , Huang, J. , Go, M. Jin, Stitzel, M. L. , Pasko, D. , Parker, S. C. J. , Varga, T. V. , Green, T. , Beer, N. L. , Day-Williams, A. G. , Ferreira, T. , Fingerlin, T. , Horikoshi, M. , Hu, C. , Huh, I. , Ikram, M. Kamran, Kim, B. - J. , Kim, Y. , Kim, Y. Jin, Kwon, M. - S. , Lee, J. , Lee, S. , Lin, K. - H. , Maxwell, T. J. , Nagai, Y. , Wang, X. , Welch, R. P. , Yoon, J. , Zhang, W. , Barzilai, N. , Voight, B. F. , Han, B. - G. , Jenkinson, C. P. , Kuulasmaa, T. , Kuusisto, J. , Manning, A. , C Y Ng, M. , Palmer, N. D. , Balkau, B. , Stančáková, A. , Abboud, H. E. , Boeing, H. , Giedraitis, V. , Prabhakaran, D. , Gottesman, O. , Scott, J. , Carey, J. , Kwan, P. , Grant, G. , Smith, J. D. , Neale, B. M. , Purcell, S. , Butterworth, A. S. , Howson, J. M. M. , Lee, H. Man, Lu, Y. , Kwak, S. - H. , Zhao, W. , Danesh, J. , Lam, V. K. L. , Park, K. Soo, Saleheen, D. , So, W. Yee, Tam, C. H. T. , Afzal, U. , Aguilar, D. , Arya, R. , Aung, T. , Chan, E. , Navarro, C. , Cheng, C. - Y. , Palli, D. , Correa, A. , Curran, J. E. , Rybin, D. , Farook, V. S. , Fowler, S. P. , Freedman, B. I. , Griswold, M. , Hale, D. Esten, Hicks, P. J. , Khor, C. - C. , Kumar, S. , Lehne, B. , Thuillier, D. , Lim, W. Yen, Liu, J. , van der Schouw, Y. T. , Loh, M. , Musani, S. K. , Puppala, S. , Scott, W. R. , Yengo, L. , Tan, S. - T. , Taylor, H. A. , Thameem, F. , Wilson, G. , Wong, T. Yin, Njølstad, P. Rasmus, Levy, J. C. , Mangino, M. , Bonnycastle, L. L. , Schwarzmayr, T. , Fadista, J. , Surdulescu, G. L. , Herder, C. , Groves, C. J. , Wieland, T. , Bork-Jensen, J. , Brandslund, I. , Christensen, C. , Koistinen, H. A. , Doney, A. S. F. , Kinnunen, L. , Esko, T. , Farmer, A. J. , Hakaste, L. , Hodgkiss, D. , Kravic, J. , Lyssenko, V. , Hollensted, M. , Jørgensen, M. E. , Jørgensen, T. , Ladenvall, C. , Justesen, J. Marie, Käräjämäki, A. M. , Kriebel, J. , Rathmann, W. , Lannfelt, L. , Lauritzen, T. , Narisu, N. , Linneberg, A. , Melander, O. , Milani, L. , Neville, M. , Orho-Melander, M. , Qi, L. , Qi, Q. , Roden, M. , Rolandsson, O. , Swift, A. , Rosengren, A. H. , Stirrups, K. , Wood, A. R. , Mihailov, E. , Blancher, C. , Carneiro, M. O. , Maguire, J. , Poplin, R. , Shakir, K. , Fennell, T. , DePristo, M. , de Angelis, M. Hrabé, Deloukas, P. , Gjesing, A. P. , Jun, G. , Nilsson, P. , Murphy, J. , Onofrio, R. , Thorand, B. , Hansen, T. , Meisinger, C. , Hu, F. B. , Isomaa, B. , Karpe, F. , Liang, L. , Peters, A. , Huth, C. , O'Rahilly, S. P. , Palmer, C. N. A. , Pedersen, O. , Rauramaa, R. , Tuomilehto, J. , Salomaa, V. , Watanabe, R. M. , Syvänen, A. - C. , Bergman, R. N. , Bharadwaj, D. , Bottinger, E. P. , Cho, Y. Shin, Chandak, G. R. , Chan, J. C. N. , Chia, K. Seng, Daly, M. J. , Ebrahim, S. B. , Langenberg, C. , Elliott, P. , Jablonski, K. A. , Lehman, D. M. , Jia, W. , Ma, R. C. W. , Pollin, T. I. , Sandhu, M. , Tandon, N. , Froguel, P. , Barroso, I. , Teo, Y. Ying, Zeggini, E. , Loos, R. J. F. , Small, K. S. , Ried, J. S. , DeFronzo, R. A. , Grallert, H. , Glaser, B. , Metspalu, A. , Wareham, N. J. , Walker, M. , Banks, E. , Gieger, C. , Ingelsson, E. , Im, H. Kyung, Illig, T. , Franks, P. W. , Buck, G. , Trakalo, J. , Buck, D. , Prokopenko, I. , Mägi, R. , Lind, L. , Farjoun, Y. , Owen, K. R. , Gloyn, A. L. , Strauch, K. , Tuomi, T. , Kooner, J. Singh, Lee, J. - Y. , Park, T. , Donnelly, P. , Morris, A. D. , Hattersley, A. T. , Bowden, D. W. , Collins, F. S. , Atzmon, G. , Chambers, J. C. , Spector, T. D. , Laakso, M. , Strom, T. M. , Bell, G. I. , Blangero, J. , Duggirala, R. , E Tai, S. , McVean, G. , Hanis, C. L. , Wilson, J. G. , Seielstad, M. , Frayling, T. M. , Meigs, J. B. , Cox, N. J. , Sladek, R. , Lander, E. S. , Gabriel, S. , Burtt, N. P. , Mohlke, K. L. , Meitinger, T. , Groop, L. , Abecasis, G. , Florez, J. C. , Scott, L. J. , Morris, A. P. , Kang, H. Min, Boehnke, M. , Altshuler, D. , and McCarthy, M. I. , The genetic architecture of type 2 diabetes., Nature, vol. 536, no. 7614, pp. 41-7, 2016.
E. M. Darrow, Huntley, M. H. , Dudchenko, O. , Stamenova, E. K. , Durand, N. C. , Sun, Z. , Huang, S. - C. , Sanborn, A. L. , Machol, I. , Shamim, M. , Seberg, A. P. , Lander, E. S. , Chadwick, B. P. , and Aiden, E. Lieberman, Deletion of DXZ4 on the human inactive X chromosome alters higher-order genome architecture., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 113, no. 31, pp. E4504-12, 2016.
B. Blumenstiel, DeFelice, M. , Birsoy, O. , Bleyer, A. J. , Kmoch, S. , Carter, T. A. , Gnirke, A. , Kidd, K. , Rehm, H. L. , Ronco, L. , Lander, E. S. , Gabriel, S. , and Lennon, N. J. , Development and Validation of a Mass Spectrometry-Based Assay for the Molecular Diagnosis of Mucin-1 Kidney Disease., J Mol Diagn, vol. 18, no. 4, pp. 566-71, 2016.
N. C. Durand, Robinson, J. T. , Shamim, M. S. , Machol, I. , Mesirov, J. P. , Lander, E. S. , and Aiden, E. Lieberman, Juicebox Provides a Visualization System for Hi-C Contact Maps with Unlimited Zoom., Cell Syst, vol. 3, no. 1, pp. 99-101, 2016.
N. C. Durand, Shamim, M. S. , Machol, I. , Rao, S. S. P. , Huntley, M. H. , Lander, E. S. , and Aiden, E. Lieberman, Juicer Provides a One-Click System for Analyzing Loop-Resolution Hi-C Experiments., Cell Syst, vol. 3, no. 1, pp. 95-8, 2016.
M. Yassour, Vatanen, T. , Siljander, H. , Hämäläinen, A. - M. , Härkönen, T. , Ryhänen, S. J. , Franzosa, E. A. , Vlamakis, H. , Huttenhower, C. , Gevers, D. , Lander, E. S. , Knip, M. , and Xavier, R. J. , Natural history of the infant gut microbiome and impact of antibiotic treatment on bacterial strain diversity and stability., Sci Transl Med, vol. 8, no. 343, p. 343ra81, 2016.
A. V. Khera, Won, H. - H. , Peloso, G. M. , Lawson, K. S. , Bartz, T. M. , Deng, X. , van Leeuwen, E. M. , Natarajan, P. , Emdin, C. A. , Bick, A. G. , Morrison, A. C. , Brody, J. A. , Gupta, N. , Nomura, A. , Kessler, T. , Duga, S. , Bis, J. C. , van Duijn, C. M. , L Cupples, A. , Psaty, B. , Rader, D. J. , Danesh, J. , Schunkert, H. , McPherson, R. , Farrall, M. , Watkins, H. , Lander, E. , Wilson, J. G. , Correa, A. , Boerwinkle, E. , Merlini, P. Angelica, Ardissino, D. , Saleheen, D. , Gabriel, S. , and Kathiresan, S. , Diagnostic Yield and Clinical Utility of Sequencing Familial Hypercholesterolemia Genes in Patients With Severe Hypercholesterolemia., J Am Coll Cardiol, vol. 67, no. 22, pp. 2578-89, 2016.
R. Tewhey, Kotliar, D. , Park, D. S. , Liu, B. , Winnicki, S. , Reilly, S. K. , Andersen, K. G. , Mikkelsen, T. S. , Lander, E. S. , Schaffner, S. F. , and Sabeti, P. C. , Direct Identification of Hundreds of Expression-Modulating Variants using a Multiplexed Reporter Assay., Cell, vol. 165, no. 6, pp. 1519-29, 2016.
J. A. Burger, Landau, D. A. , Taylor-Weiner, A. , Bozic, I. , Zhang, H. , Sarosiek, K. , Wang, L. , Stewart, C. , Fan, J. , Hoellenriegel, J. , Sivina, M. , Dubuc, A. M. , Fraser, C. , Han, Y. , Li, S. , Livak, K. J. , Zou, L. , Wan, Y. , Konoplev, S. , Sougnez, C. , Brown, J. R. , Abruzzo, L. V. , Carter, S. L. , Keating, M. J. , Davids, M. S. , Wierda, W. G. , Cibulskis, K. , Zenz, T. , Werner, L. , Dal Cin, P. , Kharchencko, P. , Neuberg, D. , Kantarjian, H. , Lander, E. , Gabriel, S. , O'Brien, S. , Letai, A. , Weitz, D. A. , Nowak, M. A. , Getz, G. , and Wu, C. J. , Clonal evolution in patients with chronic lymphocytic leukaemia developing resistance to BTK inhibition., Nat Commun, vol. 7, p. 11589, 2016.
M. Giannakis, Mu, X. Jasmine, Shukla, S. A. , Qian, Z. Rong, Cohen, O. , Nishihara, R. , Bahl, S. , Cao, Y. , Amin-Mansour, A. , Yamauchi, M. , Sukawa, Y. , Stewart, C. , Rosenberg, M. , Mima, K. , Inamura, K. , Nosho, K. , Nowak, J. A. , Lawrence, M. S. , Giovannucci, E. L. , Chan, A. T. , Ng, K. , Meyerhardt, J. A. , Van Allen, E. M. , Getz, G. , Gabriel, S. B. , Lander, E. S. , Wu, C. J. , Fuchs, C. S. , Ogino, S. , and Garraway, L. A. , Genomic Correlates of Immune-Cell Infiltrates in Colorectal Carcinoma., Cell Rep, 2016.
T. Wang, Lander, E. S. , and Sabatini, D. M. , Single Guide RNA Library Design and Construction., Cold Spring Harb Protoc, vol. 2016, no. 3, p. pdb.prot090803, 2016.
T. Wang, Lander, E. S. , and Sabatini, D. M. , Viral Packaging and Cell Culture for CRISPR-Based Screens., Cold Spring Harb Protoc, vol. 2016, no. 3, p. pdb.prot090811, 2016.
M. Yassour, Lim, M. Young, Yun, H. Sun, Tickle, T. L. , Sung, J. , Song, Y. - M. , Lee, K. , Franzosa, E. A. , Morgan, X. C. , Gevers, D. , Lander, E. S. , Xavier, R. J. , Birren, B. W. , Ko, G. P. , and Huttenhower, C. , Sub-clinical detection of gut microbial biomarkers of obesity and type 2 diabetes., Genome Med, vol. 8, no. 1, p. 17, 2016.
E. S. Lander, The Heroes of CRISPR., Cell, vol. 164, no. 1-2, pp. 18-28, 2016.
S. Kasar, Kim, J. , Improgo, R. , Tiao, G. , Polak, P. , Haradhvala, N. , Lawrence, M. S. , Kiezun, A. , Fernandes, S. M. , Bahl, S. , Sougnez, C. , Gabriel, S. , Lander, E. S. , Kim, H. T. , Getz, G. , and Brown, J. R. , Whole-genome sequencing reveals activation-induced cytidine deaminase signatures during indolent chronic lymphocytic leukaemia evolution., Nat Commun, vol. 6, p. 8866, 2015.
T. Wang, Birsoy, K. , Hughes, N. W. , Krupczak, K. M. , Post, Y. , Wei, J. J. , Lander, E. S. , and Sabatini, D. M. , Identification and characterization of essential genes in the human genome., Science, vol. 350, no. 6264, pp. 1096-101, 2015.
P. K. Brastianos, Carter, S. L. , Santagata, S. , Cahill, D. P. , Taylor-Weiner, A. , Jones, R. T. , Van Allen, E. M. , Lawrence, M. S. , Horowitz, P. M. , Cibulskis, K. , Ligon, K. L. , Tabernero, J. , Seoane, J. , Martinez-Saez, E. , Curry, W. T. , Dunn, I. F. , Paek, S. Ha, Park, S. - H. , McKenna, A. , Chevalier, A. , Rosenberg, M. , Barker, F. G. , Gill, C. M. , Van Hummelen, P. , Thorner, A. R. , Johnson, B. E. , Hoang, M. P. , Choueiri, T. K. , Signoretti, S. , Sougnez, C. , Rabin, M. S. , Lin, N. U. , Winer, E. P. , Stemmer-Rachamimov, A. , Meyerson, M. , Garraway, L. , Gabriel, S. , Lander, E. S. , Beroukhim, R. , Batchelor, T. T. , Baselga, J. , Louis, D. N. , Getz, G. , and Hahn, W. C. , Genomic Characterization of Brain Metastases Reveals Branched Evolution and Potential Therapeutic Targets., Cancer Discov, vol. 5, no. 11, pp. 1164-77, 2015.
A. L. Sanborn, Rao, S. S. , Huang, S. C. , Durand, N. C. , Huntley, M. H. , Jewett, A. I. , Bochkov, I. D. , Chinnappan, D. , Cutkosky, A. , Li, J. , Geeting, K. P. , Gnirke, A. , Melnikov, A. , McKenna, D. , Stamenova, E. K. , Lander, E. S. , and Aiden, E. L. , Chromatin extrusion explains key features of loop and domain formation in wild-type and engineered genomes., Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015.
D. A. Landau, Tausch, E. , Taylor-Weiner, A. N. , Stewart, C. , Reiter, J. G. , Bahlo, J. , Kluth, S. , Bozic, I. , Lawrence, M. , Böttcher, S. , Carter, S. L. , Cibulskis, K. , Mertens, D. , Sougnez, C. L. , Rosenberg, M. , Hess, J. M. , Edelmann, J. , Kless, S. , Kneba, M. , Ritgen, M. , Fink, A. , Fischer, K. , Gabriel, S. , Lander, E. S. , Nowak, M. A. , Döhner, H. , Hallek, M. , Neuberg, D. , Getz, G. , Stilgenbauer, S. , and Wu, C. J. , Mutations driving CLL and their evolution in progression and relapse., Nature, vol. 526, no. 7574, pp. 525-30, 2015.
A. Kamburov, Lawrence, M. S. , Polak, P. , Leshchiner, I. , Lage, K. , Golub, T. R. , Lander, E. S. , and Getz, G. , Comprehensive assessment of cancer missense mutation clustering in protein structures., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 112, no. 40, pp. E5486-95, 2015.
M. D. Stachler, Taylor-Weiner, A. , Peng, S. , McKenna, A. , Agoston, A. T. , Odze, R. D. , Davison, J. M. , Nason, K. S. , Loda, M. , Leshchiner, I. , Stewart, C. , Stojanov, P. , Seepo, S. , Lawrence, M. S. , Ferrer-Torres, D. , Lin, J. , Chang, A. C. , Gabriel, S. B. , Lander, E. S. , Beer, D. G. , Getz, G. , Carter, S. L. , and Bass, A. J. , Paired exome analysis of Barrett's esophagus and adenocarcinoma., Nat Genet, vol. 47, no. 9, pp. 1047-55, 2015.
K. G. Andersen, B Shapiro, J. , Matranga, C. B. , Sealfon, R. , Lin, A. E. , Moses, L. M. , Folarin, O. A. , Goba, A. , Odia, I. , Ehiane, P. E. , Momoh, M. , England, E. M. , Winnicki, S. , Branco, L. M. , Gire, S. K. , Phelan, E. , Tariyal, R. , Tewhey, R. , Omoniwa, O. , Fullah, M. , Fonnie, R. , Fonnie, M. , Kanneh, L. , Jalloh, S. , Gbakie, M. , Saffa, S. , Karbo, K. , Gladden, A. D. , Qu, J. , Stremlau, M. , Nekoui, M. , Finucane, H. K. , Tabrizi, S. , Vitti, J. J. , Birren, B. , Fitzgerald, M. , McCowan, C. , Ireland, A. , Berlin, A. M. , Bochicchio, J. , Tazon-Vega, B. , Lennon, N. J. , Ryan, E. M. , Bjornson, Z. , Milner, D. A. , Lukens, A. K. , Broodie, N. , Rowland, M. , Heinrich, M. , Akdag, M. , Schieffelin, J. S. , Levy, D. , Akpan, H. , Bausch, D. G. , Rubins, K. , McCormick, J. B. , Lander, E. S. , Günther, S. , Hensley, L. , Okogbenin, S. , Schaffner, S. F. , Okokhere, P. O. , S Khan, H. , Grant, D. S. , Akpede, G. O. , Asogun, D. A. , Gnirke, A. , Levin, J. Z. , Happi, C. T. , Garry, R. F. , and Sabeti, P. C. , Clinical Sequencing Uncovers Origins and Evolution of Lassa Virus., Cell, vol. 162, no. 4, pp. 738-50, 2015.
D. Cacchiarelli, Trapnell, C. , Ziller, M. J. , Soumillon, M. , Cesana, M. , Karnik, R. , Donaghey, J. , Smith, Z. D. , Ratanasirintrawoot, S. , Zhang, X. , Sui, S. J. Ho, Wu, Z. , Akopian, V. , Gifford, C. A. , Doench, J. , Rinn, J. L. , Daley, G. Q. , Meissner, A. , Lander, E. S. , and Mikkelsen, T. S. , Integrative Analyses of Human Reprogramming Reveal Dynamic Nature of Induced Pluripotency., Cell, vol. 162, no. 2, pp. 412-24, 2015.
E. S. Lander, Brave New Genome., N Engl J Med, vol. 373, no. 1, pp. 5-8, 2015.
C. A. McHugh, Chen, C. - K. , Chow, A. , Surka, C. F. , Tran, C. , McDonel, P. , Pandya-Jones, A. , Blanco, M. , Burghard, C. , Moradian, A. , Sweredoski, M. J. , Shishkin, A. A. , Su, J. , Lander, E. S. , Hess, S. , Plath, K. , and Guttman, M. , The Xist lncRNA interacts directly with SHARP to silence transcription through HDAC3., Nature, vol. 521, no. 7551, pp. 232-6, 2015.
H. Kim, Zheng, S. , Amini, S. S. , Virk, S. M. , Mikkelsen, T. , Brat, D. J. , Grimsby, J. , Sougnez, C. , Muller, F. , Hu, J. , Sloan, A. E. , Cohen, M. L. , Van Meir, E. G. , Scarpace, L. , Laird, P. W. , Weinstein, J. N. , Lander, E. S. , Gabriel, S. , Getz, G. , Meyerson, M. , Chin, L. , Barnholtz-Sloan, J. S. , and Verhaak, R. G. W. , Whole-genome and multisector exome sequencing of primary and post-treatment glioblastoma reveals patterns of tumor evolution., Genome Res, vol. 25, no. 3, pp. 316-27, 2015.
R. Do, Stitziel, N. O. , Won, H. - H. , Jørgensen, A. Berg, Duga, S. , Merlini, P. Angelica, Kiezun, A. , Farrall, M. , Goel, A. , Zuk, O. , Guella, I. , Asselta, R. , Lange, L. A. , Peloso, G. M. , Auer, P. L. , Girelli, D. , Martinelli, N. , Farlow, D. N. , DePristo, M. A. , Roberts, R. , Stewart, A. F. R. , Saleheen, D. , Danesh, J. , Epstein, S. E. , Sivapalaratnam, S. , G Hovingh, K. , Kastelein, J. J. , Samani, N. J. , Schunkert, H. , Erdmann, J. , Shah, S. H. , Kraus, W. E. , Davies, R. , Nikpay, M. , Johansen, C. T. , Wang, J. , Hegele, R. A. , Hechter, E. , März, W. , Kleber, M. E. , Huang, J. , Johnson, A. D. , Li, M. , Burke, G. L. , Gross, M. , Liu, Y. , Assimes, T. L. , Heiss, G. , Lange, E. M. , Folsom, A. R. , Taylor, H. A. , Olivieri, O. , Hamsten, A. , Clarke, R. , Reilly, D. F. , Yin, W. , Rivas, M. A. , Donnelly, P. , Rossouw, J. E. , Psaty, B. M. , Herrington, D. M. , Wilson, J. G. , Rich, S. S. , Bamshad, M. J. , Tracy, R. P. , L Cupples, A. , Rader, D. J. , Reilly, M. P. , Spertus, J. A. , Cresci, S. , Hartiala, J. , Tang, W. H. Wilson, Hazen, S. L. , Allayee, H. , Reiner, A. P. , Carlson, C. S. , Kooperberg, C. , Jackson, R. D. , Boerwinkle, E. , Lander, E. S. , Schwartz, S. M. , Siscovick, D. S. , McPherson, R. , Tybjaerg-Hansen, A. , Abecasis, G. R. , Watkins, H. , Nickerson, D. A. , Ardissino, D. , Sunyaev, S. R. , O'Donnell, C. J. , Altshuler, D. , Gabriel, S. , and Kathiresan, S. , Exome sequencing identifies rare LDLR and APOA5 alleles conferring risk for myocardial infarction., Nature, vol. 518, no. 7537, pp. 102-6, 2015.
A. S. Thormaehlen, Schuberth, C. , Won, H. - H. , Blattmann, P. , Joggerst-Thomalla, B. , Theiss, S. , Asselta, R. , Duga, S. , Merlini, P. Angelica, Ardissino, D. , Lander, E. S. , Gabriel, S. , Rader, D. J. , Peloso, G. M. , Pepperkok, R. , Kathiresan, S. , and Runz, H. , Systematic cell-based phenotyping of missense alleles empowers rare variant association studies: a case for LDLR and myocardial infarction., PLoS Genet, vol. 11, no. 2, p. e1004855, 2015.
N. Tonomura, Elvers, I. , Thomas, R. , Megquier, K. , Turner-Maier, J. , Howald, C. , Sarver, A. L. , Swofford, R. , Frantz, A. M. , Ito, D. , Mauceli, E. , Arendt, M. , Noh, H. Ji, Koltookian, M. , Biagi, T. , Fryc, S. , Williams, C. , Avery, A. C. , Kim, J. - H. , Barber, L. , Burgess, K. , Lander, E. S. , Karlsson, E. K. , Azuma, C. , Modiano, J. F. , Breen, M. , and Lindblad-Toh, K. , Genome-wide association study identifies shared risk loci common to two malignancies in golden retrievers., PLoS Genet, vol. 11, no. 2, p. e1004922, 2015.
G. Genovese, Kähler, A. K. , Handsaker, R. E. , Lindberg, J. , Rose, S. A. , Bakhoum, S. F. , Chambert, K. , Mick, E. , Neale, B. M. , Fromer, M. , Purcell, S. M. , Svantesson, O. , Landén, M. , Höglund, M. , Lehmann, S. , Gabriel, S. B. , Moran, J. L. , Lander, E. S. , Sullivan, P. F. , Sklar, P. , Gronberg, H. , Hultman, C. M. , and McCarroll, S. A. , Clonal hematopoiesis and blood-cancer risk inferred from blood DNA sequence., N Engl J Med, vol. 371, no. 26, pp. 2477-87, 2014.
J. A. Perry, Kiezun, A. , Tonzi, P. , Van Allen, E. M. , Carter, S. L. , Baca, S. C. , Cowley, G. S. , Bhatt, A. S. , Rheinbay, E. , Pedamallu, C. Sekhar, Helman, E. , Taylor-Weiner, A. , McKenna, A. , DeLuca, D. S. , Lawrence, M. S. , Ambrogio, L. , Sougnez, C. , Sivachenko, A. , Walensky, L. D. , Wagle, N. , Mora, J. , de Torres, C. , Lavarino, C. , Aguiar, S. Dos Santos, Yunes, J. Andres, Brandalise, S. Regina, Mercado-Celis, G. Elisa, Melendez-Zajgla, J. , Cárdenas-Cardós, R. , Velasco-Hidalgo, L. , Roberts, C. W. M. , Garraway, L. A. , Rodriguez-Galindo, C. , Gabriel, S. B. , Lander, E. S. , Golub, T. R. , Orkin, S. H. , Getz, G. , and Janeway, K. A. , Complementary genomic approaches highlight the PI3K/mTOR pathway as a common vulnerability in osteosarcoma., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 111, no. 51, pp. E5564-73, 2014.
S. S. P. Rao, Huntley, M. H. , Durand, N. C. , Stamenova, E. K. , Bochkov, I. D. , Robinson, J. T. , Sanborn, A. L. , Machol, I. , Omer, A. D. , Lander, E. S. , and Aiden, E. Lieberman, A 3D map of the human genome at kilobase resolution reveals principles of chromatin looping., Cell, vol. 159, no. 7, pp. 1665-80, 2014.
D. Golan, Lander, E. S. , and Rosset, S. , Measuring missing heritability: inferring the contribution of common variants., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 111, no. 49, pp. E5272-81, 2014.
D. A. Landau, Clement, K. , Ziller, M. J. , Boyle, P. , Fan, J. , Gu, H. , Stevenson, K. , Sougnez, C. , Wang, L. , Li, S. , Kotliar, D. , Zhang, W. , Ghandi, M. , Garraway, L. , Fernandes, S. M. , Livak, K. J. , Gabriel, S. , Gnirke, A. , Lander, E. S. , Brown, J. R. , Neuberg, D. , Kharchenko, P. V. , Hacohen, N. , Getz, G. , Meissner, A. , and Wu, C. J. , Locally disordered methylation forms the basis of intratumor methylome variation in chronic lymphocytic leukemia., Cancer Cell, vol. 26, no. 6, pp. 813-25, 2014.
M. Giannakis, Hodis, E. , Mu, X. Jasmine, Yamauchi, M. , Rosenbluh, J. , Cibulskis, K. , Saksena, G. , Lawrence, M. S. , Qian, Z. Rong, Nishihara, R. , Van Allen, E. M. , Hahn, W. C. , Gabriel, S. B. , Lander, E. S. , Getz, G. , Ogino, S. , Fuchs, C. S. , and Garraway, L. A. , RNF43 is frequently mutated in colorectal and endometrial cancers., Nat Genet, vol. 46, no. 12, pp. 1264-6, 2014.
N. I. Weisenfeld, Yin, S. , Sharpe, T. , Lau, B. , Hegarty, R. , Holmes, L. , Sogoloff, B. , Tabbaa, D. , Williams, L. , Russ, C. , Nusbaum, C. , Lander, E. S. , MacCallum, I. , and Jaffe, D. B. , Comprehensive variation discovery in single human genomes., Nat Genet, vol. 46, no. 12, pp. 1350-5, 2014.
S. Schwartz, Bernstein, D. A. , Mumbach, M. R. , Jovanovic, M. , Herbst, R. H. , León-Ricardo, B. X. , Engreitz, J. M. , Guttman, M. , Satija, R. , Lander, E. S. , Fink, G. , and Regev, A. , Transcriptome-wide mapping reveals widespread dynamic-regulated pseudouridylation of ncRNA and mRNA., Cell, vol. 159, no. 1, pp. 148-62, 2014.
J. M. Engreitz, Sirokman, K. , McDonel, P. , Shishkin, A. A. , Surka, C. , Russell, P. , Grossman, S. R. , Chow, A. Y. , Guttman, M. , and Lander, E. S. , RNA-RNA interactions enable specific targeting of noncoding RNAs to nascent Pre-mRNAs and chromatin sites., Cell, vol. 159, no. 1, pp. 188-99, 2014.
D. Brawand, Wagner, C. E. , Li, Y. I. , Malinsky, M. , Keller, I. , Fan, S. , Simakov, O. , Ng, A. Y. , Lim, Z. Wei, Bezault, E. , Turner-Maier, J. , Johnson, J. , Alcazar, R. , Noh, H. Ji, Russell, P. , Aken, B. , Alföldi, J. , Amemiya, C. , Azzouzi, N. , Baroiller, J. - F. , Barloy-Hubler, F. , Berlin, A. , Bloomquist, R. , Carleton, K. L. , Conte, M. A. , D'Cotta, H. , Eshel, O. , Gaffney, L. , Galibert, F. , Gante, H. F. , Gnerre, S. , Greuter, L. , Guyon, R. , Haddad, N. S. , Haerty, W. , Harris, R. M. , Hofmann, H. A. , Hourlier, T. , Hulata, G. , Jaffe, D. B. , Lara, M. , Lee, A. P. , MacCallum, I. , Mwaiko, S. , Nikaido, M. , Nishihara, H. , Ozouf-Costaz, C. , Penman, D. J. , Przybylski, D. , Rakotomanga, M. , Renn, S. C. P. , Ribeiro, F. J. , Ron, M. , Salzburger, W. , Sanchez-Pulido, L. , M Santos, E. , Searle, S. , Sharpe, T. , Swofford, R. , Tan, F. J. , Williams, L. , Young, S. , Yin, S. , Okada, N. , Kocher, T. D. , Miska, E. A. , Lander, E. S. , Venkatesh, B. , Fernald, R. D. , Meyer, A. , Ponting, C. P. , J Streelman, T. , Lindblad-Toh, K. , Seehausen, O. , and di Palma, F. , The genomic substrate for adaptive radiation in African cichlid fish., Nature, vol. 513, no. 7518, pp. 375-81, 2014.
S. K. Gire, Goba, A. , Andersen, K. G. , Sealfon, R. S. G. , Park, D. J. , Kanneh, L. , Jalloh, S. , Momoh, M. , Fullah, M. , Dudas, G. , Wohl, S. , Moses, L. M. , Yozwiak, N. L. , Winnicki, S. , Matranga, C. B. , Malboeuf, C. M. , Qu, J. , Gladden, A. D. , Schaffner, S. F. , Yang, X. , Jiang, P. - P. , Nekoui, M. , Colubri, A. , Coomber, M. Ruth, Fonnie, M. , Moigboi, A. , Gbakie, M. , Kamara, F. K. , Tucker, V. , Konuwa, E. , Saffa, S. , Sellu, J. , Jalloh, A. Azziz, Kovoma, A. , Koninga, J. , Mustapha, I. , Kargbo, K. , Foday, M. , Yillah, M. , Kanneh, F. , Robert, W. , Massally, J. L. B. , Chapman, S. B. , Bochicchio, J. , Murphy, C. , Nusbaum, C. , Young, S. , Birren, B. W. , Grant, D. S. , Scheiffelin, J. S. , Lander, E. S. , Happi, C. , Gevao, S. M. , Gnirke, A. , Rambaut, A. , Garry, R. F. , S Khan, H. , and Sabeti, P. C. , Genomic surveillance elucidates Ebola virus origin and transmission during the 2014 outbreak., Science, vol. 345, no. 6202, pp. 1369-72, 2014.
M. Carneiro, Rubin, C. - J. , di Palma, F. , Albert, F. W. , Alföldi, J. , Barrio, A. Martinez, Pielberg, G. , Rafati, N. , Sayyab, S. , Turner-Maier, J. , Younis, S. , Afonso, S. , Aken, B. , Alves, J. M. , Barrell, D. , Bolet, G. , Boucher, S. , Burbano, H. A. , Campos, R. , Chang, J. L. , Duranthon, V. , Fontanesi, L. , Garreau, H. , Heiman, D. , Johnson, J. , Mage, R. G. , Peng, Z. , Queney, G. , Rogel-Gaillard, C. , Ruffier, M. , Searle, S. , Villafuerte, R. , Xiong, A. , Young, S. , Forsberg-Nilsson, K. , Good, J. M. , Lander, E. S. , Ferrand, N. , Lindblad-Toh, K. , and Andersson, L. , Rabbit genome analysis reveals a polygenic basis for phenotypic change during domestication., Science, vol. 345, no. 6200, pp. 1074-9, 2014.
L. Wang, Shalek, A. K. , Lawrence, M. , Ding, R. , Gaublomme, J. T. , Pochet, N. , Stojanov, P. , Sougnez, C. , Shukla, S. A. , Stevenson, K. E. , Zhang, W. , Wong, J. , Sievers, Q. L. , MacDonald, B. T. , Vartanov, A. R. , Goldstein, N. R. , Neuberg, D. , He, X. , Lander, E. , Hacohen, N. , Regev, A. , Getz, G. , Brown, J. R. , Park, H. , and Wu, C. J. , Somatic mutation as a mechanism of Wnt/β-catenin pathway activation in CLL., Blood, vol. 124, no. 7, pp. 1089-98, 2014.
M. Rajasagi, Shukla, S. A. , Fritsch, E. F. , Keskin, D. B. , DeLuca, D. , Carmona, E. , Zhang, W. , Sougnez, C. , Cibulskis, K. , Sidney, J. , Stevenson, K. , Ritz, J. , Neuberg, D. , Brusic, V. , Gabriel, S. , Lander, E. S. , Getz, G. , Hacohen, N. , and Wu, C. J. , Systematic identification of personal tumor-specific neoantigens in chronic lymphocytic leukemia., Blood, vol. 124, no. 3, pp. 453-62, 2014.
S. Schwartz, Mumbach, M. R. , Jovanovic, M. , Wang, T. , Maciag, K. , G Bushkin, G. , Mertins, P. , Ter-Ovanesyan, D. , Habib, N. , Cacchiarelli, D. , Sanjana, N. E. , Freinkman, E. , Pacold, M. E. , Satija, R. , Mikkelsen, T. S. , Hacohen, N. , Zhang, F. , Carr, S. A. , Lander, E. S. , and Regev, A. , Perturbation of m6A writers reveals two distinct classes of mRNA methylation at internal and 5' sites., Cell Rep, vol. 8, no. 1, pp. 284-96, 2014.
L. S. Ludwig, Gazda, H. T. , Eng, J. C. , Eichhorn, S. W. , Thiru, P. , Ghazvinian, R. , George, T. I. , Gotlib, J. R. , Beggs, A. H. , Sieff, C. A. , Lodish, H. F. , Lander, E. S. , and Sankaran, V. G. , Altered translation of GATA1 in Diamond-Blackfan anemia., Nat Med, vol. 20, no. 7, pp. 748-53, 2014.
E. M. Van Allen, Wagle, N. , Stojanov, P. , Perrin, D. L. , Cibulskis, K. , Marlow, S. , Jané-Valbuena, J. , Friedrich, D. C. , Kryukov, G. , Carter, S. L. , McKenna, A. , Sivachenko, A. , Rosenberg, M. , Kiezun, A. , Voet, D. , Lawrence, M. , Lichtenstein, L. T. , Gentry, J. G. , Huang, F. W. , Fostel, J. , Farlow, D. , Barbie, D. , Gandhi, L. , Lander, E. S. , Gray, S. W. , Joffe, S. , Janne, P. , Garber, J. , MacConaill, L. , Lindeman, N. , Rollins, B. , Kantoff, P. , Fisher, S. A. , Gabriel, S. , Getz, G. , and Garraway, L. A. , Whole-exome sequencing and clinical interpretation of formalin-fixed, paraffin-embedded tumor samples to guide precision cancer medicine., Nat Med, vol. 20, no. 6, pp. 682-8, 2014.
N. Wagle, Grabiner, B. C. , Van Allen, E. M. , Hodis, E. , Jacobus, S. , Supko, J. G. , Stewart, M. , Choueiri, T. K. , Gandhi, L. , Cleary, J. M. , Elfiky, A. A. , Taplin, M. Ellen, Stack, E. C. , Signoretti, S. , Loda, M. , Shapiro, G. I. , Sabatini, D. M. , Lander, E. S. , Gabriel, S. B. , Kantoff, P. W. , Garraway, L. A. , and Rosenberg, J. E. , Activating mTOR mutations in a patient with an extraordinary response on a phase I trial of everolimus and pazopanib., Cancer Discov, vol. 4, no. 5, pp. 546-53, 2014.
S. M. Purcell, Moran, J. L. , Fromer, M. , Ruderfer, D. , Solovieff, N. , Roussos, P. , O'Dushlaine, C. , Chambert, K. , Bergen, S. E. , Kähler, A. , Duncan, L. , Stahl, E. , Genovese, G. , Fernández, E. , Collins, M. O. , Komiyama, N. H. , Choudhary, J. S. , Magnusson, P. K. E. , Banks, E. , Shakir, K. , Garimella, K. , Fennell, T. , DePristo, M. , Grant, S. G. N. , Haggarty, S. J. , Gabriel, S. , Scolnick, E. M. , Lander, E. S. , Hultman, C. M. , Sullivan, P. F. , McCarroll, S. A. , and Sklar, P. , A polygenic burden of rare disruptive mutations in schizophrenia., Nature, vol. 506, no. 7487, pp. 185-90, 2014.
E. Hacisuleyman, Goff, L. A. , Trapnell, C. , Williams, A. , Henao-Mejia, J. , Sun, L. , McClanahan, P. , Hendrickson, D. G. , Sauvageau, M. , Kelley, D. R. , Morse, M. , Engreitz, J. , Lander, E. S. , Guttman, M. , Lodish, H. F. , Flavell, R. , Raj, A. , and Rinn, J. L. , Topological organization of multichromosomal regions by the long intergenic noncoding RNA Firre., Nat Struct Mol Biol, vol. 21, no. 2, pp. 198-206, 2014.
O. Zuk, Schaffner, S. F. , Samocha, K. , Do, R. , Hechter, E. , Kathiresan, S. , Daly, M. J. , Neale, B. M. , Sunyaev, S. R. , and Lander, E. S. , Searching for missing heritability: designing rare variant association studies., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 111, no. 4, pp. E455-64, 2014.
M. S. Lawrence, Stojanov, P. , Mermel, C. H. , Robinson, J. T. , Garraway, L. A. , Golub, T. R. , Meyerson, M. , Gabriel, S. B. , Lander, E. S. , and Getz, G. , Discovery and saturation analysis of cancer genes across 21 tumour types., Nature, vol. 505, no. 7484, pp. 495-501, 2014.
T. Wang, Wei, J. J. , Sabatini, D. M. , and Lander, E. S. , Genetic screens in human cells using the CRISPR-Cas9 system., Science, vol. 343, no. 6166, pp. 80-4, 2014.
M. P. Hoeppner, Lundquist, A. , Pirun, M. , Meadows, J. R. S. , Zamani, N. , Johnson, J. , Sundström, G. , Cook, A. , FitzGerald, M. G. , Swofford, R. , Mauceli, E. , Moghadam, B. Torabi, Greka, A. , Alföldi, J. , Abouelleil, A. , Aftuck, L. , Bessette, D. , Berlin, A. , Brown, A. , Gearin, G. , Lui, A. , J Macdonald, P. , Priest, M. , Shea, T. , Turner-Maier, J. , Zimmer, A. , Lander, E. S. , di Palma, F. , Lindblad-Toh, K. , and Grabherr, M. G. , An improved canine genome and a comprehensive catalogue of coding genes and non-coding transcripts., PLoS One, vol. 9, no. 3, p. e91172, 2014.
J. Cho, Bass, A. J. , Lawrence, M. S. , Cibulskis, K. , Cho, A. , Lee, S. - N. , Yamauchi, M. , Wagle, N. , Pochanard, P. , Kim, N. , Park, A. Kj, Won, J. , Hur, H. - S. , Greulich, H. , Ogino, S. , Sougnez, C. , Voet, D. , Tabernero, J. , Jimenez, J. , Baselga, J. , Gabriel, S. B. , Lander, E. S. , Getz, G. , Eck, M. J. , Park, W. - Y. , and Meyerson, M. , Colon cancer-derived oncogenic EGFR G724S mutant identified by whole genome sequence analysis is dependent on asymmetric dimerization and sensitive to cetuximab., Mol Cancer, vol. 13, p. 141, 2014.
E. K. Karlsson, Sigurdsson, S. , Ivansson, E. , Thomas, R. , Elvers, I. , Wright, J. , Howald, C. , Tonomura, N. , Perloski, M. , Swofford, R. , Biagi, T. , Fryc, S. , Anderson, N. , Courtay-Cahen, C. , Youell, L. , Ricketts, S. L. , Mandlebaum, S. , Rivera, P. , von Euler, H. , Kisseberth, W. C. , London, C. A. , Lander, E. S. , Couto, G. , Comstock, K. , Starkey, M. P. , Modiano, J. F. , Breen, M. , and Lindblad-Toh, K. , Genome-wide analyses implicate 33 loci in heritable dog osteosarcoma, including regulatory variants near CDKN2A/B., Genome Biol, vol. 14, no. 12, p. R132, 2013.
S. Schwartz, Agarwala, S. D. , Mumbach, M. R. , Jovanovic, M. , Mertins, P. , Shishkin, A. , Tabach, Y. , Mikkelsen, T. S. , Satija, R. , Ruvkun, G. , Carr, S. A. , Lander, E. S. , Fink, G. R. , and Regev, A. , High-resolution mapping reveals a conserved, widespread, dynamic mRNA methylation program in yeast meiosis., Cell, vol. 155, no. 6, pp. 1409-21, 2013.
C. W. Brennan, Verhaak, R. G. W. , McKenna, A. , Campos, B. , Noushmehr, H. , Salama, S. R. , Zheng, S. , Chakravarty, D. , J Sanborn, Z. , Berman, S. H. , Beroukhim, R. , Bernard, B. , Wu, C. - J. , Genovese, G. , Shmulevich, I. , Barnholtz-Sloan, J. , Zou, L. , Vegesna, R. , Shukla, S. A. , Ciriello, G. , Yung, W. K. , Zhang, W. , Sougnez, C. , Mikkelsen, T. , Aldape, K. , Bigner, D. D. , Van Meir, E. G. , Prados, M. , Sloan, A. , Black, K. L. , Eschbacher, J. , Finocchiaro, G. , Friedman, W. , Andrews, D. W. , Guha, A. , Iacocca, M. , O'Neill, B. P. , Foltz, G. , Myers, J. , Weisenberger, D. J. , Penny, R. , Kucherlapati, R. , Perou, C. M. , D Hayes, N. , Gibbs, R. , Marra, M. , Mills, G. B. , Lander, E. , Spellman, P. , Wilson, R. , Sander, C. , Weinstein, J. , Meyerson, M. , Gabriel, S. , Laird, P. W. , Haussler, D. , Getz, G. , and Chin, L. , The somatic genomic landscape of glioblastoma., Cell, vol. 155, no. 2, pp. 462-77, 2013.
J. M. Engreitz, Pandya-Jones, A. , McDonel, P. , Shishkin, A. , Sirokman, K. , Surka, C. , Kadri, S. , Xing, J. , Goren, A. , Lander, E. S. , Plath, K. , and Guttman, M. , The Xist lncRNA exploits three-dimensional genome architecture to spread across the X chromosome., Science, vol. 341, no. 6147, p. 1237973, 2013.
M. S. Lawrence, Stojanov, P. , Polak, P. , Kryukov, G. V. , Cibulskis, K. , Sivachenko, A. , Carter, S. L. , Stewart, C. , Mermel, C. H. , Roberts, S. A. , Kiezun, A. , Hammerman, P. S. , McKenna, A. , Drier, Y. , Zou, L. , Ramos, A. H. , Pugh, T. J. , Stransky, N. , Helman, E. , Kim, J. , Sougnez, C. , Ambrogio, L. , Nickerson, E. , Shefler, E. , Cortés, M. L. , Auclair, D. , Saksena, G. , Voet, D. , Noble, M. , Dicara, D. , Lin, P. , Lichtenstein, L. , Heiman, D. I. , Fennell, T. , Imielinski, M. , Hernandez, B. , Hodis, E. , Baca, S. , Dulak, A. M. , Lohr, J. , Landau, D. - A. , Wu, C. J. , Melendez-Zajgla, J. , Hidalgo-Miranda, A. , Koren, A. , McCarroll, S. A. , Mora, J. , Lee, R. S. , Crompton, B. , Onofrio, R. , Parkin, M. , Winckler, W. , Ardlie, K. , Gabriel, S. B. , Roberts, C. W. M. , Biegel, J. A. , Stegmaier, K. , Bass, A. J. , Garraway, L. A. , Meyerson, M. , Golub, T. R. , Gordenin, D. A. , Sunyaev, S. , Lander, E. S. , and Getz, G. , Mutational heterogeneity in cancer and the search for new cancer-associated genes., Nature, vol. 499, no. 7457, pp. 214-8, 2013.
M. Guttman, Russell, P. , Ingolia, N. T. , Weissman, J. S. , and Lander, E. S. , Ribosome profiling provides evidence that large noncoding RNAs do not encode proteins., Cell, vol. 154, no. 1, pp. 240-51, 2013.
N. Hacohen, Fritsch, E. F. , Carter, T. A. , Lander, E. S. , and Wu, C. J. , Getting personal with neoantigen-based therapeutic cancer vaccines., Cancer Immunol Res, vol. 1, no. 1, pp. 11-5, 2013.
C. A. Gifford, Ziller, M. J. , Gu, H. , Trapnell, C. , Donaghey, J. , Tsankov, A. , Shalek, A. K. , Kelley, D. R. , Shishkin, A. A. , Issner, R. , Zhang, X. , Coyne, M. , Fostel, J. L. , Holmes, L. , Meldrim, J. , Guttman, M. , Epstein, C. , Park, H. , Kohlbacher, O. , Rinn, J. , Gnirke, A. , Lander, E. S. , Bernstein, B. E. , and Meissner, A. , Transcriptional and epigenetic dynamics during specification of human embryonic stem cells., Cell, vol. 153, no. 5, pp. 1149-63, 2013.
A. M. Dulak, Stojanov, P. , Peng, S. , Lawrence, M. S. , Fox, C. , Stewart, C. , Bandla, S. , Imamura, Y. , Schumacher, S. E. , Shefler, E. , McKenna, A. , Carter, S. L. , Cibulskis, K. , Sivachenko, A. , Saksena, G. , Voet, D. , Ramos, A. H. , Auclair, D. , Thompson, K. , Sougnez, C. , Onofrio, R. C. , Guiducci, C. , Beroukhim, R. , Zhou, Z. , Lin, L. , Lin, J. , Reddy, R. , Chang, A. , Landrenau, R. , Pennathur, A. , Ogino, S. , Luketich, J. D. , Golub, T. R. , Gabriel, S. B. , Lander, E. S. , Beer, D. G. , Godfrey, T. E. , Getz, G. , and Bass, A. J. , Exome and whole-genome sequencing of esophageal adenocarcinoma identifies recurrent driver events and mutational complexity., Nat Genet, vol. 45, no. 5, pp. 478-86, 2013.
S. C. Baca, Prandi, D. , Lawrence, M. S. , Mosquera, J. Miguel, Romanel, A. , Drier, Y. , Park, K. , Kitabayashi, N. , MacDonald, T. Y. , Ghandi, M. , Van Allen, E. , Kryukov, G. V. , Sboner, A. , Theurillat, J. - P. , T Soong, D. , Nickerson, E. , Auclair, D. , Tewari, A. , Beltran, H. , Onofrio, R. C. , Boysen, G. , Guiducci, C. , Barbieri, C. E. , Cibulskis, K. , Sivachenko, A. , Carter, S. L. , Saksena, G. , Voet, D. , Ramos, A. H. , Winckler, W. , Cipicchio, M. , Ardlie, K. , Kantoff, P. W. , Berger, M. F. , Gabriel, S. B. , Golub, T. R. , Meyerson, M. , Lander, E. S. , Elemento, O. , Getz, G. , Demichelis, F. , Rubin, M. A. , and Garraway, L. A. , Punctuated evolution of prostate cancer genomes., Cell, vol. 153, no. 3, pp. 666-77, 2013.
M. Costello, Pugh, T. J. , Fennell, T. J. , Stewart, C. , Lichtenstein, L. , Meldrim, J. C. , Fostel, J. L. , Friedrich, D. C. , Perrin, D. , Dionne, D. , Kim, S. , Gabriel, S. B. , Lander, E. S. , Fisher, S. , and Getz, G. , Discovery and characterization of artifactual mutations in deep coverage targeted capture sequencing data due to oxidative DNA damage during sample preparation., Nucleic Acids Res, vol. 41, no. 6, p. e67, 2013.
L. A. Garraway and Lander, E. S. , Lessons from the cancer genome., Cell, vol. 153, no. 1, pp. 17-37, 2013.
A. R. Germain, Carmody, L. C. , Nag, P. P. , Morgan, B. , VerPlank, L. , Fernandez, C. , Donckele, E. , Feng, Y. , Perez, J. R. , Dandapani, S. , Palmer, M. , Lander, E. S. , Gupta, P. B. , Schreiber, S. L. , and Munoz, B. , Cinnamides as selective small-molecule inhibitors of a cellular model of breast cancer stem cells., Bioorg Med Chem Lett, vol. 23, no. 6, pp. 1834-8, 2013.
K. Cibulskis, Lawrence, M. S. , Carter, S. L. , Sivachenko, A. , Jaffe, D. , Sougnez, C. , Gabriel, S. , Meyerson, M. , Lander, E. S. , and Getz, G. , Sensitive detection of somatic point mutations in impure and heterogeneous cancer samples., Nat Biotechnol, vol. 31, no. 3, pp. 213-9, 2013.
A. Kirby, Gnirke, A. , Jaffe, D. B. , Barešová, V. , Pochet, N. , Blumenstiel, B. , Ye, C. , Aird, D. , Stevens, C. , Robinson, J. T. , Cabili, M. N. , Gat-Viks, I. , Kelliher, E. , Daza, R. , DeFelice, M. , Hůlková, H. , Sovová, J. , Vylet'al, P. , Antignac, C. , Guttman, M. , Handsaker, R. E. , Perrin, D. , Steelman, S. , Sigurdsson, S. , Scheinman, S. J. , Sougnez, C. , Cibulskis, K. , Parkin, M. , Green, T. , Rossin, E. , Zody, M. C. , Xavier, R. J. , Pollak, M. R. , Alper, S. L. , Lindblad-Toh, K. , Gabriel, S. , P Hart, S. , Regev, A. , Nusbaum, C. , Kmoch, S. , Bleyer, A. J. , Lander, E. S. , and Daly, M. J. , Mutations causing medullary cystic kidney disease type 1 lie in a large VNTR in MUC1 missed by massively parallel sequencing., Nat Genet, vol. 45, no. 3, pp. 299-303, 2013.
T. J. Pugh, Morozova, O. , Attiyeh, E. F. , Asgharzadeh, S. , Wei, J. S. , Auclair, D. , Carter, S. L. , Cibulskis, K. , Hanna, M. , Kiezun, A. , Kim, J. , Lawrence, M. S. , Lichenstein, L. , McKenna, A. , Pedamallu, C. Sekhar, Ramos, A. H. , Shefler, E. , Sivachenko, A. , Sougnez, C. , Stewart, C. , Ally, A. , Birol, I. , Chiu, R. , Corbett, R. D. , Hirst, M. , Jackman, S. D. , Kamoh, B. , Khodabakshi, A. Hadj, Krzywinski, M. , Lo, A. , Moore, R. A. , Mungall, K. L. , Qian, J. , Tam, A. , Thiessen, N. , Zhao, Y. , Cole, K. A. , Diamond, M. , Diskin, S. J. , Mosse, Y. P. , Wood, A. C. , Ji, L. , Sposto, R. , Badgett, T. , London, W. B. , Moyer, Y. , Gastier-Foster, J. M. , Smith, M. A. , Auvil, J. M. Guidry, Gerhard, D. S. , Hogarty, M. D. , Jones, S. J. M. , Lander, E. S. , Gabriel, S. B. , Getz, G. , Seeger, R. C. , Khan, J. , Marra, M. A. , Meyerson, M. , and Maris, J. M. , The genetic landscape of high-risk neuroblastoma., Nat Genet, vol. 45, no. 3, pp. 279-84, 2013.
D. A. Landau, Carter, S. L. , Stojanov, P. , McKenna, A. , Stevenson, K. , Lawrence, M. S. , Sougnez, C. , Stewart, C. , Sivachenko, A. , Wang, L. , Wan, Y. , Zhang, W. , Shukla, S. A. , Vartanov, A. , Fernandes, S. M. , Saksena, G. , Cibulskis, K. , Tesar, B. , Gabriel, S. , Hacohen, N. , Meyerson, M. , Lander, E. S. , Neuberg, D. , Brown, J. R. , Getz, G. , and Wu, C. J. , Evolution and impact of subclonal mutations in chronic lymphocytic leukemia., Cell, vol. 152, no. 4, pp. 714-26, 2013.
S. R. Grossman, Andersen, K. G. , Shlyakhter, I. , Tabrizi, S. , Winnicki, S. , Yen, A. , Park, D. J. , Griesemer, D. , Karlsson, E. K. , Wong, S. H. , Cabili, M. , Adegbola, R. A. , Bamezai, R. N. K. , Hill, A. V. S. , Vannberg, F. O. , Rinn, J. L. , Lander, E. S. , Schaffner, S. F. , and Sabeti, P. C. , Identifying recent adaptations in large-scale genomic data., Cell, vol. 152, no. 4, pp. 703-13, 2013.
S. K. Gire, Stremlau, M. , Andersen, K. G. , Schaffner, S. F. , Bjornson, Z. , Rubins, K. , Hensley, L. , McCormick, J. B. , Lander, E. S. , Garry, R. F. , Happi, C. , and Sabeti, P. C. , Epidemiology. Emerging disease or diagnosis?, Science, vol. 338, no. 6108, pp. 750-2, 2012.
V. G. Sankaran, Ludwig, L. S. , Sicinska, E. , Xu, J. , Bauer, D. E. , Eng, J. C. , Patterson, H. Christine, Metcalf, R. A. , Natkunam, Y. , Orkin, S. H. , Sicinski, P. , Lander, E. S. , and Lodish, H. F. , Cyclin D3 coordinates the cell cycle during differentiation to regulate erythrocyte size and number., Genes Dev, vol. 26, no. 18, pp. 2075-87, 2012.
M. Imielinski, Berger, A. H. , Hammerman, P. S. , Hernandez, B. , Pugh, T. J. , Hodis, E. , Cho, J. , Suh, J. , Capelletti, M. , Sivachenko, A. , Sougnez, C. , Auclair, D. , Lawrence, M. S. , Stojanov, P. , Cibulskis, K. , Choi, K. , de Waal, L. , Sharifnia, T. , Brooks, A. , Greulich, H. , Banerji, S. , Zander, T. , Seidel, D. , Leenders, F. , Ansén, S. , Ludwig, C. , Engel-Riedel, W. , Stoelben, E. , Wolf, J. , Goparju, C. , Thompson, K. , Winckler, W. , Kwiatkowski, D. , Johnson, B. E. , Jänne, P. A. , Miller, V. A. , Pao, W. , Travis, W. D. , Pass, H. I. , Gabriel, S. B. , Lander, E. S. , Thomas, R. K. , Garraway, L. A. , Getz, G. , and Meyerson, M. , Mapping the hallmarks of lung adenocarcinoma with massively parallel sequencing., Cell, vol. 150, no. 6, pp. 1107-20, 2012.
E. Hodis, Watson, I. R. , Kryukov, G. V. , Arold, S. T. , Imielinski, M. , Theurillat, J. - P. , Nickerson, E. , Auclair, D. , Li, L. , Place, C. , Dicara, D. , Ramos, A. H. , Lawrence, M. S. , Cibulskis, K. , Sivachenko, A. , Voet, D. , Saksena, G. , Stransky, N. , Onofrio, R. C. , Winckler, W. , Ardlie, K. , Wagle, N. , Wargo, J. , Chong, K. , Morton, D. L. , Stemke-Hale, K. , Chen, G. , Noble, M. , Meyerson, M. , Ladbury, J. E. , Davies, M. A. , Gershenwald, J. E. , Wagner, S. N. , Hoon, D. S. B. , Schadendorf, D. , Lander, E. S. , Gabriel, S. B. , Getz, G. , Garraway, L. A. , and Chin, L. , A landscape of driver mutations in melanoma., Cell, vol. 150, no. 2, pp. 251-63, 2012.
V. G. Sankaran, Ghazvinian, R. , Do, R. , Thiru, P. , Vergilio, J. - A. , Beggs, A. H. , Sieff, C. A. , Orkin, S. H. , Nathan, D. G. , Lander, E. S. , and Gazda, H. T. , Exome sequencing identifies GATA1 mutations resulting in Diamond-Blackfan anemia., J Clin Invest, vol. 122, no. 7, pp. 2439-43, 2012.
S. Banerji, Cibulskis, K. , Rangel-Escareño, C. , Brown, K. K. , Carter, S. L. , Frederick, A. M. , Lawrence, M. S. , Sivachenko, A. Y. , Sougnez, C. , Zou, L. , Cortés, M. L. , Fernandez-Lopez, J. C. , Peng, S. , Ardlie, K. G. , Auclair, D. , Bautista-Piña, V. , Duke, F. , Francis, J. , Jung, J. , Maffuz-Aziz, A. , Onofrio, R. C. , Parkin, M. , Pho, N. H. , Quintanar-Jurado, V. , Ramos, A. H. , Rebollar-Vega, R. , Rodriguez-Cuevas, S. , Romero-Cordoba, S. L. , Schumacher, S. E. , Stransky, N. , Thompson, K. M. , Uribe-Figueroa, L. , Baselga, J. , Beroukhim, R. , Polyak, K. , Sgroi, D. C. , Richardson, A. L. , Jimenez-Sanchez, G. , Lander, E. S. , Gabriel, S. B. , Garraway, L. A. , Golub, T. R. , Melendez-Zajgla, J. , Toker, A. , Getz, G. , Hidalgo-Miranda, A. , and Meyerson, M. , Sequence analysis of mutations and translocations across breast cancer subtypes., Nature, vol. 486, no. 7403, pp. 405-9, 2012.
C. E. Barbieri, Baca, S. C. , Lawrence, M. S. , Demichelis, F. , Blattner, M. , Theurillat, J. - P. , White, T. A. , Stojanov, P. , Van Allen, E. , Stransky, N. , Nickerson, E. , Chae, S. - S. , Boysen, G. , Auclair, D. , Onofrio, R. C. , Park, K. , Kitabayashi, N. , MacDonald, T. Y. , Sheikh, K. , Vuong, T. , Guiducci, C. , Cibulskis, K. , Sivachenko, A. , Carter, S. L. , Saksena, G. , Voet, D. , Hussain, W. M. , Ramos, A. H. , Winckler, W. , Redman, M. C. , Ardlie, K. , Tewari, A. K. , Mosquera, J. Miguel, Rupp, N. , Wild, P. J. , Moch, H. , Morrissey, C. , Nelson, P. S. , Kantoff, P. W. , Gabriel, S. B. , Golub, T. R. , Meyerson, M. , Lander, E. S. , Getz, G. , Rubin, M. A. , and Garraway, L. A. , Exome sequencing identifies recurrent SPOP, FOXA1 and MED12 mutations in prostate cancer., Nat Genet, vol. 44, no. 6, pp. 685-9, 2012.
A. R. Germain, Carmody, L. C. , Morgan, B. , Fernandez, C. , Forbeck, E. , Lewis, T. A. , Nag, P. P. , Ting, A. , VerPlank, L. , Feng, Y. , Perez, J. R. , Dandapani, S. , Palmer, M. , Lander, E. S. , Gupta, P. B. , Schreiber, S. L. , and Munoz, B. , Identification of a selective small molecule inhibitor of breast cancer stem cells., Bioorg Med Chem Lett, vol. 22, no. 10, pp. 3571-4, 2012.
M. F. Berger, Hodis, E. , Heffernan, T. P. , Deribe, Y. Lissanu, Lawrence, M. S. , Protopopov, A. , Ivanova, E. , Watson, I. R. , Nickerson, E. , Ghosh, P. , Zhang, H. , Zeid, R. , Ren, X. , Cibulskis, K. , Sivachenko, A. Y. , Wagle, N. , Sucker, A. , Sougnez, C. , Onofrio, R. , Ambrogio, L. , Auclair, D. , Fennell, T. , Carter, S. L. , Drier, Y. , Stojanov, P. , Singer, M. A. , Voet, D. , Jing, R. , Saksena, G. , Barretina, J. , Ramos, A. H. , Pugh, T. J. , Stransky, N. , Parkin, M. , Winckler, W. , Mahan, S. , Ardlie, K. , Baldwin, J. , Wargo, J. , Schadendorf, D. , Meyerson, M. , Gabriel, S. B. , Golub, T. R. , Wagner, S. N. , Lander, E. S. , Getz, G. , Chin, L. , and Garraway, L. A. , Melanoma genome sequencing reveals frequent PREX2 mutations., Nature, vol. 485, no. 7399, pp. 502-6, 2012.
S. L. Carter, Cibulskis, K. , Helman, E. , McKenna, A. , Shen, H. , Zack, T. , Laird, P. W. , Onofrio, R. C. , Winckler, W. , Weir, B. A. , Beroukhim, R. , Pellman, D. , Levine, D. A. , Lander, E. S. , Meyerson, M. , and Getz, G. , Absolute quantification of somatic DNA alterations in human cancer., Nat Biotechnol, vol. 30, no. 5, pp. 413-21, 2012.
F. C. Jones, Grabherr, M. G. , Chan, Y. Frank, Russell, P. , Mauceli, E. , Johnson, J. , Swofford, R. , Pirun, M. , Zody, M. C. , White, S. , Birney, E. , Searle, S. , Schmutz, J. , Grimwood, J. , Dickson, M. C. , Myers, R. M. , Miller, C. T. , Summers, B. R. , Knecht, A. K. , Brady, S. D. , Zhang, H. , Pollen, A. A. , Howes, T. , Amemiya, C. , Baldwin, J. , Bloom, T. , Jaffe, D. B. , Nicol, R. , Wilkinson, J. , Lander, E. S. , di Palma, F. , Lindblad-Toh, K. , and Kingsley, D. M. , The genomic basis of adaptive evolution in threespine sticklebacks., Nature, vol. 484, no. 7392, pp. 55-61, 2012.
J. G. Lohr, Stojanov, P. , Lawrence, M. S. , Auclair, D. , Chapuy, B. , Sougnez, C. , Cruz-Gordillo, P. , Knoechel, B. , Asmann, Y. W. , Slager, S. L. , Novak, A. J. , Dogan, A. , Ansell, S. M. , Link, B. K. , Zou, L. , Gould, J. , Saksena, G. , Stransky, N. , Rangel-Escareño, C. , Fernandez-Lopez, J. Carlos, Hidalgo-Miranda, A. , Melendez-Zajgla, J. , Hernández-Lemus, E. , Schwarz-Cruz y Celis, A. , Imaz-Rosshandler, I. , Ojesina, A. I. , Jung, J. , Pedamallu, C. S. , Lander, E. S. , Habermann, T. M. , Cerhan, J. R. , Shipp, M. A. , Getz, G. , and Golub, T. R. , Discovery and prioritization of somatic mutations in diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) by whole-exome sequencing., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 109, no. 10, pp. 3879-84, 2012.
J. G. Lohr, Stojanov, P. , Lawrence, M. S. , Auclair, D. , Chapuy, B. , Sougnez, C. , Cruz-Gordillo, P. , Knoechel, B. , Asmann, Y. W. , Slager, S. L. , Novak, A. J. , Dogan, A. , Ansell, S. M. , Link, B. K. , Zou, L. , Gould, J. , Saksena, G. , Stransky, N. , Rangel-Escareño, C. , Fernandez-Lopez, J. Carlos, Hidalgo-Miranda, A. , Melendez-Zajgla, J. , Hernández-Lemus, E. , Schwarz-Cruz y Celis, A. , Imaz-Rosshandler, I. , Ojesina, A. I. , Jung, J. , Pedamallu, C. S. , Lander, E. S. , Habermann, T. M. , Cerhan, J. R. , Shipp, M. A. , Getz, G. , and Golub, T. R. , Discovery and prioritization of somatic mutations in diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) by whole-exome sequencing., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 109, no. 10, pp. 3879-84, 2012.
T. T. Onder, Kara, N. , Cherry, A. , Sinha, A. U. , Zhu, N. , Bernt, K. M. , Cahan, P. , B Marcarci, O. , Unternaehrer, J. , Gupta, P. B. , Lander, E. S. , Armstrong, S. A. , and Daley, G. Q. , Chromatin-modifying enzymes as modulators of reprogramming., Nature, vol. 483, no. 7391, pp. 598-602, 2012.
A. Melnikov, Murugan, A. , Zhang, X. , Tesileanu, T. , Wang, L. , Rogov, P. , Feizi, S. , Gnirke, A. , Callan, C. G. , Kinney, J. B. , Kellis, M. , Lander, E. S. , and Mikkelsen, T. S. , Systematic dissection and optimization of inducible enhancers in human cells using a massively parallel reporter assay., Nat Biotechnol, vol. 30, no. 3, pp. 271-7, 2012.
Y. H. Grad, Lipsitch, M. , Feldgarden, M. , Arachchi, H. M. , Cerqueira, G. C. , Fitzgerald, M. , Godfrey, P. , Haas, B. J. , Murphy, C. I. , Russ, C. , Sykes, S. , Walker, B. J. , Wortman, J. R. , Young, S. , Zeng, Q. , Abouelleil, A. , Bochicchio, J. , Chauvin, S. , Desmet, T. , Gujja, S. , McCowan, C. , Montmayeur, A. , Steelman, S. , Frimodt-Møller, J. , Petersen, A. M. , Struve, C. , Krogfelt, K. A. , Bingen, E. , Weill, F. - X. , Lander, E. S. , Nusbaum, C. , Birren, B. W. , Hung, D. T. , and Hanage, W. P. , Genomic epidemiology of the Escherichia coli O104:H4 outbreaks in Europe, 2011., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 109, no. 8, pp. 3065-70, 2012.
O. Zuk, Hechter, E. , Sunyaev, S. R. , and Lander, E. S. , The mystery of missing heritability: Genetic interactions create phantom heritability., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 109, no. 4, pp. 1193-8, 2012.
L. Wang, Lawrence, M. S. , Wan, Y. , Stojanov, P. , Sougnez, C. , Stevenson, K. , Werner, L. , Sivachenko, A. , DeLuca, D. S. , Zhang, L. , Zhang, W. , Vartanov, A. R. , Fernandes, S. M. , Goldstein, N. R. , Folco, E. G. , Cibulskis, K. , Tesar, B. , Sievers, Q. L. , Shefler, E. , Gabriel, S. , Hacohen, N. , Reed, R. , Meyerson, M. , Golub, T. R. , Lander, E. S. , Neuberg, D. , Brown, J. R. , Getz, G. , and Wu, C. J. , SF3B1 and other novel cancer genes in chronic lymphocytic leukemia., N Engl J Med, vol. 365, no. 26, pp. 2497-506, 2011.
D. N. Reshef, Reshef, Y. A. , Finucane, H. K. , Grossman, S. R. , McVean, G. , Turnbaugh, P. J. , Lander, E. S. , Mitzenmacher, M. , and Sabeti, P. C. , Detecting novel associations in large data sets., Science, vol. 334, no. 6062, pp. 1518-24, 2011.
A. E. Hill, Lander, E. S. , and Nadeau, J. H. , Chromosome substitution strains: a new way to study genetically complex traits., Methods in molecular medicine, vol. 128, pp. 153-72, 2011.
P. Danecek, Auton, A. , Abecasis, G. , Albers, C. A. , Banks, E. , DePristo, M. A. , Handsaker, R. E. , Lunter, G. , Marth, G. T. , Sherry, S. T. , McVean, G. , and Durbin, R. , The variant call format and VCFtools., Bioinformatics, vol. 27, no. 15, pp. 2156-8, 2011.
D. F. Conrad, Keebler, J. E. M. , DePristo, M. A. , Lindsay, S. J. , Zhang, Y. , Casals, F. , Idaghdour, Y. , Hartl, C. L. , Torroja, C. , Garimella, K. V. , Zilversmit, M. , Cartwright, R. , Rouleau, G. A. , Daly, M. , Stone, E. A. , Hurles, M. E. , and Awadalla, P. , Variation in genome-wide mutation rates within and between human families., Nat Genet, vol. 43, no. 7, pp. 712-4, 2011.
R. E. Mills, Walter, K. , Stewart, C. , Handsaker, R. E. , Chen, K. , Alkan, C. , Abyzov, A. , Yoon, S. Chris, Ye, K. , R Cheetham, K. , Chinwalla, A. , Conrad, D. F. , Fu, Y. , Grubert, F. , Hajirasouliha, I. , Hormozdiari, F. , Iakoucheva, L. M. , Iqbal, Z. , Kang, S. , Kidd, J. M. , Konkel, M. K. , Korn, J. , Khurana, E. , Kural, D. , Lam, H. Y. K. , Leng, J. , Li, R. , Li, Y. , Lin, C. - Y. , Luo, R. , Mu, X. Jasmine, Nemesh, J. , Peckham, H. E. , Rausch, T. , Scally, A. , Shi, X. , Stromberg, M. P. , Stütz, A. M. , Urban, A. Eckehart, Walker, J. A. , Wu, J. , Zhang, Y. , Zhang, Z. D. , Batzer, M. A. , Ding, L. , Marth, G. T. , McVean, G. , Sebat, J. , Snyder, M. , Wang, J. , Ye, K. , Eichler, E. E. , Gerstein, M. B. , Hurles, M. E. , Lee, C. , McCarroll, S. A. , and Korbel, J. O. , Mapping copy number variation by population-scale genome sequencing., Nature, vol. 470, no. 7332, pp. 59-65, 2011.
T. S. Mikkelsen, Xu, Z. , Zhang, X. , Wang, L. , Gimble, J. M. , Lander, E. S. , and Rosen, E. D. , Comparative epigenomic analysis of murine and human adipogenesis., Cell, vol. 143, no. 1, pp. 156-69, 2010.
A. Presser Aiden, Rivera, M. N. , Rheinbay, E. , Ku, M. , Coffman, E. J. , Truong, T. T. , Vargas, S. O. , Lander, E. S. , Haber, D. A. , and Bernstein, B. E. , Wilms tumor chromatin profiles highlight stem cell properties and a renal developmental network., Cell Stem Cell, vol. 6, no. 6, pp. 591-602, 2010.
K. S. Hoek, Exploring melanoma's massively parallel universe., Pigment Cell Melanoma Res, vol. 23, no. 3, pp. 306-7, 2010.
R. E. Green, Krause, J. , Briggs, A. W. , Maricic, T. , Stenzel, U. , Kircher, M. , Patterson, N. , Li, H. , Zhai, W. , Fritz, M. Hsi- Yang, Hansen, N. F. , Durand, E. Y. , Malaspinas, A. - S. , Jensen, J. D. , Marques-Bonet, T. , Alkan, C. , Prüfer, K. , Meyer, M. , Burbano, H. A. , Good, J. M. , Schultz, R. , Aximu-Petri, A. , Butthof, A. , Höber, B. , Höffner, B. , Siegemund, M. , Weihmann, A. , Nusbaum, C. , Lander, E. S. , Russ, C. , Novod, N. , Affourtit, J. , Egholm, M. , Verna, C. , Rudan, P. , Brajkovic, D. , Kucan, Z. , Gusic, I. , Doronichev, V. B. , Golovanova, L. V. , Lalueza-Fox, C. , de la Rasilla, M. , Fortea, J. , Rosas, A. , Schmitz, R. W. , Johnson, P. L. F. , Eichler, E. E. , Falush, D. , Birney, E. , Mullikin, J. C. , Slatkin, M. , Nielsen, R. , Kelso, J. , Lachmann, M. , Reich, D. , and Pääbo, S. , A draft sequence of the Neandertal genome., Science, vol. 328, no. 5979, pp. 710-22, 2010.
N. L. van Berkum, Lieberman-Aiden, E. , Williams, L. , Imakaev, M. , Gnirke, A. , Mirny, L. A. , Dekker, J. , and Lander, E. S. , Hi-C: a method to study the three-dimensional architecture of genomes., J Vis Exp, no. 39, 2010.
M. Guttman, Garber, M. , Levin, J. Z. , Donaghey, J. , Robinson, J. , Adiconis, X. , Fan, L. , Koziol, M. J. , Gnirke, A. , Nusbaum, C. , Rinn, J. L. , Lander, E. S. , and Regev, A. , Ab initio reconstruction of cell type-specific transcriptomes in mouse reveals the conserved multi-exonic structure of lincRNAs., Nat Biotechnol, vol. 28, no. 5, pp. 503-10, 2010.
L. C. Burrage, Baskin-Hill, A. E. , Sinasac, D. S. , Singer, J. B. , Croniger, C. M. , Kirby, A. , Kulbokas, E. J. , Daly, M. J. , Lander, E. S. , Broman, K. W. , and Nadeau, J. H. , Genetic resistance to diet-induced obesity in chromosome substitution strains of mice., Mamm Genome, vol. 21, no. 3-4, pp. 115-29, 2010.
R. Beroukhim, Mermel, C. H. , Porter, D. , Wei, G. , Raychaudhuri, S. , Donovan, J. , Barretina, J. , Boehm, J. S. , Dobson, J. , Urashima, M. , Henry, K. T. Mc, Pinchback, R. M. , Ligon, A. H. , Cho, Y. - J. , Haery, L. , Greulich, H. , Reich, M. , Winckler, W. , Lawrence, M. S. , Weir, B. A. , Tanaka, K. E. , Chiang, D. Y. , Bass, A. J. , Loo, A. , Hoffman, C. , Prensner, J. , Liefeld, T. , Gao, Q. , Yecies, D. , Signoretti, S. , Maher, E. , Kaye, F. J. , Sasaki, H. , Tepper, J. E. , Fletcher, J. A. , Tabernero, J. , Baselga, J. , Tsao, M. - S. , Demichelis, F. , Rubin, M. A. , Jänne, P. A. , Daly, M. J. , Nucera, C. , Levine, R. L. , Ebert, B. L. , Gabriel, S. , Rustgi, A. K. , Antonescu, C. R. , Ladanyi, M. , Letai, A. , Garraway, L. A. , Loda, M. , Beer, D. G. , True, L. D. , Okamoto, A. , Pomeroy, S. L. , Singer, S. , Golub, T. R. , Lander, E. S. , Getz, G. , Sellers, W. R. , and Meyerson, M. , The landscape of somatic copy-number alteration across human cancers., Nature, vol. 463, no. 7283, pp. 899-905, 2010.
S. R. Grossman, Shlyakhter, I. , Shylakhter, I. , Karlsson, E. K. , Byrne, E. H. , Morales, S. , Frieden, G. , Hostetter, E. , Angelino, E. , Garber, M. , Zuk, O. , Lander, E. S. , Schaffner, S. F. , and Sabeti, P. C. , A composite of multiple signals distinguishes causal variants in regions of positive selection., Science, vol. 327, no. 5967, pp. 883-6, 2010.
S. Young Kim, Dunn, I. F. , Firestein, R. , Gupta, P. , Wardwell, L. , Repich, K. , Schinzel, A. C. , Wittner, B. , Silver, S. J. , Root, D. E. , Boehm, J. S. , Ramaswamy, S. , Lander, E. S. , and Hahn, W. C. , CK1epsilon is required for breast cancers dependent on beta-catenin activity., PLoS One, vol. 5, no. 2, p. e8979, 2010.
H. Gu, Bock, C. , Mikkelsen, T. S. , Jäger, N. , Smith, Z. D. , Tomazou, E. , Gnirke, A. , Lander, E. S. , and Meissner, A. , Genome-scale DNA methylation mapping of clinical samples at single-nucleotide resolution., Nat Methods, vol. 7, no. 2, pp. 133-6, 2010.
E. Markljung, Jiang, L. , Jaffe, J. D. , Mikkelsen, T. S. , Wallerman, O. , Larhammar, M. , Zhang, X. , Wang, L. , Saenz-Vash, V. , Gnirke, A. , Lindroth, A. M. , Barrés, R. , Yan, J. , Strömberg, S. , De, S. , Ponten, F. , Lander, E. S. , Carr, S. A. , Zierath, J. R. , Kullander, K. , Wadelius, C. , Lindblad-Toh, K. , Andersson, G. , Hjälm, G. , and Andersson, L. , ZBED6, a novel transcription factor derived from a domesticated DNA transposon regulates IGF2 expression and muscle growth., PLoS Biol, vol. 7, no. 12, p. e1000256, 2009.
C. M. Wade, Giulotto, E. , Sigurdsson, S. , Zoli, M. , Gnerre, S. , Imsland, F. , Lear, T. L. , Adelson, D. L. , Bailey, E. , Bellone, R. R. , Blöcker, H. , Distl, O. , Edgar, R. C. , Garber, M. , Leeb, T. , Mauceli, E. , MacLeod, J. N. , Penedo, M. C. T. , Raison, J. M. , Sharpe, T. , Vogel, J. , Andersson, L. , Antczak, D. F. , Biagi, T. , Binns, M. M. , Chowdhary, B. P. , Coleman, S. J. , Della Valle, G. , Fryc, S. , Guérin, G. , Hasegawa, T. , Hill, E. W. , Jurka, J. , Kiialainen, A. , Lindgren, G. , Liu, J. , Magnani, E. , Mickelson, J. R. , Murray, J. , Nergadze, S. G. , Onofrio, R. , Pedroni, S. , Piras, M. F. , Raudsepp, T. , Rocchi, M. , Røed, K. H. , Ryder, O. A. , Searle, S. , Skow, L. , Swinburne, J. E. , Syvänen, A. C. , Tozaki, T. , Valberg, S. J. , Vaudin, M. , White, J. R. , Zody, M. C. , Lander, E. S. , and Lindblad-Toh, K. , Genome sequence, comparative analysis, and population genetics of the domestic horse., Science, vol. 326, no. 5954, pp. 865-7, 2009.
D. A. Barbie, Tamayo, P. , Boehm, J. S. , Kim, S. Young, Moody, S. E. , Dunn, I. F. , Schinzel, A. C. , Sandy, P. , Meylan, E. , Scholl, C. , Fröhling, S. , Chan, E. M. , Sos, M. L. , Michel, K. , Mermel, C. , Silver, S. J. , Weir, B. A. , Reiling, J. H. , Sheng, Q. , Gupta, P. B. , Wadlow, R. C. , Le, H. , Hoersch, S. , Wittner, B. S. , Ramaswamy, S. , Livingston, D. M. , Sabatini, D. M. , Meyerson, M. , Thomas, R. K. , Lander, E. S. , Mesirov, J. P. , Root, D. E. , D Gilliland, G. , Jacks, T. , and Hahn, W. C. , Systematic RNA interference reveals that oncogenic KRAS-driven cancers require TBK1., Nature, vol. 462, no. 7269, pp. 108-12, 2009.
E. Lieberman-Aiden, van Berkum, N. L. , Williams, L. , Imakaev, M. , Ragoczy, T. , Telling, A. , Amit, I. , Lajoie, B. R. , Sabo, P. J. , Dorschner, M. O. , Sandstrom, R. , Bernstein, B. , Bender, M. A. , Groudine, M. , Gnirke, A. , Stamatoyannopoulos, J. , Mirny, L. A. , Lander, E. S. , and Dekker, J. , Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome., Science, vol. 326, no. 5950, pp. 289-93, 2009.
P. B. Gupta, Onder, T. T. , Jiang, G. , Tao, K. , Kuperwasser, C. , Weinberg, R. A. , and Lander, E. S. , Identification of selective inhibitors of cancer stem cells by high-throughput screening., Cell, vol. 138, no. 4, pp. 645-59, 2009.
E. Lander, Jiang, G. , and Tao, K. , Taking aim at aggressive cancer cells., Cancer biology & therapy, vol. 8, no. 16, p. ii, 2009.
A. M. Khalil, Guttman, M. , Huarte, M. , Garber, M. , Raj, A. , Morales, D. Rivea, Thomas, K. , Presser, A. , Bernstein, B. E. , van Oudenaarden, A. , Regev, A. , Lander, E. S. , and Rinn, J. L. , Many human large intergenic noncoding RNAs associate with chromatin-modifying complexes and affect gene expression., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 106, no. 28, pp. 11667-72, 2009.
K. M. Vasudevan, Barbie, D. A. , Davies, M. A. , Rabinovsky, R. , McNear, C. J. , Kim, J. J. , Hennessy, B. T. , Tseng, H. , Pochanard, P. , Kim, S. Young, Dunn, I. F. , Schinzel, A. C. , Sandy, P. , Hoersch, S. , Sheng, Q. , Gupta, P. B. , Boehm, J. S. , Reiling, J. H. , Silver, S. , Lu, Y. , Stemke-Hale, K. , Dutta, B. , Joy, C. , Sahin, A. A. , Gonzalez-Angulo, A. Maria, Lluch, A. , Rameh, L. E. , Jacks, T. , Root, D. E. , Lander, E. S. , Mills, G. B. , Hahn, W. C. , Sellers, W. R. , and Garraway, L. A. , AKT-independent signaling downstream of oncogenic PIK3CA mutations in human cancer., Cancer Cell, vol. 16, no. 1, pp. 21-32, 2009.
M. Guttman, Amit, I. , Garber, M. , French, C. , Lin, M. F. , Feldser, D. , Huarte, M. , Zuk, O. , Carey, B. W. , Cassady, J. P. , Cabili, M. N. , Jaenisch, R. , Mikkelsen, T. S. , Jacks, T. , Hacohen, N. , Bernstein, B. E. , Kellis, M. , Regev, A. , Rinn, J. L. , and Lander, E. S. , Chromatin signature reveals over a thousand highly conserved large non-coding RNAs in mammals., Nature, vol. 458, no. 7235, pp. 223-7, 2009.
A. Gnirke, Melnikov, A. , Maguire, J. , Rogov, P. , LeProust, E. M. , Brockman, W. , Fennell, T. , Giannoukos, G. , Fisher, S. , Russ, C. , Gabriel, S. , Jaffe, D. B. , Lander, E. S. , and Nusbaum, C. , Solution hybrid selection with ultra-long oligonucleotides for massively parallel targeted sequencing., Nat Biotechnol, vol. 27, no. 2, pp. 182-9, 2009.
C. Nusbaum, Ohsumi, T. K. , Gomez, J. , Aquadro, J. , Victor, T. C. , Warren, R. M. , Hung, D. T. , Birren, B. W. , Lander, E. S. , and Jaffe, D. B. , Sensitive, specific polymorphism discovery in bacteria using massively parallel sequencing., Nat Methods, vol. 6, no. 1, pp. 67-9, 2009.
D. Y. Chiang, Getz, G. , Jaffe, D. B. , O'Kelly, M. J. T. , Zhao, X. , Carter, S. L. , Russ, C. , Nusbaum, C. , Meyerson, M. , and Lander, E. S. , High-resolution mapping of copy-number alterations with massively parallel sequencing., Nat Methods, vol. 6, no. 1, pp. 99-103, 2009.
B. Luo, Cheung, H. Wing, Subramanian, A. , Sharifnia, T. , Okamoto, M. , Yang, X. , Hinkle, G. , Boehm, J. S. , Beroukhim, R. , Weir, B. A. , Mermel, C. , Barbie, D. A. , Awad, T. , Zhou, X. , Nguyen, T. , Piqani, B. , Li, C. , Golub, T. R. , Meyerson, M. , Hacohen, N. , Hahn, W. C. , Lander, E. S. , Sabatini, D. M. , and Root, D. E. , Highly parallel identification of essential genes in cancer cells., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 105, no. 51, pp. 20380-5, 2008.
H. Shao, Burrage, L. C. , Sinasac, D. S. , Hill, A. E. , Ernest, S. R. , O'Brien, W. , Courtland, H. - W. , Jepsen, K. J. , Kirby, A. , Kulbokas, E. J. , Daly, M. J. , Broman, K. W. , Lander, E. S. , and Nadeau, J. H. , Genetic architecture of complex traits: large phenotypic effects and pervasive epistasis., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 105, no. 50, pp. 19910-4, 2008.
W. Miller, Drautz, D. I. , Ratan, A. , Pusey, B. , Qi, J. , Lesk, A. M. , Tomsho, L. P. , Packard, M. D. , Zhao, F. , Sher, A. , Tikhonov, A. , Raney, B. , Patterson, N. , Lindblad-Toh, K. , Lander, E. S. , Knight, J. R. , Irzyk, G. P. , Fredrikson, K. M. , Harkins, T. T. , Sheridan, S. , Pringle, T. , and Schuster, S. C. , Sequencing the nuclear genome of the extinct woolly mammoth., Nature, vol. 456, no. 7220, pp. 387-90, 2008.
D. Altshuler, Daly, M. J. , and Lander, E. S. , Genetic mapping in human disease., Science, vol. 322, no. 5903, pp. 881-8, 2008.
L. Ding, Getz, G. , Wheeler, D. A. , Mardis, E. R. , McLellan, M. D. , Cibulskis, K. , Sougnez, C. , Greulich, H. , Muzny, D. M. , Morgan, M. B. , Fulton, L. , Fulton, R. S. , Zhang, Q. , Wendl, M. C. , Lawrence, M. S. , Larson, D. E. , Chen, K. , Dooling, D. J. , Sabo, A. , Hawes, A. C. , Shen, H. , Jhangiani, S. N. , Lewis, L. R. , Hall, O. , Zhu, Y. , Mathew, T. , Ren, Y. , Yao, J. , Scherer, S. E. , Clerc, K. , Metcalf, G. A. , Ng, B. , Milosavljevic, A. , Gonzalez-Garay, M. L. , Osborne, J. R. , Meyer, R. , Shi, X. , Tang, Y. , Koboldt, D. C. , Lin, L. , Abbott, R. , Miner, T. L. , Pohl, C. , Fewell, G. , Haipek, C. , Schmidt, H. , Dunford-Shore, B. H. , Kraja, A. , Crosby, S. D. , Sawyer, C. S. , Vickery, T. , Sander, S. , Robinson, J. , Winckler, W. , Baldwin, J. , Chirieac, L. R. , Dutt, A. , Fennell, T. , Hanna, M. , Johnson, B. E. , Onofrio, R. C. , Thomas, R. K. , Tonon, G. , Weir, B. A. , Zhao, X. , Ziaugra, L. , Zody, M. C. , Giordano, T. , Orringer, M. B. , Roth, J. A. , Spitz, M. R. , Wistuba, I. I. , Ozenberger, B. , Good, P. J. , Chang, A. C. , Beer, D. G. , Watson, M. A. , Ladanyi, M. , Broderick, S. , Yoshizawa, A. , Travis, W. D. , Pao, W. , Province, M. A. , Weinstock, G. M. , Varmus, H. E. , Gabriel, S. B. , Lander, E. S. , Gibbs, R. A. , Meyerson, M. , and Wilson, R. K. , Somatic mutations affect key pathways in lung adenocarcinoma., Nature, vol. 455, no. 7216, pp. 1069-75, 2008.
M. Ku, Koche, R. P. , Rheinbay, E. , Mendenhall, E. M. , Endoh, M. , Mikkelsen, T. S. , Presser, A. , Nusbaum, C. , Xie, X. , Chi, A. S. , Adli, M. , Kasif, S. , Ptaszek, L. M. , Cowan, C. A. , Lander, E. S. , Koseki, H. , and Bernstein, B. E. , Genomewide analysis of PRC1 and PRC2 occupancy identifies two classes of bivalent domains., PLoS Genet, vol. 4, no. 10, p. e1000242, 2008.
A. Meissner, Mikkelsen, T. S. , Gu, H. , Wernig, M. , Hanna, J. , Sivachenko, A. , Zhang, X. , Bernstein, B. E. , Nusbaum, C. , Jaffe, D. B. , Gnirke, A. , Jaenisch, R. , and Lander, E. S. , Genome-scale DNA methylation maps of pluripotent and differentiated cells., Nature, vol. 454, no. 7205, pp. 766-70, 2008.
T. S. Mikkelsen, Hanna, J. , Zhang, X. , Ku, M. , Wernig, M. , Schorderet, P. , Bernstein, B. E. , Jaenisch, R. , Lander, E. S. , and Meissner, A. , Dissecting direct reprogramming through integrative genomic analysis., Nature, vol. 454, no. 7200, pp. 49-55, 2008.
T. T. Onder, Gupta, P. B. , Mani, S. A. , Yang, J. , Lander, E. S. , and Weinberg, R. A. , Loss of E-cadherin promotes metastasis via multiple downstream transcriptional pathways., Cancer Res, vol. 68, no. 10, pp. 3645-54, 2008.
J. Butler, MacCallum, I. , Kleber, M. , Shlyakhter, I. A. , Belmonte, M. K. , Lander, E. S. , Nusbaum, C. , and Jaffe, D. B. , ALLPATHS: de novo assembly of whole-genome shotgun microreads., Genome Res, vol. 18, no. 5, pp. 810-20, 2008.
D. E. Neafsey, Schaffner, S. F. , Volkman, S. K. , Park, D. , Montgomery, P. , Milner, D. A. , Lukens, A. , Rosen, D. , Daniels, R. , Houde, N. , Cortese, J. F. , Tyndall, E. , Gates, C. , Stange-Thomann, N. , Sarr, O. , Ndiaye, D. , Ndir, O. , Mboup, S. , Ferreira, M. U. , Moraes, Sdo Lago, Dash, A. P. , Chitnis, C. E. , Wiegand, R. C. , Hartl, D. L. , Birren, B. W. , Lander, E. S. , Sabeti, P. C. , and Wirth, D. F. , Genome-wide SNP genotyping highlights the role of natural selection in Plasmodium falciparum population divergence., Genome Biol, vol. 9, no. 12, p. R171, 2008.
J. P. Daily, Scanfeld, D. , Pochet, N. , Le Roch, K. , Plouffe, D. , Kamal, M. , Sarr, O. , Mboup, S. , Ndir, O. , Wypij, D. , Levasseur, K. , Thomas, E. , Tamayo, P. , Dong, C. , Zhou, Y. , Lander, E. S. , Ndiaye, D. , Wirth, D. , Winzeler, E. A. , Mesirov, J. P. , and Regev, A. , Distinct physiological states of Plasmodium falciparum in malaria-infected patients., Nature, vol. 450, no. 7172, pp. 1091-5, 2007.
R. Beroukhim, Getz, G. , Nghiemphu, L. , Barretina, J. , Hsueh, T. , Linhart, D. , Vivanco, I. , Lee, J. C. , Huang, J. H. , Alexander, S. , Du, J. , Kau, T. , Thomas, R. K. , Shah, K. , Soto, H. , Perner, S. , Prensner, J. , Debiasi, R. M. , Demichelis, F. , Hatton, C. , Rubin, M. A. , Garraway, L. A. , Nelson, S. F. , Liau, L. , Mischel, P. S. , Cloughesy, T. F. , Meyerson, M. , Golub, T. A. , Lander, E. S. , Mellinghoff, I. K. , and Sellers, W. R. , Assessing the significance of chromosomal aberrations in cancer: methodology and application to glioma., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 104, no. 50, pp. 20007-12, 2007.
B. A. Weir, Woo, M. S. , Getz, G. , Perner, S. , Ding, L. , Beroukhim, R. , Lin, W. M. , Province, M. A. , Kraja, A. , Johnson, L. A. , Shah, K. , Sato, M. , Thomas, R. K. , Barletta, J. A. , Borecki, I. B. , Broderick, S. , Chang, A. C. , Chiang, D. Y. , Chirieac, L. R. , Cho, J. , Fujii, Y. , Gazdar, A. F. , Giordano, T. , Greulich, H. , Hanna, M. , Johnson, B. E. , Kris, M. G. , Lash, A. , Lin, L. , Lindeman, N. , Mardis, E. R. , McPherson, J. D. , Minna, J. D. , Morgan, M. B. , Nadel, M. , Orringer, M. B. , Osborne, J. R. , Ozenberger, B. , Ramos, A. H. , Robinson, J. , Roth, J. A. , Rusch, V. , Sasaki, H. , Shepherd, F. , Sougnez, C. , Spitz, M. R. , Tsao, M. - S. , Twomey, D. , Verhaak, R. G. W. , Weinstock, G. M. , Wheeler, D. A. , Winckler, W. , Yoshizawa, A. , Yu, S. , Zakowski, M. F. , Zhang, Q. , Beer, D. G. , Wistuba, I. I. , Watson, M. A. , Garraway, L. A. , Ladanyi, M. , Travis, W. D. , Pao, W. , Rubin, M. A. , Gabriel, S. B. , Gibbs, R. A. , Varmus, H. E. , Wilson, R. K. , Lander, E. S. , and Meyerson, M. , Characterizing the cancer genome in lung adenocarcinoma., Nature, vol. 450, no. 7171, pp. 893-8, 2007.
M. Clamp, Fry, B. , Kamal, M. , Xie, X. , Cuff, J. , Lin, M. F. , Kellis, M. , Lindblad-Toh, K. , and Lander, E. S. , Distinguishing protein-coding and noncoding genes in the human genome., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 104, no. 49, pp. 19428-33, 2007.
W. Miller, Rosenbloom, K. , Hardison, R. C. , Hou, M. , Taylor, J. , Raney, B. , Burhans, R. , King, D. C. , Baertsch, R. , Blankenberg, D. , Kosakovsky Pond, S. L. , Nekrutenko, A. , Giardine, B. , Harris, R. S. , Tyekucheva, S. , Diekhans, M. , Pringle, T. H. , Murphy, W. J. , Lesk, A. , Weinstock, G. M. , Lindblad-Toh, K. , Gibbs, R. A. , Lander, E. S. , Siepel, A. , Haussler, D. , and Kent, W. J. , 28-way vertebrate alignment and conservation track in the UCSC Genome Browser., Genome research, vol. 17, no. 12, pp. 1797-808, 2007.
E. K. Karlsson, Baranowska, I. , Wade, C. M. , Hillbertz, N. H. C. Salmon, Zody, M. C. , Anderson, N. , Biagi, T. M. , Patterson, N. , Pielberg, G. Rosengren, Kulbokas, E. J. , Comstock, K. E. , Keller, E. T. , Mesirov, J. P. , von Euler, H. , Kämpe, O. , Hedhammar, Å. , Lander, E. S. , Andersson, G. , Andersson, L. , and Lindblad-Toh, K. , Efficient mapping of mendelian traits in dogs through genome-wide association., Nat Genet, vol. 39, no. 11, pp. 1321-8, 2007.
G. Getz, Höfling, H. , Mesirov, J. P. , Golub, T. R. , Meyerson, M. , Tibshirani, R. , and Lander, E. S. , Comment on "The consensus coding sequences of human breast and colorectal cancers"., Science, vol. 317, no. 5844, p. 1500, 2007.
T. A. Manolio, Rodriguez, L. Lyman, Brooks, L. , Abecasis, G. , Ballinger, D. , Daly, M. , Donnelly, P. , Faraone, S. V. , Frazer, K. , Gabriel, S. , Gejman, P. , Guttmacher, A. , Harris, E. L. , Insel, T. , Kelsoe, J. R. , Lander, E. , McCowin, N. , Mailman, M. D. , Nabel, E. , Ostell, J. , Pugh, E. , Sherry, S. , Sullivan, P. F. , Thompson, J. F. , Warram, J. , Wholley, D. , Milos, P. M. , and Collins, F. S. , New models of collaboration in genome-wide association studies: the Genetic Association Information Network., Nat Genet, vol. 39, no. 9, pp. 1045-51, 2007.
D. A. Hafler, Compston, A. , Sawcer, S. , Lander, E. S. , Daly, M. J. , De Jager, P. L. , de Bakker, P. I. W. , Gabriel, S. B. , Mirel, D. B. , Ivinson, A. J. , Pericak-Vance, M. A. , Gregory, S. G. , Rioux, J. D. , McCauley, J. L. , Haines, J. L. , Barcellos, L. F. , Cree, B. , Oksenberg, J. R. , and Hauser, S. L. , Risk alleles for multiple sclerosis identified by a genomewide study., N Engl J Med, vol. 357, no. 9, pp. 851-62, 2007.
T. S. Mikkelsen, Ku, M. , Jaffe, D. B. , Issac, B. , Lieberman, E. , Giannoukos, G. , Alvarez, P. , Brockman, W. , Kim, T. - K. , Koche, R. P. , Lee, W. , Mendenhall, E. , O'Donovan, A. , Presser, A. , Russ, C. , Xie, X. , Meissner, A. , Wernig, M. , Jaenisch, R. , Nusbaum, C. , Lander, E. S. , and Bernstein, B. E. , Genome-wide maps of chromatin state in pluripotent and lineage-committed cells., Nature, vol. 448, no. 7153, pp. 553-60, 2007.
J. S. Boehm, Zhao, J. J. , Yao, J. , Kim, S. Young, Firestein, R. , Dunn, I. F. , Sjostrom, S. K. , Garraway, L. A. , Weremowicz, S. , Richardson, A. L. , Greulich, H. , Stewart, C. J. , Mulvey, L. A. , Shen, R. R. , Ambrogio, L. , Hirozane-Kishikawa, T. , Hill, D. E. , Vidal, M. , Meyerson, M. , Grenier, J. K. , Hinkle, G. , Root, D. E. , Roberts, T. M. , Lander, E. S. , Polyak, K. , and Hahn, W. C. , Integrative genomic approaches identify IKBKE as a breast cancer oncogene., Cell, vol. 129, no. 6, pp. 1065-79, 2007.
E. H. Margulies, Cooper, G. M. , Asimenos, G. , Thomas, D. J. , Dewey, C. N. , Siepel, A. , Birney, E. , Keefe, D. , Schwartz, A. S. , Hou, M. , Taylor, J. , Nikolaev, S. , Montoya-Burgos, J. I. , Löytynoja, A. , Whelan, S. , Pardi, F. , Massingham, T. , Brown, J. B. , Bickel, P. , Holmes, I. , Mullikin, J. C. , Ureta-Vidal, A. , Paten, B. , Stone, E. A. , Rosenbloom, K. R. , W Kent, J. , Bouffard, G. G. , Guan, X. , Hansen, N. F. , Idol, J. R. , Maduro, V. V. B. , Maskeri, B. , McDowell, J. C. , Park, M. , Thomas, P. J. , Young, A. C. , Blakesley, R. W. , Muzny, D. M. , Sodergren, E. , Wheeler, D. A. , Worley, K. C. , Jiang, H. , Weinstock, G. M. , Gibbs, R. A. , Graves, T. , Fulton, R. , Mardis, E. R. , Wilson, R. K. , Clamp, M. , Cuff, J. , Gnerre, S. , Jaffe, D. B. , Chang, J. L. , Lindblad-Toh, K. , Lander, E. S. , Hinrichs, A. , Trumbower, H. , Clawson, H. , Zweig, A. , Kuhn, R. M. , Barber, G. , Harte, R. , Karolchik, D. , Field, M. A. , Moore, R. A. , Matthewson, C. A. , Schein, J. E. , Marra, M. A. , Antonarakis, S. E. , Batzoglou, S. , Goldman, N. , Hardison, R. , Haussler, D. , Miller, W. , Pachter, L. , Green, E. D. , and Sidow, A. , Analyses of deep mammalian sequence alignments and constraint predictions for 1% of the human genome., Genome Res, vol. 17, no. 6, pp. 760-74, 2007.
T. S. Mikkelsen, Wakefield, M. J. , Aken, B. , Amemiya, C. T. , Chang, J. L. , Duke, S. , Garber, M. , Gentles, A. J. , Goodstadt, L. , Heger, A. , Jurka, J. , Kamal, M. , Mauceli, E. , Searle, S. M. , Sharpe, T. , Baker, M. L. , Batzer, M. A. , Benos, P. V. , Belov, K. , Clamp, M. , Cook, A. , Cuff, J. , Das, R. , Davidow, L. , Deakin, J. E. , Fazzari, M. J. , Glass, J. L. , Grabherr, M. , Greally, J. M. , Gu, W. , Hore, T. A. , Huttley, G. A. , Kleber, M. , Jirtle, R. L. , Koina, E. , Lee, J. T. , Mahony, S. , Marra, M. A. , Miller, R. D. , Nicholls, R. D. , Oda, M. , Papenfuss, A. T. , Parra, Z. E. , Pollock, D. D. , Ray, D. A. , Schein, J. E. , Speed, T. P. , Thompson, K. , VandeBerg, J. L. , Wade, C. M. , Walker, J. A. , Waters, P. D. , Webber, C. , Weidman, J. R. , Xie, X. , Zody, M. C. , Broad Institute Genome Sequencing, P. , Broad Institute Whole Genome Assembly, T. , Graves, J. A. , Ponting, C. P. , Breen, M. , Samollow, P. B. , Lander, E. S. , and Lindblad-Toh, K. , Genome of the marsupial Monodelphis domestica reveals innovation in non-coding sequences., Nature, vol. 447, no. 7141, pp. 167-77, 2007.
T. Wai Yeo, De Jager, P. L. , Gregory, S. G. , Barcellos, L. F. , Walton, A. , Goris, A. , Fenoglio, C. , Ban, M. , Taylor, C. J. , Goodman, R. S. , Walsh, E. , Wolfish, C. S. , Horton, R. , Traherne, J. , Beck, S. , Trowsdale, J. , Caillier, S. J. , Ivinson, A. J. , Green, T. , Pobywajlo, S. , Lander, E. S. , Pericak-Vance, M. A. , Haines, J. L. , Daly, M. J. , Oksenberg, J. R. , Hauser, S. L. , Compston, A. , Hafler, D. A. , Rioux, J. D. , and Sawcer, S. , A second major histocompatibility complex susceptibility locus for multiple sclerosis., Ann Neurol, vol. 61, no. 3, pp. 228-36, 2007.
B. E. Bernstein, Meissner, A. , and Lander, E. S. , The mammalian epigenome., Cell, vol. 128, no. 4, pp. 669-81, 2007.
K. P. Strohl, Gallaugher, L. , Lynn, A. , Friedman, L. , Hill, A. , Singer, J. B. , Lander, E. S. , and Nadeau, J. , Sleep-related epilepsy in the A/J mouse., Sleep, vol. 30, no. 2, pp. 169-76, 2007.
S. K. Volkman, Sabeti, P. C. , DeCaprio, D. , Neafsey, D. E. , Schaffner, S. F. , Milner, D. A. , Daily, J. P. , Sarr, O. , Ndiaye, D. , Ndir, O. , Mboup, S. , Duraisingh, M. T. , Lukens, A. , Derr, A. , Stange-Thomann, N. , Waggoner, S. , Onofrio, R. , Ziaugra, L. , Mauceli, E. , Gnerre, S. , Jaffe, D. B. , Zainoun, J. , Wiegand, R. C. , Birren, B. W. , Hartl, D. L. , Galagan, J. E. , Lander, E. S. , and Wirth, D. F. , A genome-wide map of diversity in Plasmodium falciparum., Nat Genet, vol. 39, no. 1, pp. 113-9, 2007.
B. Q. Wei, Mikkelsen, T. S. , McKinney, M. K. , Lander, E. S. , and Cravatt, B. F. , A second fatty acid amide hydrolase with variable distribution among placental mammals., J Biol Chem, vol. 281, no. 48, pp. 36569-78, 2006.
S. J. Bourlat, Juliusdottir, T. , Lowe, C. J. , Freeman, R. , Aronowicz, J. , Kirschner, M. , Lander, E. S. , Thorndyke, M. , Nakano, H. , Kohn, A. B. , Heyland, A. , Moroz, L. L. , Copley, R. R. , and Telford, M. J. , Deuterostome phylogeny reveals monophyletic chordates and the new phylum Xenoturbellida., Nature, vol. 444, no. 7115, pp. 85-8, 2006.
J. Lamb, Crawford, E. D. , Peck, D. , Modell, J. W. , Blat, I. C. , Wrobel, M. J. , Lerner, J. , Brunet, J. - P. , Subramanian, A. , Ross, K. N. , Reich, M. , Hieronymus, H. , Wei, G. , Armstrong, S. A. , Haggarty, S. J. , Clemons, P. A. , Wei, R. , Carr, S. A. , Lander, E. S. , and Golub, T. R. , The Connectivity Map: using gene-expression signatures to connect small molecules, genes, and disease., Science, vol. 313, no. 5795, pp. 1929-35, 2006.
D. E. Root, Hacohen, N. , Hahn, W. C. , Lander, E. S. , and Sabatini, D. M. , Genome-scale loss-of-function screening with a lentiviral RNAi library., Nat Methods, vol. 3, no. 9, pp. 715-9, 2006.
C. J. Lowe, Terasaki, M. , Wu, M. , Freeman, R. M. , Runft, L. , Kwan, K. , Haigo, S. , Aronowicz, J. , Lander, E. , Gruber, C. , Smith, M. , Kirschner, M. , and Gerhart, J. , Dorsoventral patterning in hemichordates: insights into early chordate evolution., PLoS Biol, vol. 4, no. 9, p. e291, 2006.
N. Patterson, Richter, D. J. , Gnerre, S. , Lander, E. S. , and Reich, D. , Genetic evidence for complex speciation of humans and chimpanzees., Nature, vol. 441, no. 7097, pp. 1103-8, 2006.
P. C. Sabeti, Schaffner, S. F. , Fry, B. , Lohmueller, J. , Varilly, P. , Shamovsky, O. , Palma, A. , Mikkelsen, T. S. , Altshuler, D. , and Lander, E. S. , Positive natural selection in the human lineage., Science, vol. 312, no. 5780, pp. 1614-20, 2006.
M. Karey Tello-Ruiz, Curley, C. , DelMonte, T. , Giallourakis, C. , Kirby, A. , Miller, K. , Wild, G. , Cohen, A. , Langelier, D. , Latiano, A. , Wedemeyer, N. , Lander, E. , Schreiber, S. , Annese, V. , Daly, M. J. , and Rioux, J. D. , Haplotype-based association analysis of 56 functional candidate genes in the IBD6 locus on chromosome 19., Eur J Hum Genet, vol. 14, no. 6, pp. 780-90, 2006.
B. E. Bernstein, Mikkelsen, T. S. , Xie, X. , Kamal, M. , Huebert, D. J. , Cuff, J. , Fry, B. , Meissner, A. , Wernig, M. , Plath, K. , Jaenisch, R. , Wagschal, A. , Feil, R. , Schreiber, S. L. , and Lander, E. S. , A bivalent chromatin structure marks key developmental genes in embryonic stem cells., Cell, vol. 125, no. 2, pp. 315-26, 2006.
M. C. Zody, Garber, M. , Adams, D. J. , Sharpe, T. , Harrow, J. , Lupski, J. R. , Nicholson, C. , Searle, S. M. , Wilming, L. , Young, S. K. , Abouelleil, A. , Allen, N. R. , Bi, W. , Bloom, T. , Borowsky, M. L. , Bugalter, B. E. , Butler, J. , Chang, J. L. , Chen, C. - K. , Cook, A. , Corum, B. , Cuomo, C. A. , de Jong, P. J. , DeCaprio, D. , Dewar, K. , Fitzgerald, M. , Gilbert, J. , Gibson, R. , Gnerre, S. , Goldstein, S. , Grafham, D. V. , Grocock, R. , Hafez, N. , Hagopian, D. S. , Hart, E. , Norman, C. Hosage, Humphray, S. , Jaffe, D. B. , Jones, M. , Kamal, M. , Khodiyar, V. K. , LaButti, K. , Laird, G. , Lehoczky, J. , Liu, X. , Lokyitsang, T. , Loveland, J. , Lui, A. , Macdonald, P. , Major, J. E. , Matthews, L. , Mauceli, E. , McCarroll, S. A. , Mihalev, A. H. , Mudge, J. , Nguyen, C. , Nicol, R. , O'Leary, S. B. , Osoegawa, K. , Schwartz, D. C. , Shaw-Smith, C. , Stankiewicz, P. , Steward, C. , Swarbreck, D. , Venkataraman, V. , Whittaker, C. A. , Yang, X. , Zimmer, A. R. , Bradley, A. , Hubbard, T. , Birren, B. W. , Rogers, J. , Lander, E. S. , and Nusbaum, C. , DNA sequence of human chromosome 17 and analysis of rearrangement in the human lineage., Nature, vol. 440, no. 7087, pp. 1045-9, 2006.
J. Skou Pedersen, Bejerano, G. , Siepel, A. , Rosenbloom, K. , Lindblad-Toh, K. , Lander, E. S. , Kent, J. , Miller, W. , and Haussler, D. , Identification and classification of conserved RNA secondary structures in the human genome., PLoS Comput Biol, vol. 2, no. 4, p. e33, 2006.
M. C. Zody, Garber, M. , Sharpe, T. , Young, S. K. , Rowen, L. , O'Neill, K. , Whittaker, C. A. , Kamal, M. , Chang, J. L. , Cuomo, C. A. , Dewar, K. , FitzGerald, M. G. , Kodira, C. D. , Madan, A. , Qin, S. , Yang, X. , Abbasi, N. , Abouelleil, A. , Arachchi, H. M. , Baradarani, L. , Birditt, B. , Bloom, S. , Bloom, T. , Borowsky, M. L. , Burke, J. , Butler, J. , Cook, A. , DeArellano, K. , DeCaprio, D. , Dorris, L. , Dors, M. , Eichler, E. E. , Engels, R. , Fahey, J. , Fleetwood, P. , Friedman, C. , Gearin, G. , Hall, J. L. , Hensley, G. , Johnson, E. , Jones, C. , Kamat, A. , Kaur, A. , Locke, D. P. , Madan, A. , Munson, G. , Jaffe, D. B. , Lui, A. , Macdonald, P. , Mauceli, E. , Naylor, J. W. , Nesbitt, R. , Nicol, R. , O'Leary, S. B. , Ratcliffe, A. , Rounsley, S. , She, X. , Sneddon, K. M. B. , Stewart, S. , Sougnez, C. , Stone, S. M. , Topham, K. , Vincent, D. , Wang, S. , Zimmer, A. R. , Birren, B. W. , Hood, L. , Lander, E. S. , and Nusbaum, C. , Analysis of the DNA sequence and duplication history of human chromosome 15., Nature, vol. 440, no. 7084, pp. 671-5, 2006.
J. Moffat, Grueneberg, D. A. , Yang, X. , Kim, S. Young, Kloepfer, A. M. , Hinkle, G. , Piqani, B. , Eisenhaure, T. M. , Luo, B. , Grenier, J. K. , Carpenter, A. E. , Foo, S. Yin, Stewart, S. A. , Stockwell, B. R. , Hacohen, N. , Hahn, W. C. , Lander, E. S. , Sabatini, D. M. , and Root, D. E. , A lentiviral RNAi library for human and mouse genes applied to an arrayed viral high-content screen., Cell, vol. 124, no. 6, pp. 1283-98, 2006.
T. D. Taylor, Noguchi, H. , Totoki, Y. , Toyoda, A. , Kuroki, Y. , Dewar, K. , Lloyd, C. , Itoh, T. , Takeda, T. , Kim, D. - W. , She, X. , Barlow, K. F. , Bloom, T. , Bruford, E. , Chang, J. L. , Cuomo, C. A. , Eichler, E. , FitzGerald, M. G. , Jaffe, D. B. , LaButti, K. , Nicol, R. , Park, H. - S. , Seaman, C. , Sougnez, C. , Yang, X. , Zimmer, A. R. , Zody, M. C. , Birren, B. W. , Nusbaum, C. , Fujiyama, A. , Hattori, M. , Rogers, J. , Lander, E. S. , and Sakaki, Y. , Human chromosome 11 DNA sequence and analysis including novel gene identification., Nature, vol. 440, no. 7083, pp. 497-500, 2006.
E. C. Walsh, Sabeti, P. , Hutcheson, H. B. , Fry, B. , Schaffner, S. F. , de Bakker, P. I. W. , Varilly, P. , Palma, A. A. , Roy, J. , Cooper, R. , Winkler, C. , Zeng, Y. , de The, G. , Lander, E. S. , O'Brien, S. , and Altshuler, D. , Searching for signals of evolutionary selection in 168 genes related to immune function., Hum Genet, vol. 119, no. 1-2, pp. 92-102, 2006.
C. Nusbaum, Mikkelsen, T. S. , Zody, M. C. , Asakawa, S. , Taudien, S. , Garber, M. , Kodira, C. D. , Schueler, M. G. , Shimizu, A. , Whittaker, C. A. , Chang, J. L. , Cuomo, C. A. , Dewar, K. , FitzGerald, M. G. , Yang, X. , Allen, N. R. , Anderson, S. , Asakawa, T. , Blechschmidt, K. , Bloom, T. , Borowsky, M. L. , Butler, J. , Cook, A. , Corum, B. , DeArellano, K. , DeCaprio, D. , Dooley, K. T. , Dorris, L. , Engels, R. , Glöckner, G. , Hafez, N. , Hagopian, D. S. , Hall, J. L. , Ishikawa, S. K. , Jaffe, D. B. , Kamat, A. , Kudoh, J. , Lehmann, R. , Lokitsang, T. , Macdonald, P. , Major, J. E. , Matthews, C. D. , Mauceli, E. , Menzel, U. , Mihalev, A. H. , Minoshima, S. , Murayama, Y. , Naylor, J. W. , Nicol, R. , Nguyen, C. , O'Leary, S. B. , O'Neill, K. , Parker, S. C. J. , Polley, A. , Raymond, C. K. , Reichwald, K. , Rodriguez, J. , Sasaki, T. , Schilhabel, M. , Siddiqui, R. , Smith, C. L. , Sneddon, T. P. , Talamas, J. A. , Tenzin, P. , Topham, K. , Venkataraman, V. , Wen, G. , Yamazaki, S. , Young, S. K. , Zeng, Q. , Zimmer, A. R. , Rosenthal, A. , Birren, B. W. , Platzer, M. , Shimizu, N. , and Lander, E. S. , DNA sequence and analysis of human chromosome 8., Nature, vol. 439, no. 7074, pp. 331-5, 2006.
A. Subramanian, Tamayo, P. , Mootha, V. K. , Mukherjee, S. , Ebert, B. L. , Gillette, M. A. , Paulovich, A. , Pomeroy, S. L. , Golub, T. R. , Lander, E. S. , and Mesirov, J. P. , Gene set enrichment analysis: a knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 102, no. 43, pp. 15545-50, 2005.
C. Nusbaum, Zody, M. C. , Borowsky, M. L. , Kamal, M. , Kodira, C. D. , Taylor, T. D. , Whittaker, C. A. , Chang, J. L. , Cuomo, C. A. , Dewar, K. , FitzGerald, M. G. , Yang, X. , Abouelleil, A. , Allen, N. R. , Anderson, S. , Bloom, T. , Bugalter, B. , Butler, J. , Cook, A. , DeCaprio, D. , Engels, R. , Garber, M. , Gnirke, A. , Hafez, N. , Hall, J. L. , Norman, C. Hosage, Itoh, T. , Jaffe, D. B. , Kuroki, Y. , Lehoczky, J. , Lui, A. , Macdonald, P. , Mauceli, E. , Mikkelsen, T. S. , Naylor, J. W. , Nicol, R. , Nguyen, C. , Noguchi, H. , O'Leary, S. B. , O'Neill, K. , Piqani, B. , Smith, C. L. , Talamas, J. A. , Topham, K. , Totoki, Y. , Toyoda, A. , Wain, H. M. , Young, S. K. , Zeng, Q. , Zimmer, A. R. , Fujiyama, A. , Hattori, M. , Birren, B. W. , Sakaki, Y. , and Lander, E. S. , DNA sequence and analysis of human chromosome 18., Nature, vol. 437, no. 7058, pp. 551-5, 2005.
S. Sawcer, Ban, M. , Maranian, M. , Yeo, T. Wai, Compston, A. , Kirby, A. , Daly, M. J. , De Jager, P. L. , Walsh, E. , Lander, E. S. , Rioux, J. D. , Hafler, D. A. , Ivinson, A. , Rimmler, J. , Gregory, S. G. , Schmidt, S. , Pericak-Vance, M. A. , Akesson, E. , Hillert, J. , Datta, P. , Oturai, A. , Ryder, L. P. , Harbo, H. F. , Spurkland, A. , Myhr, K. - M. , Laaksonen, M. , Booth, D. , Heard, R. , Stewart, G. , Lincoln, R. , Barcellos, L. F. , Hauser, S. L. , Oksenberg, J. R. , Kenealy, S. J. , and Haines, J. L. , A high-density screen for linkage in multiple sclerosis., Am J Hum Genet, vol. 77, no. 3, pp. 454-67, 2005.
J. P. Vinson, Jaffe, D. B. , O'Neill, K. , Karlsson, E. K. , Stange-Thomann, N. , Anderson, S. , Mesirov, J. P. , Satoh, N. , Satou, Y. , Nusbaum, C. , Birren, B. , Galagan, J. E. , and Lander, E. S. , Assembly of polymorphic genomes: algorithms and application to Ciona savignyi., Genome Res, vol. 15, no. 8, pp. 1127-35, 2005.
M. M. Miretti, Walsh, E. C. , Ke, X. , Delgado, M. , Griffiths, M. , Hunt, S. , Morrison, J. , Whittaker, P. , Lander, E. S. , Cardon, L. R. , Bentley, D. R. , Rioux, J. D. , Beck, S. , and Deloukas, P. , A high-resolution linkage-disequilibrium map of the human major histocompatibility complex and first generation of tag single-nucleotide polymorphisms., Am J Hum Genet, vol. 76, no. 4, pp. 634-46, 2005.
E. H. Margulies, Vinson, J. P. , Miller, W. , Jaffe, D. B. , Lindblad-Toh, K. , Chang, J. L. , Green, E. D. , Lander, E. S. , Mullikin, J. C. , and Clamp, M. , An initial strategy for the systematic identification of functional elements in the human genome by low-redundancy comparative sequencing., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 102, no. 13, pp. 4795-800, 2005.
K. G. Ackerman, Huang, H. , Grasemann, H. , Puma, C. , Singer, J. B. , Hill, A. E. , Lander, E. , Nadeau, J. H. , Churchill, G. A. , Drazen, J. M. , and Beier, D. R. , Interacting genetic loci cause airway hyperresponsiveness., Physiol Genomics, vol. 21, no. 1, pp. 105-11, 2005.
X. Xie, Lu, J. , Kulbokas, E. J. , Golub, T. R. , Mootha, V. , Lindblad-Toh, K. , Lander, E. S. , and Kellis, M. , Systematic discovery of regulatory motifs in human promoters and 3' UTRs by comparison of several mammals., Nature, vol. 434, no. 7031, pp. 338-45, 2005.
B. E. Bernstein, Kamal, M. , Lindblad-Toh, K. , Bekiranov, S. , Bailey, D. K. , Huebert, D. J. , McMahon, S. , Karlsson, E. K. , Kulbokas, E. J. , Gingeras, T. R. , Schreiber, S. L. , and Lander, E. S. , Genomic maps and comparative analysis of histone modifications in human and mouse., Cell, vol. 120, no. 2, pp. 169-81, 2005.
A. Meissner, Gnirke, A. , Bell, G. W. , Ramsahoye, B. , Lander, E. S. , and Jaenisch, R. , Reduced representation bisulfite sequencing for comparative high-resolution DNA methylation analysis., Nucleic Acids Res, vol. 33, no. 18, pp. 5868-77, 2005.
J. D. Rioux, Karinen, H. , Kocher, K. , McMahon, S. Guschwan, Kärkkäinen, P. , Janatuinen, E. , Heikkinen, M. , Julkunen, R. , Pihlajamäki, J. , Naukkarinen, A. , Kosma, V. - M. , Daly, M. J. , Lander, E. S. , and Laakso, M. , Genomewide search and association studies in a Finnish celiac disease population: Identification of a novel locus and replication of the HLA and CTLA4 loci., Am J Med Genet A, vol. 130A, no. 4, pp. 345-50, 2004.
C. Poirier, Qin, Y. , Adams, C. P. , Anaya, Y. , Singer, J. B. , Hill, A. E. , Lander, E. S. , Nadeau, J. H. , and Bishop, C. E. , A complex interaction of imprinted and maternal-effect genes modifies sex determination in Odd Sex (Ods) mice., Genetics, vol. 168, no. 3, pp. 1557-62, 2004.
O. Jaillon, Aury, J. - M. , Brunet, F. , Petit, J. - L. , Stange-Thomann, N. , Mauceli, E. , Bouneau, L. , Fischer, C. , Ozouf-Costaz, C. , Bernot, A. , Nicaud, S. , Jaffe, D. , Fisher, S. , Lutfalla, G. , Dossat, C. , Segurens, B. , Dasilva, C. , Salanoubat, M. , Levy, M. , Boudet, N. , Castellano, S. , Anthouard, V. , Jubin, C. , Castelli, V. , Katinka, M. , Vacherie, B. , Biémont, C. , Skalli, Z. , Cattolico, L. , Poulain, J. , De Berardinis, V. , Cruaud, C. , Duprat, S. , Brottier, P. , Coutanceau, J. - P. , Gouzy, J. , Parra, G. , Lardier, G. , Chapple, C. , McKernan, K. J. , McEwan, P. , Bosak, S. , Kellis, M. , Volff, J. - N. , Guigo, R. , Zody, M. C. , Mesirov, J. , Lindblad-Toh, K. , Birren, B. , Nusbaum, C. , Kahn, D. , Robinson-Rechavi, M. , Laudet, V. , Schachter, V. , Quétier, F. , Saurin, W. , Scarpelli, C. , Wincker, P. , Lander, E. S. , Weissenbach, J. , and Crollius, H. Roest, Genome duplication in the teleost fish Tetraodon nigroviridis reveals the early vertebrate proto-karyotype., Nature, vol. 431, no. 7011, pp. 946-57, 2004.
M. Michalkiewicz, Michalkiewicz, T. , Ettinger, R. A. , Rutledge, E. A. , Fuller, J. M. , Moralejo, D. H. , Van Yserloo, B. , MacMurray, A. J. , Kwitek, A. E. , Jacob, H. J. , Lander, E. S. , and Lernmark, A. , Transgenic rescue demonstrates involvement of the Ian5 gene in T cell development in the rat., Physiol Genomics, vol. 19, no. 2, pp. 228-32, 2004.
T. D. Krewson, Supelak, P. J. , Hill, A. E. , Singer, J. B. , Lander, E. S. , Nadeau, J. H. , and Palmert, M. R. , Chromosomes 6 and 13 harbor genes that regulate pubertal timing in mouse chromosome substitution strains., Endocrinology, vol. 145, no. 10, pp. 4447-51, 2004.
C. T. Harbison, D Gordon, B. , Lee, T. Ihn, Rinaldi, N. J. , Macisaac, K. D. , Danford, T. W. , Hannett, N. M. , Tagne, J. - B. , Reynolds, D. B. , Yoo, J. , Jennings, E. G. , Zeitlinger, J. , Pokholok, D. K. , Kellis, M. , P Rolfe, A. , Takusagawa, K. T. , Lander, E. S. , Gifford, D. K. , Fraenkel, E. , and Young, R. A. , Transcriptional regulatory code of a eukaryotic genome., Nature, vol. 431, no. 7004, pp. 99-104, 2004.
E. S. Lander, Eric S. Lander., Nat Rev Drug Discov, vol. 3, no. 9, p. 730, 2004.
S. J. Sawcer, Maranian, M. , Singlehurst, S. , Yeo, T. W. , Compston, A. , Daly, M. J. , De Jager, P. L. , Gabriel, S. , Hafler, D. A. , Ivinson, A. J. , Lander, E. S. , Rioux, J. D. , Walsh, E. , Gregory, S. G. , Schmidt, S. , Pericak-Vance, M. A. , Barcellos, L. , Hauser, S. L. , Oksenberg, J. R. , Kenealy, S. J. , and Haines, J. L. , Enhancing linkage analysis of complex disorders: an evaluation of high-density genotyping., Hum Mol Genet, vol. 13, no. 17, pp. 1943-9, 2004.
K. G. Tantisira, Lake, S. , Silverman, E. S. , Palmer, L. J. , Lazarus, R. , Silverman, E. K. , Liggett, S. B. , Gelfand, E. W. , Rosenwasser, L. J. , Richter, B. , Israel, E. , Wechsler, M. , Gabriel, S. , Altshuler, D. , Lander, E. , Drazen, J. , and Weiss, S. T. , Corticosteroid pharmacogenetics: association of sequence variants in CRHR1 with improved lung function in asthmatics treated with inhaled corticosteroids., Hum Mol Genet, vol. 13, no. 13, pp. 1353-9, 2004.
V. K. Mootha, Handschin, C. , Arlow, D. , Xie, X. , St Pierre, J. , Sihag, S. , Yang, W. , Altshuler, D. , Puigserver, P. , Patterson, N. , Willy, P. J. , Schulman, I. G. , Heyman, R. A. , Lander, E. S. , and Spiegelman, B. M. , Erralpha and Gabpa/b specify PGC-1alpha-dependent oxidative phosphorylation gene expression that is altered in diabetic muscle., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 101, no. 17, pp. 6570-5, 2004.
J. B. Singer, Hill, A. E. , Burrage, L. C. , Olszens, K. R. , Song, J. , Justice, M. , O'Brien, W. E. , Conti, D. V. , Witte, J. S. , Lander, E. S. , and Nadeau, J. H. , Genetic dissection of complex traits with chromosome substitution strains of mice., Science, vol. 304, no. 5669, pp. 445-8, 2004.
M. L. Freedman, Reich, D. , Penney, K. L. , McDonald, G. J. , Mignault, A. A. , Patterson, N. , Gabriel, S. B. , Topol, E. J. , Smoller, J. W. , Pato, C. N. , Pato, M. T. , Petryshen, T. L. , Kolonel, L. N. , Lander, E. S. , Sklar, P. , Henderson, B. , Hirschhorn, J. N. , and Altshuler, D. , Assessing the impact of population stratification on genetic association studies., Nat Genet, vol. 36, no. 4, pp. 388-93, 2004.
P. Sklar, Pato, M. T. , Kirby, A. , Petryshen, T. L. , Medeiros, H. , Carvalho, C. , Macedo, A. , Dourado, A. , Coelho, I. , Valente, J. , Soares, M. J. , Ferreira, C. P. , Lei, M. , Verner, A. , Hudson, T. J. , Morley, C. P. , Kennedy, J. L. , Azevedo, M. H. , Lander, E. , Daly, M. J. , and Pato, C. N. , Genome-wide scan in Portuguese Island families identifies 5q31-5q35 as a susceptibility locus for schizophrenia and psychosis., Mol Psychiatry, vol. 9, no. 2, pp. 213-8, 2004.
D. H. Moralejo, Park, H. A. , Speros, S. J. , MacMurray, A. J. , Kwitek, A. E. , Jacob, H. J. , Lander, E. S. , and Lernmark, A. , Genetic dissection of lymphopenia from autoimmunity by introgression of mutated Ian5 gene onto the F344 rat., J Autoimmun, vol. 21, no. 4, pp. 315-24, 2003.
V. K. Mootha, Bunkenborg, J. , Olsen, J. V. , Hjerrild, M. , Wisniewski, J. R. , Stahl, E. , Bolouri, M. S. , Ray, H. N. , Sihag, S. , Kamal, M. , Patterson, N. , Lander, E. S. , and Mann, M. , Integrated analysis of protein composition, tissue diversity, and gene regulation in mouse mitochondria., Cell, vol. 115, no. 5, pp. 629-40, 2003.
E. C. Walsh, Mather, K. A. , Schaffner, S. F. , Farwell, L. , Daly, M. J. , Patterson, N. , Cullen, M. , Carrington, M. , Bugawan, T. L. , Erlich, H. , Campbell, J. , Barrett, J. , Miller, K. , Thomson, G. , Lander, E. S. , and Rioux, J. D. , An integrated haplotype map of the human major histocompatibility complex., Am J Hum Genet, vol. 73, no. 3, pp. 580-90, 2003.
V. K. Mootha, Lindgren, C. M. , Eriksson, K. - F. , Subramanian, A. , Sihag, S. , Lehar, J. , Puigserver, P. , Carlsson, E. , Ridderstråle, M. , Laurila, E. , Houstis, N. , Daly, M. J. , Patterson, N. , Mesirov, J. P. , Golub, T. R. , Tamayo, P. , Spiegelman, B. , Lander, E. S. , Hirschhorn, J. N. , Altshuler, D. , and Groop, L. C. , PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes., Nat Genet, vol. 34, no. 3, pp. 267-73, 2003.
C. J. Lowe, Wu, M. , Salic, A. , Evans, L. , Lander, E. , Stange-Thomann, N. , Gruber, C. E. , Gerhart, J. , and Kirschner, M. , Anteroposterior patterning in hemichordates and the origins of the chordate nervous system., Cell, vol. 113, no. 7, pp. 853-65, 2003.
M. Kellis, Patterson, N. , Endrizzi, M. , Birren, B. , and Lander, E. S. , Sequencing and comparison of yeast species to identify genes and regulatory elements., Nature, vol. 423, no. 6937, pp. 241-54, 2003.
J. E. Galagan, Calvo, S. E. , Borkovich, K. A. , Selker, E. U. , Read, N. D. , Jaffe, D. , FitzHugh, W. , Ma, L. - J. , Smirnov, S. , Purcell, S. , Rehman, B. , Elkins, T. , Engels, R. , Wang, S. , Nielsen, C. B. , Butler, J. , Endrizzi, M. , Qui, D. , Ianakiev, P. , Bell-Pedersen, D. , Nelson, M. Anne, Werner-Washburne, M. , Selitrennikoff, C. P. , Kinsey, J. A. , Braun, E. L. , Zelter, A. , Schulte, U. , Kothe, G. O. , Jedd, G. , Mewes, W. , Staben, C. , Marcotte, E. , Greenberg, D. , Roy, A. , Foley, K. , Naylor, J. , Stange-Thomann, N. , Barrett, R. , Gnerre, S. , Kamal, M. , Kamvysselis, M. , Mauceli, E. , Bielke, C. , Rudd, S. , Frishman, D. , Krystofova, S. , Rasmussen, C. , Metzenberg, R. L. , Perkins, D. D. , Kroken, S. , Cogoni, C. , Macino, G. , Catcheside, D. , Li, W. , Pratt, R. J. , Osmani, S. A. , DeSouza, C. P. C. , Glass, L. , Orbach, M. J. , J Berglund, A. , Voelker, R. , Yarden, O. , Plamann, M. , Seiler, S. , Dunlap, J. , Radford, A. , Aramayo, R. , Natvig, D. O. , Alex, L. A. , Mannhaupt, G. , Ebbole, D. J. , Freitag, M. , Paulsen, I. , Sachs, M. S. , Lander, E. S. , Nusbaum, C. , and Birren, B. , The genome sequence of the filamentous fungus Neurospora crassa., Nature, vol. 422, no. 6934, pp. 859-68, 2003.
R. H. Waterston, Lander, E. S. , and Sulston, J. E. , More on the sequencing of the human genome., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 100, no. 6, pp. 3022-4; author reply 3025-6, 2003.
Y. Xu, Stange-Thomann, N. , Weber, G. , Bo, R. , Dodge, S. , David, R. G. , Foley, K. , Beheshti, J. , Harris, N. L. , Birren, B. , Lander, E. S. , and Meyerson, M. , Pathogen discovery from human tissue by sequence-based computational subtraction., Genomics, vol. 81, no. 3, pp. 329-35, 2003.
D. B. Jaffe, Butler, J. , Gnerre, S. , Mauceli, E. , Lindblad-Toh, K. , Mesirov, J. P. , Zody, M. C. , and Lander, E. S. , Whole-genome sequence assembly for mammalian genomes: Arachne 2., Genome Res, vol. 13, no. 1, pp. 91-6, 2003.
Y. Okazaki, Furuno, M. , Kasukawa, T. , Adachi, J. , Bono, H. , Kondo, S. , Nikaido, I. , Osato, N. , Saito, R. , Suzuki, H. , Yamanaka, I. , Kiyosawa, H. , Yagi, K. , Tomaru, Y. , Hasegawa, Y. , Nogami, A. , Schönbach, C. , Gojobori, T. , Baldarelli, R. , Hill, D. P. , Bult, C. , Hume, D. A. , Quackenbush, J. , Schriml, L. M. , Kanapin, A. , Matsuda, H. , Batalov, S. , Beisel, K. W. , Blake, J. A. , Bradt, D. , Brusic, V. , Chothia, C. , Corbani, L. E. , Cousins, S. , Dalla, E. , Dragani, T. A. , Fletcher, C. F. , Forrest, A. , Frazer, K. S. , Gaasterland, T. , Gariboldi, M. , Gissi, C. , Godzik, A. , Gough, J. , Grimmond, S. , Gustincich, S. , Hirokawa, N. , Jackson, I. J. , Jarvis, E. D. , Kanai, A. , Kawaji, H. , Kawasawa, Y. , Kedzierski, R. M. , King, B. L. , Konagaya, A. , Kurochkin, I. V. , Lee, Y. , Lenhard, B. , Lyons, P. A. , Maglott, D. R. , Maltais, L. , Marchionni, L. , McKenzie, L. , Miki, H. , Nagashima, T. , Numata, K. , Okido, T. , Pavan, W. J. , Pertea, G. , Pesole, G. , Petrovsky, N. , Pillai, R. , Pontius, J. U. , Qi, D. , Ramachandran, S. , Ravasi, T. , Reed, J. C. , Reed, D. J. , Reid, J. , Ring, B. Z. , Ringwald, M. , Sandelin, A. , Schneider, C. , Semple, C. A. M. , Setou, M. , Shimada, K. , Sultana, R. , Takenaka, Y. , Taylor, M. S. , Teasdale, R. D. , Tomita, M. , Verardo, R. , Wagner, L. , Wahlestedt, C. , Wang, Y. , Watanabe, Y. , Wells, C. , Wilming, L. G. , Wynshaw-Boris, A. , Yanagisawa, M. , Yang, I. , Yang, L. , Yuan, Z. , Zavolan, M. , Zhu, Y. , Zimmer, A. , Carninci, P. , Hayatsu, N. , Hirozane-Kishikawa, T. , Konno, H. , Nakamura, M. , Sakazume, N. , Sato, K. , Shiraki, T. , Waki, K. , Kawai, J. , Aizawa, K. , Arakawa, T. , Fukuda, S. , Hara, A. , Hashizume, W. , Imotani, K. , Ishii, Y. , Itoh, M. , Kagawa, I. , Miyazaki, A. , Sakai, K. , Sasaki, D. , Shibata, K. , Shinagawa, A. , Yasunishi, A. , Yoshino, M. , Waterston, R. , Lander, E. S. , Rogers, J. , Birney, E. , and Hayashizaki, Y. , Analysis of the mouse transcriptome based on functional annotation of 60,770 full-length cDNAs., Nature, vol. 420, no. 6915, pp. 563-73, 2002.
R. H. Waterston, Lindblad-Toh, K. , Birney, E. , Rogers, J. , Abril, J. F. , Agarwal, P. , Agarwala, R. , Ainscough, R. , Alexandersson, M. , An, P. , Antonarakis, S. E. , Attwood, J. , Baertsch, R. , Bailey, J. , Barlow, K. , Beck, S. , Berry, E. , Birren, B. , Bloom, T. , Bork, P. , Botcherby, M. , Bray, N. , Brent, M. R. , Brown, D. G. , Brown, S. D. , Bult, C. , Burton, J. , Butler, J. , Campbell, R. D. , Carninci, P. , Cawley, S. , Chiaromonte, F. , Chinwalla, A. T. , Church, D. M. , Clamp, M. , Clee, C. , Collins, F. S. , Cook, L. L. , Copley, R. R. , Coulson, A. , Couronne, O. , Cuff, J. , Curwen, V. , Cutts, T. , Daly, M. , David, R. , Davies, J. , Delehaunty, K. D. , Deri, J. , Dermitzakis, E. T. , Dewey, C. , Dickens, N. J. , Diekhans, M. , Dodge, S. , Dubchak, I. , Dunn, D. M. , Eddy, S. R. , Elnitski, L. , Emes, R. D. , Eswara, P. , Eyras, E. , Felsenfeld, A. , Fewell, G. A. , Flicek, P. , Foley, K. , Frankel, W. N. , Fulton, L. A. , Fulton, R. S. , Furey, T. S. , Gage, D. , Gibbs, R. A. , Glusman, G. , Gnerre, S. , Goldman, N. , Goodstadt, L. , Grafham, D. , Graves, T. A. , Green, E. D. , Gregory, S. , Guigo, R. , Guyer, M. , Hardison, R. C. , Haussler, D. , Hayashizaki, Y. , Hillier, L. D. W. , Hinrichs, A. , Hlavina, W. , Holzer, T. , Hsu, F. , Hua, A. , Hubbard, T. , Hunt, A. , Jackson, I. , Jaffe, D. B. , L Johnson, S. , Jones, M. , Jones, T. A. , Joy, A. , Kamal, M. , Karlsson, E. K. , Karolchik, D. , Kasprzyk, A. , Kawai, J. , Keibler, E. , Kells, C. , W Kent, J. , Kirby, A. , Kolbe, D. L. , Korf, I. , Kucherlapati, R. S. , Kulbokas, E. J. , Kulp, D. , Landers, T. , Leger, J. P. , Leonard, S. , Letunic, I. , Levine, R. , Li, J. , Li, M. , Lloyd, C. , Lucas, S. , Ma, B. , Maglott, D. R. , Mardis, E. R. , Matthews, L. , Mauceli, E. , Mayer, J. H. , McCarthy, M. , W McCombie, R. , McLaren, S. , McLay, K. , McPherson, J. D. , Meldrim, J. , Meredith, B. , Mesirov, J. P. , Miller, W. , Miner, T. L. , Mongin, E. , Montgomery, K. T. , Morgan, M. , Mott, R. , Mullikin, J. C. , Muzny, D. M. , Nash, W. E. , Nelson, J. O. , Nhan, M. N. , Nicol, R. , Ning, Z. , Nusbaum, C. , O'Connor, M. J. , Okazaki, Y. , Oliver, K. , Overton-Larty, E. , Pachter, L. , Parra, G. , Pepin, K. H. , Peterson, J. , Pevzner, P. , Plumb, R. , Pohl, C. S. , Poliakov, A. , Ponce, T. C. , Ponting, C. P. , Potter, S. , Quail, M. , Reymond, A. , Roe, B. A. , Roskin, K. M. , Rubin, E. M. , Rust, A. G. , Santos, R. , Sapojnikov, V. , Schultz, B. , Schultz, J. , Schwartz, M. S. , Schwartz, S. , Scott, C. , Seaman, S. , Searle, S. , Sharpe, T. , Sheridan, A. , Shownkeen, R. , Sims, S. , Singer, J. B. , Slater, G. , Smit, A. , Smith, D. R. , Spencer, B. , Stabenau, A. , Stange-Thomann, N. , Sugnet, C. , Suyama, M. , Tesler, G. , Thompson, J. , Torrents, D. , Trevaskis, E. , Tromp, J. , Ucla, C. , Ureta-Vidal, A. , Vinson, J. P. , Von Niederhausern, A. C. , Wade, C. M. , Wall, M. , Weber, R. J. , Weiss, R. B. , Wendl, M. C. , West, A. P. , Wetterstrand, K. , Wheeler, R. , Whelan, S. , Wierzbowski, J. , Willey, D. , Williams, S. , Wilson, R. K. , Winter, E. , Worley, K. C. , Wyman, D. , Yang, S. , Yang, S. - P. , Zdobnov, E. M. , Zody, M. C. , and Lander, E. S. , Initial sequencing and comparative analysis of the mouse genome., Nature, vol. 420, no. 6915, pp. 520-62, 2002.
C. M. Wade, Kulbokas, E. J. , Kirby, A. W. , Zody, M. C. , Mullikin, J. C. , Lander, E. S. , Lindblad-Toh, K. , and Daly, M. J. , The mosaic structure of variation in the laboratory mouse genome., Nature, vol. 420, no. 6915, pp. 574-8, 2002.
C. - Z. Chen, Li, M. , de Graaf, D. , Monti, S. , Göttgens, B. , Sanchez, M. - J. , Lander, E. S. , Golub, T. R. , Green, A. R. , and Lodish, H. F. , Identification of endoglin as a functional marker that defines long-term repopulating hematopoietic stem cells., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 99, no. 24, pp. 15468-73, 2002.
C. R. Cowles, Hirschhorn, J. N. , Altshuler, D. , and Lander, E. S. , Detection of regulatory variation in mouse genes., Nat Genet, vol. 32, no. 3, pp. 432-7, 2002.
D. Humpherys, Eggan, K. , Akutsu, H. , Friedman, A. , Hochedlinger, K. , Yanagimachi, R. , Lander, E. S. , Golub, T. R. , and Jaenisch, R. , Abnormal gene expression in cloned mice derived from embryonic stem cell and cumulus cell nuclei., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 99, no. 20, pp. 12889-94, 2002.
D. E. Reich, Schaffner, S. F. , Daly, M. J. , McVean, G. , Mullikin, J. C. , Higgins, J. M. , Richter, D. J. , Lander, E. S. , and Altshuler, D. , Human genome sequence variation and the influence of gene history, mutation and recombination., Nat Genet, vol. 32, no. 1, pp. 135-42, 2002.
A. J. MacMurray, Moralejo, D. H. , Kwitek, A. E. , Rutledge, E. A. , Van Yserloo, B. , Gohlke, P. , Speros, S. J. , Snyder, B. , Schaefer, J. , Bieg, S. , Jiang, J. , Ettinger, R. A. , Fuller, J. , Daniels, T. L. , Pettersson, A. , Orlebeke, K. , Birren, B. , Jacob, H. J. , Lander, E. S. , and Lernmark, A. , Lymphopenia in the BB rat model of type 1 diabetes is due to a mutation in a novel immune-associated nucleotide (Ian)-related gene., Genome Res, vol. 12, no. 7, pp. 1029-39, 2002.
S. B. Gabriel, Schaffner, S. F. , Nguyen, H. , Moore, J. M. , Roy, J. , Blumenstiel, B. , Higgins, J. , DeFelice, M. , Lochner, A. , Faggart, M. , Liu-Cordero, S. Neen, Rotimi, C. , Adeyemo, A. , Cooper, R. , Ward, R. , Lander, E. S. , Daly, M. J. , and Altshuler, D. , The structure of haplotype blocks in the human genome., Science, vol. 296, no. 5576, pp. 2225-9, 2002.
J. E. Galagan, Nusbaum, C. , Roy, A. , Endrizzi, M. G. , Macdonald, P. , FitzHugh, W. , Calvo, S. , Engels, R. , Smirnov, S. , Atnoor, D. , Brown, A. , Allen, N. , Naylor, J. , Stange-Thomann, N. , DeArellano, K. , Johnson, R. , Linton, L. , McEwan, P. , McKernan, K. , Talamas, J. , Tirrell, A. , Ye, W. , Zimmer, A. , Barber, R. D. , Cann, I. , Graham, D. E. , Grahame, D. A. , Guss, A. M. , Hedderich, R. , Ingram-Smith, C. , H Kuettner, C. , Krzycki, J. A. , Leigh, J. A. , Li, W. , Liu, J. , Mukhopadhyay, B. , Reeve, J. N. , Smith, K. , Springer, T. A. , Umayam, L. A. , White, O. , White, R. H. , de Macario, E. Conway, Ferry, J. G. , Jarrell, K. F. , Jing, H. , Macario, A. J. L. , Paulsen, I. , Pritchett, M. , Sowers, K. R. , Swanson, R. V. , Zinder, S. H. , Lander, E. , Metcalf, W. W. , and Birren, B. , The genome of M. acetivorans reveals extensive metabolic and physiological diversity., Genome Res, vol. 12, no. 4, pp. 532-42, 2002.
D. Singh, Febbo, P. G. , Ross, K. , Jackson, D. G. , Manola, J. , Ladd, C. , Tamayo, P. , Renshaw, A. A. , D'Amico, A. V. , Richie, J. P. , Lander, E. S. , Loda, M. , Kantoff, P. W. , Golub, T. R. , and Sellers, W. R. , Gene expression correlates of clinical prostate cancer behavior., Cancer Cell, vol. 1, no. 2, pp. 203-9, 2002.
G. J. Nau, Richmond, J. F. L. , Schlesinger, A. , Jennings, E. G. , Lander, E. S. , and Young, R. A. , Human macrophage activation programs induced by bacterial pathogens., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 99, no. 3, pp. 1503-8, 2002.
C. M. Lindgren, Mahtani, M. M. , Widen, E. , McCarthy, M. I. , Daly, M. J. , Kirby, A. , Reeve, M. P. , Kruglyak, L. , Parker, A. , Meyer, J. , Almgren, P. , Lehto, M. , Kanninen, T. , Tuomi, T. , Groop, L. C. , and Lander, E. S. , Genomewide search for type 2 diabetes mellitus susceptibility loci in Finnish families: the Botnia study., Am J Hum Genet, vol. 70, no. 2, pp. 509-16, 2002.
A. A. Ferrando, Neuberg, D. S. , Staunton, J. , Loh, M. L. , Huard, C. , Raimondi, S. C. , Behm, F. G. , Pui, C. Hon, Downing, J. R. , D Gilliland, G. , Lander, E. S. , Golub, T. R. , and A Look, T. , Gene expression signatures define novel oncogenic pathways in T cell acute lymphoblastic leukemia., Cancer Cell, vol. 1, no. 1, pp. 75-87, 2002.
S. L. Pomeroy, Tamayo, P. , Gaasenbeek, M. , Sturla, L. M. , Angelo, M. , McLaughlin, M. E. , Kim, J. Y. H. , Goumnerova, L. C. , Black, P. M. , Lau, C. , Allen, J. C. , Zagzag, D. , Olson, J. M. , Curran, T. , Wetmore, C. , Biegel, J. A. , Poggio, T. , Mukherjee, S. , Rifkin, R. , Califano, A. , Stolovitzky, G. , Louis, D. N. , Mesirov, J. P. , Lander, E. S. , and Golub, T. R. , Prediction of central nervous system embryonal tumour outcome based on gene expression., Nature, vol. 415, no. 6870, pp. 436-42, 2002.
M. A. Shipp, Ross, K. N. , Tamayo, P. , Weng, A. P. , Kutok, J. L. , Aguiar, R. C. T. , Gaasenbeek, M. , Angelo, M. , Reich, M. , Pinkus, G. S. , Ray, T. S. , Koval, M. A. , Last, K. W. , Norton, A. , T Lister, A. , Mesirov, J. , Neuberg, D. S. , Lander, E. S. , Aster, J. C. , and Golub, T. R. , Diffuse large B-cell lymphoma outcome prediction by gene-expression profiling and supervised machine learning., Nat Med, vol. 8, no. 1, pp. 68-74, 2002.
P. Sklar, Gabriel, S. B. , McInnis, M. G. , Bennett, P. , Lim, Y. - M. , Tsan, G. , Schaffner, S. , Kirov, G. , Jones, I. , Owen, M. , Craddock, N. , DePaulo, J. R. , and Lander, E. S. , Family-based association study of 76 candidate genes in bipolar disorder: BDNF is a potential risk locus. Brain-derived neutrophic factor., Mol Psychiatry, vol. 7, no. 6, pp. 579-93, 2002.
S. Batzoglou, Jaffe, D. B. , Stanley, K. , Butler, J. , Gnerre, S. , Mauceli, E. , Berger, B. , Mesirov, J. P. , and Lander, E. S. , ARACHNE: a whole-genome shotgun assembler., Genome Res, vol. 12, no. 1, pp. 177-89, 2002.
Q. Huang, Liu, D. , Majewski, P. , Schulte, L. C. , Korn, J. M. , Young, R. A. , Lander, E. S. , and Hacohen, N. , The plasticity of dendritic cell responses to pathogens and their components., Science, vol. 294, no. 5543, pp. 870-5, 2001.
M. J. Daly, Rioux, J. D. , Schaffner, S. F. , Hudson, T. J. , and Lander, E. S. , High-resolution haplotype structure in the human genome., Nat Genet, vol. 29, no. 2, pp. 229-32, 2001.
J. D. Rioux, Daly, M. J. , Silverberg, M. S. , Lindblad, K. , Steinhart, H. , Cohen, Z. , DelMonte, T. , Kocher, K. , Miller, K. , Guschwan, S. , Kulbokas, E. J. , O'Leary, S. , Winchester, E. , Dewar, K. , Green, T. , Stone, V. , Chow, C. , Cohen, A. , Langelier, D. , Lapointe, G. , Gaudet, D. , Faith, J. , Branco, N. , Bull, S. B. , McLeod, R. S. , Griffiths, A. M. , Bitton, A. , Greenberg, G. R. , Lander, E. S. , Siminovitch, K. A. , and Hudson, T. J. , Genetic variation in the 5q31 cytokine gene cluster confers susceptibility to Crohn disease., Nat Genet, vol. 29, no. 2, pp. 223-8, 2001.
T. J. Hudson, Church, D. M. , Greenaway, S. , Nguyen, H. , Cook, A. , Steen, R. G. , Van Etten, W. J. , Castle, A. B. , Strivens, M. A. , Trickett, P. , Heuston, C. , Davison, C. , Southwell, A. , Hardisty, R. , Varela-Carver, A. , Haynes, A. R. , Rodriguez-Tome, P. , Doi, H. , Ko, M. S. , Pontius, J. , Schriml, L. , Wagner, L. , Maglott, D. , Brown, S. D. , Lander, E. S. , Schuler, G. , and Denny, P. , A radiation hybrid map of mouse genes., Nat Genet, vol. 29, no. 2, pp. 201-5, 2001.
K. Ardlie, Liu-Cordero, S. N. , Eberle, M. A. , Daly, M. , Barrett, J. , Winchester, E. , Lander, E. S. , and Kruglyak, L. , Lower-than-expected linkage disequilibrium between tightly linked markers in humans suggests a role for gene conversion., Am J Hum Genet, vol. 69, no. 3, pp. 582-9, 2001.
J. Barclay, Balaguero, N. , Mione, M. , Ackerman, S. L. , Letts, V. A. , Brodbeck, J. , Canti, C. , Meir, A. , Page, K. M. , Kusumi, K. , Perez-Reyes, E. , Lander, E. S. , Frankel, W. N. , Gardiner, R. M. , Dolphin, A. C. , and Rees, M. , Ducky mouse phenotype of epilepsy and ataxia is associated with mutations in the Cacna2d2 gene and decreased calcium channel current in cerebellar Purkinje cells., J Neurosci, vol. 21, no. 16, pp. 6095-104, 2001.
J. N. Hirschhorn, Lindgren, C. M. , Daly, M. J. , Kirby, A. , Schaffner, S. F. , Burtt, N. P. , Altshuler, D. , Parker, A. , Rioux, J. D. , Platko, J. , Gaudet, D. , Hudson, T. J. , Groop, L. C. , and Lander, E. S. , Genomewide linkage analysis of stature in multiple populations reveals several regions with evidence of linkage to adult height., Am J Hum Genet, vol. 69, no. 1, pp. 106-16, 2001.
C. Sweeney, Fambrough, D. , Huard, C. , Diamonti, A. J. , Lander, E. S. , Cantley, L. C. , and Carraway, K. L. , Growth factor-specific signaling pathway stimulation and gene expression mediated by ErbB receptors., J Biol Chem, vol. 276, no. 25, pp. 22685-98, 2001.
P. Sklar, Schwab, S. G. , Williams, N. M. , Daly, M. , Schaffner, S. , Maier, W. , Albus, M. , Trixler, M. , Eichhammer, P. , Lerer, B. , Hallmayer, J. , Norton, N. , Williams, H. , Zammit, S. , Cardno, A. G. , Jones, S. , McCarthy, G. , Milanova, V. , Kirov, G. , O'Donovan, M. C. , Lander, E. S. , Owen, M. J. , and Wildenauer, D. B. , Association analysis of NOTCH4 loci in schizophrenia using family and population-based controls., Nat Genet, vol. 28, no. 2, pp. 126-8, 2001.
T. Laitinen, Daly, M. J. , Rioux, J. D. , Kauppi, P. , Laprise, C. , Petäys, T. , Green, T. , Cargill, M. , Haahtela, T. , Lander, E. S. , Laitinen, L. A. , Hudson, T. J. , and Kere, J. , A susceptibility locus for asthma-related traits on chromosome 7 revealed by genome-wide scan in a founder population., Nat Genet, vol. 28, no. 1, pp. 87-91, 2001.
K. H. Hong, Bonventre, J. C. , O'Leary, E. , Bonventre, J. V. , and Lander, E. S. , Deletion of cytosolic phospholipase A(2) suppresses Apc(Min)-induced tumorigenesis., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 98, no. 7, pp. 3935-9, 2001.
L. Bartoloni, Blouin, J. L. , Maiti, A. K. , Sainsbury, A. , Rossier, C. , Gehrig, C. , She, J. X. , Marron, M. P. , Lander, E. S. , Meeks, M. , Chung, E. , Armengot, M. , Jorissen, M. , Scott, H. S. , Delozier-Blanchet, C. D. , Gardiner, R. M. , and Antonarakis, S. E. , Axonemal beta heavy chain dynein DNAH9: cDNA sequence, genomic structure, and investigation of its role in primary ciliary dyskinesia., Genomics, vol. 72, no. 1, pp. 21-33, 2001.
R. Sachidanandam, Weissman, D. , Schmidt, S. C. , Kakol, J. M. , Stein, L. D. , Marth, G. , Sherry, S. , Mullikin, J. C. , Mortimore, B. J. , Willey, D. L. , Hunt, S. E. , Cole, C. G. , Coggill, P. C. , Rice, C. M. , Ning, Z. , Rogers, J. , Bentley, D. R. , Kwok, P. Y. , Mardis, E. R. , Yeh, R. T. , Schultz, B. , Cook, L. , Davenport, R. , Dante, M. , Fulton, L. , Hillier, L. , Waterston, R. H. , McPherson, J. D. , Gilman, B. , Schaffner, S. , Van Etten, W. J. , Reich, D. , Higgins, J. , Daly, M. J. , Blumenstiel, B. , Baldwin, J. , Stange-Thomann, N. , Zody, M. C. , Linton, L. , Lander, E. S. , and Altshuler, D. , A map of human genome sequence variation containing 1.42 million single nucleotide polymorphisms., Nature, vol. 409, no. 6822, pp. 928-33, 2001.
H. C. Causton, Ren, B. , Koh, S. S. , Harbison, C. T. , Kanin, E. , Jennings, E. G. , Lee, T. I. , True, H. L. , Lander, E. S. , and Young, R. A. , Remodeling of yeast genome expression in response to environmental changes., Mol Biol Cell, vol. 12, no. 2, pp. 323-37, 2001.
N. Lee, Daly, M. J. , DelMonte, T. , Lander, E. S. , Xu, F. , Hudson, T. J. , Mitchell, G. A. , Morin, C. C. , Robinson, B. H. , and Rioux, J. D. , A genomewide linkage-disequilibrium scan localizes the Saguenay-Lac-Saint-Jean cytochrome oxidase deficiency to 2p16., Am J Hum Genet, vol. 68, no. 2, pp. 397-409, 2001.
C. H. Yeang, Ramaswamy, S. , Tamayo, P. , Mukherjee, S. , Rifkin, R. M. , Angelo, M. , Reich, M. , Lander, E. , Mesirov, J. , and Golub, T. , Molecular classification of multiple tumor types., Bioinformatics, vol. 17 Suppl 1, pp. S316-22, 2001.
L. Jackson-Grusby, Beard, C. , Possemato, R. , Tudor, M. , Fambrough, D. , Csankovszki, G. , Dausman, J. , Lee, P. , Wilson, C. , Lander, E. , and Jaenisch, R. , Loss of genomic methylation causes p53-dependent apoptosis and epigenetic deregulation., Nat Genet, vol. 27, no. 1, pp. 31-9, 2001.
P. Pajukanta, Cargill, M. , Viitanen, L. , Nuotio, I. , Kareinen, A. , Perola, M. , Terwilliger, J. D. , Kempas, E. , Daly, M. , Lilja, H. , Rioux, J. D. , Brettin, T. , Viikari, J. S. , Rönnemaa, T. , Laakso, M. , Lander, E. S. , and Peltonen, L. , Two loci on chromosomes 2 and X for premature coronary heart disease identified in early- and late-settlement populations of Finland., Am J Hum Genet, vol. 67, no. 6, pp. 1481-93, 2000.
J. N. Hirschhorn, Sklar, P. , Lindblad-Toh, K. , Lim, Y. M. , Ruiz-Gutierrez, M. , Bolk, S. , Langhorst, B. , Schaffner, S. , Winchester, E. , and Lander, E. S. , SBE-TAGS: an array-based method for efficient single-nucleotide polymorphism genotyping., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 97, no. 22, pp. 12164-9, 2000.
D. Altshuler, Pollara, V. J. , Cowles, C. R. , Van Etten, W. J. , Baldwin, J. , Linton, L. , and Lander, E. S. , An SNP map of the human genome generated by reduced representation shotgun sequencing., Nature, vol. 407, no. 6803, pp. 513-6, 2000.
D. Altshuler, Hirschhorn, J. N. , Klannemark, M. , Lindgren, C. M. , Vohl, M. C. , Nemesh, J. , Lane, C. R. , Schaffner, S. F. , Bolk, S. , Brewer, C. , Tuomi, T. , Gaudet, D. , Hudson, T. J. , Daly, M. , Groop, L. , and Lander, E. S. , The common PPARgamma Pro12Ala polymorphism is associated with decreased risk of type 2 diabetes., Nat Genet, vol. 26, no. 1, pp. 76-80, 2000.
E. A. Clark, Golub, T. R. , Lander, E. S. , and Hynes, R. O. , Genomic analysis of metastasis reveals an essential role for RhoC., Nature, vol. 406, no. 6795, pp. 532-5, 2000.
J. D. Rioux, Silverberg, M. S. , Daly, M. J. , Steinhart, A. H. , McLeod, R. S. , Griffiths, A. M. , Green, T. , Brettin, T. S. , Stone, V. , Bull, S. B. , Bitton, A. , Williams, C. N. , Greenberg, G. R. , Cohen, Z. , Lander, E. S. , Hudson, T. J. , and Siminovitch, K. A. , Genomewide search in Canadian families with inflammatory bowel disease reveals two novel susceptibility loci., Am J Hum Genet, vol. 66, no. 6, pp. 1863-70, 2000.
K. Lindblad-Toh, Winchester, E. , Daly, M. J. , Wang, D. G. , Hirschhorn, J. N. , Laviolette, J. P. , Ardlie, K. , Reich, D. E. , Robinson, E. , Sklar, P. , Shah, N. , Thomas, D. , Fan, J. B. , Gingeras, T. , Warrington, J. , Patil, N. , Hudson, T. J. , and Lander, E. S. , Large-scale discovery and genotyping of single-nucleotide polymorphisms in the mouse., Nat Genet, vol. 24, no. 4, pp. 381-6, 2000.
M. P. Bulman, Kusumi, K. , Frayling, T. M. , McKeown, C. , Garrett, C. , Lander, E. S. , Krumlauf, R. , Hattersley, A. T. , Ellard, S. , and Turnpenny, P. D. , Mutations in the human delta homologue, DLL3, cause axial skeletal defects in spondylocostal dysostosis., Nat Genet, vol. 24, no. 4, pp. 438-41, 2000.
J. H. Nadeau, Singer, J. B. , Matin, A. , and Lander, E. S. , Analysing complex genetic traits with chromosome substitution strains., Nat Genet, vol. 24, no. 3, pp. 221-5, 2000.
J. C. Engert, Bérubé, P. , Mercier, J. , Doré, C. , Lepage, P. , Ge, B. , Bouchard, J. P. , Mathieu, J. , Melançon, S. B. , Schalling, M. , Lander, E. S. , Morgan, K. , Hudson, T. J. , and Richter, A. , ARSACS, a spastic ataxia common in northeastern Québec, is caused by mutations in a new gene encoding an 11.5-kb ORF., Nat Genet, vol. 24, no. 2, pp. 120-5, 2000.
E. S. Lander, Genomics: launching a revolution in medicine., J Law Med Ethics, vol. 28, no. 4 Suppl, pp. 3-14, 2000.
S. Batzoglou, Berger, B. , Mesirov, J. , and Lander, E. S. , Sequencing a genome by walking with clone-end sequences: a mathematical analysis., Genome Res, vol. 9, no. 12, pp. 1163-74, 1999.
G. T. De Sanctis, Singer, J. B. , Jiao, A. , Yandava, C. N. , Lee, Y. H. , Haynes, T. C. , Lander, E. S. , Beier, D. R. , and Drazen, J. M. , Quantitative trait locus mapping of airway responsiveness to chromosomes 6 and 7 in inbred mice., Am J Physiol, vol. 277, no. 6 Pt 1, pp. L1118-23, 1999.
J. J. Wyrick, Holstege, F. C. , Jennings, E. G. , Causton, H. C. , Shore, D. , Grunstein, M. , Lander, E. S. , and Young, R. A. , Chromosomal landscape of nucleosome-dependent gene expression and silencing in yeast., Nature, vol. 402, no. 6760, pp. 418-21, 1999.
L. S. Klaff, Koike, G. , Jiang, J. , Wang, Y. , Bieg, S. , Pettersson, A. , Lander, E. , Jacob, H. , and Lernmark, A. , BB rat diabetes susceptibility and body weight regulation genes colocalize on chromosome 2., Mamm Genome, vol. 10, no. 9, pp. 883-7, 1999.
A. Sidow, Bulotsky, M. S. , Kerrebrock, A. W. , Birren, B. W. , Altshuler, D. , Jaenisch, R. , Johnson, K. R. , and Lander, E. S. , A novel member of the F-box/WD40 gene family, encoding dactylin, is disrupted in the mouse dactylaplasia mutant., Nat Genet, vol. 23, no. 1, pp. 104-7, 1999.
J. Hästbacka, Kerrebrock, A. , Mokkala, K. , Clines, G. , Lovett, M. , Kaitila, I. , de la Chapelle, A. , and Lander, E. S. , Identification of the Finnish founder mutation for diastrophic dysplasia (DTD)., Eur J Hum Genet, vol. 7, no. 6, pp. 664-70, 1999.
C. Nusbaum, Slonim, D. K. , Harris, K. L. , Birren, B. W. , Steen, R. G. , Stein, L. D. , Miller, J. , Dietrich, W. F. , Nahf, R. , Wang, V. , Merport, O. , Castle, A. B. , Husain, Z. , Farino, G. , Gray, D. , Anderson, M. O. , Devine, R. , Horton, L. T. , Ye, W. , Wu, X. , Kouyoumjian, V. , Zemsteva, I. S. , Wu, Y. , Collymore, A. J. , Courtney, D. F. , Tam, J. , Cadman, M. , Haynes, A. R. , Heuston, C. , Marsland, T. , Southwell, A. , Trickett, P. , Strivens, M. A. , Ross, M. T. , Makalowski, W. , Xu, Y. , Boguski, M. S. , Carter, N. P. , Denny, P. , Brown, S. D. , Hudson, T. J. , and Lander, E. S. , A YAC-based physical map of the mouse genome., Nat Genet, vol. 22, no. 4, pp. 388-93, 1999.
W. J. Van Etten, Steen, R. G. , Nguyen, H. , Castle, A. B. , Slonim, D. K. , Ge, B. , Nusbaum, C. , Schuler, G. D. , Lander, E. S. , and Hudson, T. J. , Radiation hybrid map of the mouse genome., Nat Genet, vol. 22, no. 4, pp. 384-7, 1999.
M. Cargill, Altshuler, D. , Ireland, J. , Sklar, P. , Ardlie, K. , Patil, N. , Shaw, N. , Lane, C. R. , Lim, E. P. , Kalyanaraman, N. , Nemesh, J. , Ziaugra, L. , Friedland, L. , Rolfe, A. , Warrington, J. , Lipshutz, R. , Daley, G. Q. , and Lander, E. S. , Characterization of single-nucleotide polymorphisms in coding regions of human genes., Nat Genet, vol. 22, no. 3, pp. 231-8, 1999.
D. Pfeifer, Kist, R. , Dewar, K. , Devon, K. , Lander, E. S. , Birren, B. , Korniszewski, L. , Back, E. , and Scherer, G. , Campomelic dysplasia translocation breakpoints are scattered over 1 Mb proximal to SOX9: evidence for an extended control region., Am J Hum Genet, vol. 65, no. 1, pp. 111-24, 1999.
J. G. Hacia, Fan, J. B. , Ryder, O. , Jin, L. , Edgemon, K. , Ghandour, G. , Mayer, R. A. , Sun, B. , Hsie, L. , Robbins, C. M. , Brody, L. C. , Wang, D. , Lander, E. S. , Lipshutz, R. , Fodor, S. P. , and Collins, F. S. , Determination of ancestral alleles for human single-nucleotide polymorphisms using high-density oligonucleotide arrays., Nat Genet, vol. 22, no. 2, pp. 164-7, 1999.
R. G. Steen, Kwitek-Black, A. E. , Glenn, C. , Gullings-Handley, J. , Van Etten, W. , Atkinson, O. S. , Appel, D. , Twigger, S. , Muir, M. , Mull, T. , Granados, M. , Kissebah, M. , Russo, K. , Crane, R. , Popp, M. , Peden, M. , Matise, T. , Brown, D. M. , Lu, J. , Kingsmore, S. , Tonellato, P. J. , Rozen, S. , Slonim, D. , Young, P. , and Jacob, H. J. , A high-density integrated genetic linkage and radiation hybrid map of the laboratory rat., Genome Res, vol. 9, no. 6, pp. AP1-8, insert, 1999.
P. Tamayo, Slonim, D. , Mesirov, J. , Zhu, Q. , Kitareewan, S. , Dmitrovsky, E. , Lander, E. S. , and Golub, T. R. , Interpreting patterns of gene expression with self-organizing maps: methods and application to hematopoietic differentiation., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 96, no. 6, pp. 2907-12, 1999.
T. Klockars, Holmberg, V. , Savukoski, M. , Lander, E. S. , and Peltonen, L. , Transcript identification on the CLN5 region on chromosome 13q22., Hum Genet, vol. 105, no. 1-2, pp. 51-6, 1999.
H. Pardes, Manton, K. G. , Lander, E. S. , Tolley, H. D. , Ullian, A. D. , and Palmer, H. , Effects of medical research on health care and economy., Science, vol. 283, no. 5398, pp. 36-7, 1999.
L. Pachter, Batzoglou, S. , Spitkovsky, V. I. , Banks, E. , Lander, E. S. , Kleitman, D. J. , and Berger, B. , A dictionary-based approach for gene annotation., J Comput Biol, vol. 6, no. 3-4, pp. 419-30, 1999.
F. C. Holstege, Jennings, E. G. , Wyrick, J. J. , Lee, T. I. , Hengartner, C. J. , Green, M. R. , Golub, T. R. , Lander, E. S. , and Young, R. A. , Dissecting the regulatory circuitry of a eukaryotic genome., Cell, vol. 95, no. 5, pp. 717-28, 1998.
J. D. Rioux, Daly, M. J. , Green, T. , Stone, V. , Lander, E. S. , Hudson, T. J. , Steinhart, A. H. , Bull, S. , Cohen, Z. , Greenberg, G. , Griffiths, A. , McLeod, R. , Silverberg, M. , Williams, C. N. , and Siminovitch, K. A. , Absence of linkage between inflammatory bowel disease and selected loci on chromosomes 3, 7, 12, and 16., Gastroenterology, vol. 115, no. 5, pp. 1062-5, 1998.
P. Deloukas, Schuler, G. D. , Gyapay, G. , Beasley, E. M. , Soderlund, C. , Rodriguez-Tome, P. , Hui, L. , Matise, T. C. , McKusick, K. B. , Beckmann, J. S. , Bentolila, S. , Bihoreau, M. , Birren, B. B. , Browne, J. , Butler, A. , Castle, A. B. , Chiannilkulchai, N. , Clee, C. , Day, P. J. , Dehejia, A. , Dibling, T. , Drouot, N. , Duprat, S. , Fizames, C. , Fox, S. , Gelling, S. , Green, L. , Harrison, P. , Hocking, R. , Holloway, E. , Hunt, S. , Keil, S. , Lijnzaad, P. , Louis-Dit-Sully, C. , Ma, J. , Mendis, A. , Miller, J. , Morissette, J. , Muselet, D. , Nusbaum, H. C. , Peck, A. , Rozen, S. , Simon, D. , Slonim, D. K. , Staples, R. , Stein, L. D. , Stewart, E. A. , Suchard, M. A. , Thangarajah, T. , Vega-Czarny, N. , Webber, C. , Wu, X. , Hudson, J. , Auffray, C. , Nomura, N. , Sikela, J. M. , Polymeropoulos, M. H. , James, M. R. , Lander, E. S. , Hudson, T. J. , Myers, R. M. , Cox, D. R. , Weissenbach, J. , Boguski, M. S. , and Bentley, D. R. , A physical map of 30,000 human genes., Science, vol. 282, no. 5389, pp. 744-6, 1998.
J. D. Rioux, Stone, V. A. , Daly, M. J. , Cargill, M. , Green, T. , Nguyen, H. , Nutman, T. , Zimmerman, P. A. , Tucker, M. A. , Hudson, T. , Goldstein, A. M. , Lander, E. , and Lin, A. Y. , Familial eosinophilia maps to the cytokine gene cluster on human chromosomal region 5q31-q33., Am J Hum Genet, vol. 63, no. 4, pp. 1086-94, 1998.
C. Ober, Cox, N. J. , Abney, M. , Di Rienzo, A. , Lander, E. S. , Changyaleket, B. , Gidley, H. , Kurtz, B. , Lee, J. , Nance, M. , Pettersson, A. , Prescott, J. , Richardson, A. , Schlenker, E. , Summerhill, E. , Willadsen, S. , and Parry, R. , Genome-wide search for asthma susceptibility loci in a founder population. The Collaborative Study on the Genetics of Asthma., Hum Mol Genet, vol. 7, no. 9, pp. 1393-8, 1998.
D. M. Brown, Matise, T. C. , Koike, G. , Simon, J. S. , Winer, E. S. , Zangen, S. , McLaughlin, M. G. , Shiozawa, M. , Atkinson, O. S. , Hudson, J. R. , Chakravarti, A. , Lander, E. S. , and Jacob, H. J. , An integrated genetic linkage map of the laboratory rat., Mamm Genome, vol. 9, no. 7, pp. 521-30, 1998.
K. Kusumi, Sun, E. S. , Kerrebrock, A. W. , Bronson, R. T. , Chi, D. C. , Bulotsky, M. S. , Spencer, J. B. , Birren, B. W. , Frankel, W. N. , and Lander, E. S. , The mouse pudgy mutation disrupts Delta homologue Dll3 and initiation of early somite boundaries., Nat Genet, vol. 19, no. 3, pp. 274-8, 1998.
D. G. Wang, Fan, J. B. , Siao, C. J. , Berno, A. , Young, P. , Sapolsky, R. , Ghandour, G. , Perkins, N. , Winchester, E. , Spencer, J. , Kruglyak, L. , Stein, L. , Hsie, L. , Topaloglou, T. , Hubbell, E. , Robinson, E. , Mittmann, M. , Morris, M. S. , Shen, N. , Kilburn, D. , Rioux, J. , Nusbaum, C. , Rozen, S. , Hudson, T. J. , Lipshutz, R. , Chee, M. , and Lander, E. S. , Large-scale identification, mapping, and genotyping of single-nucleotide polymorphisms in the human genome., Science, vol. 280, no. 5366, pp. 1077-82, 1998.
S. Bieg, Koike, G. , Jiang, J. , Klaff, L. , Pettersson, A. , MacMurray, A. J. , Jacob, H. J. , Lander, E. S. , and Lernmark, A. , Genetic isolation of iddm 1 on chromosome 4 in the biobreeding (BB) rat., Mamm Genome, vol. 9, no. 4, pp. 324-6, 1998.
T. P. Zhong, Kaphingst, K. , Akella, U. , Haldi, M. , Lander, E. S. , and Fishman, M. C. , Zebrafish Genomic Library in Yeast Artificial Chromosomes, Genomics, vol. 48, no. 1, pp. 136-8, 1998.
M. I. McCarthy, Kruglyak, L. , and Lander, E. S. , Sib-pair collection strategies for complex diseases., Genet Epidemiol, vol. 15, no. 4, pp. 317-40, 1998.
S. Kuokkanen, Gschwend, M. , Rioux, J. D. , Daly, M. J. , Terwilliger, J. D. , Tienari, P. J. , Wikström, J. , Palo, J. , Stein, L. D. , Hudson, T. J. , Lander, E. S. , and Peltonen, L. , Genomewide scan of multiple sclerosis in Finnish multiplex families., Am J Hum Genet, vol. 61, no. 6, pp. 1379-87, 1997.
T. Laitinen, Kauppi, P. , Ignatius, J. , Ruotsalainen, T. , Daly, M. J. , Kääriäinen, H. , Kruglyak, L. , Laitinen, H. , de la Chapelle, A. , Lander, E. S. , Laitinen, L. A. , and Kere, J. , Genetic control of serum IgE levels and asthma: linkage and linkage disequilibrium studies in an isolated population., Hum Mol Genet, vol. 6, no. 12, pp. 2069-76, 1997.
A. Sidow, Bulotsky, M. S. , Kerrebrock, A. W. , Bronson, R. T. , Daly, M. J. , Reeve, M. P. , Hawkins, T. L. , Birren, B. W. , Jaenisch, R. , and Lander, E. S. , Serrate2 is disrupted in the mouse limb-development mutant syndactylism., Nature, vol. 389, no. 6652, pp. 722-5, 1997.
Y. P. Shi, Mohapatra, G. , Miller, J. , Hanahan, D. , Lander, E. , Gold, P. , Pinkel, D. , and Gray, J. , FISH probes for mouse chromosome identification., Genomics, vol. 45, no. 1, pp. 42-7, 1997.
A. Fazeli, Steen, R. G. , Dickinson, S. L. , Bautista, D. , Dietrich, W. F. , Bronson, R. T. , Bresalier, R. S. , Lander, E. S. , Costa, J. , and Weinberg, R. A. , Effects of p53 mutations on apoptosis in mouse intestinal and human colonic adenomas., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 94, no. 19, pp. 10199-204, 1997.
R. T. Cormier, Hong, K. H. , Halberg, R. B. , Hawkins, T. L. , Richardson, P. , Mulherkar, R. , Dove, W. F. , and Lander, E. S. , Secretory phospholipase Pla2g2a confers resistance to intestinal tumorigenesis., Nat Genet, vol. 17, no. 1, pp. 88-91, 1997.
T. L. Hawkins, McKernan, K. J. , Jacotot, L. B. , MacKenzie, J. B. , Richardson, P. M. , and Lander, E. S. , A magnetic attraction to high-throughput genomics., Science, vol. 276, no. 5320, pp. 1887-9, 1997.
M. L. Haldi, Lim, P. , Kaphingst, K. , Akella, U. , Whang, J. , and Lander, E. S. , Construction of a large-insert yeast artificial chromosome library of the rat genome, Mamm Genome, vol. 8, no. 6, p. 460, 1997.
B. A. Hamilton, Smith, D. J. , Mueller, K. L. , Kerrebrock, A. W. , Bronson, R. T. , van Berkel, V. , Daly, M. J. , Kruglyak, L. , Reeve, M. P. , Nemhauser, J. L. , Hawkins, T. L. , Rubin, E. M. , and Lander, E. S. , The vibrator mutation causes neurodegeneration via reduced expression of PITP alpha: positional complementation cloning and extragenic suppression., Neuron, vol. 18, no. 5, pp. 711-22, 1997.
M. Lehto, Tuomi, T. , Mahtani, M. M. , Widen, E. , Forsblom, C. , Sarelin, L. , Gullström, M. , Isomaa, B. , Lehtovirta, M. , Hyrkkö, A. , Kanninen, T. , Orho, M. , Manley, S. , Turner, R. C. , Brettin, T. , Kirby, A. , Thomas, J. , Duyk, G. , Lander, E. , Taskinen, M. R. , and Groop, L. , Characterization of the MODY3 phenotype. Early-onset diabetes caused by an insulin secretion defect., J Clin Invest, vol. 99, no. 4, pp. 582-91, 1997.
D. Slonim, Kruglyak, L. , Stein, L. , and Lander, E. , Building human genome maps with radiation hybrids., J Comput Biol, vol. 4, no. 4, pp. 487-504, 1997.
K. A. Gould, Dietrich, W. F. , Borenstein, N. , Lander, E. S. , and Dove, W. F. , Mom1 is a semi-dominant modifier of intestinal adenoma size and multiplicity in Min/+ mice., Genetics, vol. 144, no. 4, pp. 1769-76, 1996.
K. A. Gould, Luongo, C. , Moser, A. R. , McNeley, M. K. , Borenstein, N. , Shedlovsky, A. , Dove, W. F. , Hong, K. , Dietrich, W. F. , and Lander, E. S. , Genetic evaluation of candidate genes for the Mom1 modifier of intestinal neoplasia in mice., Genetics, vol. 144, no. 4, pp. 1777-85, 1996.
E. S. Lander, The new genomics: global views of biology., Science, vol. 274, no. 5287, pp. 536-9, 1996.
M. L. Haldi, Strickland, C. , Lim, P. , VanBerkel, V. , Chen, X. , Noya, D. , Korenberg, J. R. , Husain, Z. , Miller, J. , and Lander, E. S. , A comprehensive large-insert yeast artificial chromosome library for physical mapping of the mouse genome., Mamm Genome, vol. 7, no. 10, pp. 767-9, 1996.
M. M. Mahtani, Widen, E. , Lehto, M. , Thomas, J. , McCarthy, M. , Brayer, J. , Bryant, B. , Chan, G. , Daly, M. , Forsblom, C. , Kanninen, T. , Kirby, A. , Kruglyak, L. , Munnelly, K. , Parkkonen, M. , Reeve-Daly, M. P. , Weaver, A. , Brettin, T. , Duyk, G. , Lander, E. S. , and Groop, L. C. , Mapping of a gene for type 2 diabetes associated with an insulin secretion defect by a genome scan in Finnish families., Nat Genet, vol. 14, no. 1, pp. 90-4, 1996.
A. Navin, Prekeris, R. , Lisitsyn, N. A. , Sonti, M. M. , Grieco, D. A. , Narayanswami, S. , Lander, E. S. , and Simpson, E. M. , Mouse Y-specific repeats isolated by whole chromosome representational difference analysis., Genomics, vol. 36, no. 2, pp. 349-53, 1996.
M. Gschwend, Levran, O. , Kruglyak, L. , Ranade, K. , Verlander, P. C. , Shen, S. , Faure, S. , Weissenbach, J. , Altay, C. , Lander, E. S. , Auerbach, A. D. , and Botstein, D. , A locus for Fanconi anemia on 16q determined by homozygosity mapping., Am J Hum Genet, vol. 59, no. 2, pp. 377-84, 1996.
A. Superti-Furga, Hästbacka, J. , Rossi, A. , van der Harten, J. J. , Wilcox, W. R. , Cohn, D. H. , Rimoin, D. L. , Steinmann, B. , Lander, E. S. , and Gitzelmann, R. , A family of chondrodysplasias caused by mutations in the diastrophic dysplasia sulfate transporter gene and associated with impaired sulfation of proteoglycans., Ann N Y Acad Sci, vol. 785, pp. 195-201, 1996.
L. Kruglyak, Daly, M. J. , Reeve-Daly, M. P. , and Lander, E. S. , Parametric and nonparametric linkage analysis: a unified multipoint approach., Am J Hum Genet, vol. 58, no. 6, pp. 1347-63, 1996.
H. Kurooka, Segre, J. A. , Hirano, Y. , Nemhauser, J. L. , Nishimura, H. , Yoneda, K. , Lander, E. S. , and Honjo, T. , Rescue of the hairless phenotype in nude mice by transgenic insertion of the wild-type Hfh11 genomic locus., Int Immunol, vol. 8, no. 6, pp. 961-6, 1996.
L. Kruglyak and Lander, E. S. , Limits on fine mapping of complex traits., Am J Hum Genet, vol. 58, no. 5, pp. 1092-3, 1996.
W. F. Dietrich, Miller, J. , Steen, R. , Merchant, M. A. , Damron-Boles, D. , Husain, Z. , Dredge, R. , Daly, M. J. , Ingalls, K. A. , and O'Connor, T. J. , A comprehensive genetic map of the mouse genome., Nature, vol. 380, no. 6570, pp. 149-52, 1996.
B. A. Hamilton, Frankel, W. N. , Kerrebrock, A. W. , Hawkins, T. L. , FitzHugh, W. , Kusumi, K. , Russell, L. B. , Mueller, K. L. , van Berkel, V. , Birren, B. W. , Kruglyak, L. , and Lander, E. S. , Disruption of the nuclear hormone receptor RORalpha in staggerer mice., Nature, vol. 379, no. 6567, pp. 736-9, 1996.
J. Galli, Li, L. S. , Glaser, A. , Ostenson, C. G. , Jiao, H. , Fakhrai-Rad, H. , Jacob, H. J. , Lander, E. S. , and Luthman, H. , Genetic analysis of non-insulin dependent diabetes mellitus in the GK rat., Nat Genet, vol. 12, no. 1, pp. 31-7, 1996.
A. Superti-Furga, Hästbacka, J. , Wilcox, W. R. , Cohn, D. H. , van der Harten, H. J. , Rossi, A. , Blau, N. , Rimoin, D. L. , Steinmann, B. , Lander, E. S. , and Gitzelmann, R. , Achondrogenesis type IB is caused by mutations in the diastrophic dysplasia sulphate transporter gene., Nat Genet, vol. 12, no. 1, pp. 100-2, 1996.
I. M. Chumakov, Rigault, P. , Le Gall, I. , Bellanné-Chantelot, C. , Billault, A. , Guillou, S. , Soularue, P. , Guasconi, G. , Poullier, E. , and Gros, I. , A YAC contig map of the human genome., Nature, vol. 377, no. 6547 Suppl, pp. 175-297, 1995.
A. Pettersson, Wilson, D. , Daniels, T. , Tobin, S. , Jacob, H. J. , Lander, E. S. , and Lernmark, A. , Thyroiditis in the BB rat is associated with lymphopenia but occurs independently of diabetes., J Autoimmun, vol. 8, no. 4, pp. 493-505, 1995.
L. Kruglyak and Lander, E. S. , High-resolution genetic mapping of complex traits., Am J Hum Genet, vol. 56, no. 5, pp. 1212-23, 1995.
H. J. Jacob, Brown, D. M. , Bunker, R. K. , Daly, M. J. , Dzau, V. J. , Goodman, A. , Koike, G. , Kren, V. , Kurtz, T. , and Lernmark, A. , A genetic linkage map of the laboratory rat, Rattus norvegicus., Nat Genet, vol. 9, no. 1, pp. 63-9, 1995.
C. J. Bell, Budarf, M. L. , Nieuwenhuijsen, B. W. , Barnoski, B. L. , Buetow, K. H. , Campbell, K. , Colbert, A. M. , Collins, J. , Daly, M. , and Desjardins, P. R. , Integration of physical, breakpoint and genetic maps of chromosome 22. Localization of 587 yeast artificial chromosomes with 238 mapped markers., Hum Mol Genet, vol. 4, no. 1, pp. 59-69, 1995.
G. E. Truett, Jacob, H. J. , Miller, J. , Drouin, G. , Bahary, N. , Smoller, J. W. , Lander, E. S. , and Leibel, R. L. , Genetic map of rat chromosome 5 including the fatty (fa) locus., Mamm Genome, vol. 6, no. 1, pp. 25-30, 1995.
M. Haldi, Perrot, V. , Saumier, M. , Desai, T. , Cohen, D. , Cherif, D. , Ward, D. , and Lander, E. S. , Large human YACs constructed in a rad52 strain show a reduced rate of chimerism., Genomics, vol. 24, no. 3, pp. 478-84, 1994.
E. S. Lander and Budowle, B. , DNA fingerprinting dispute laid to rest., Nature, vol. 371, no. 6500, pp. 735-8, 1994.
D. R. Cox, Green, E. D. , Lander, E. S. , Cohen, D. , and Myers, R. M. , Assessing mapping progress in the Human Genome Project., Science, vol. 265, no. 5181, pp. 2031-2, 1994.
J. Hästbacka, de la Chapelle, A. , Mahtani, M. M. , Clines, G. , Reeve-Daly, M. P. , Daly, M. , Hamilton, B. A. , Kusumi, K. , Trivedi, B. , and Weaver, A. , The diastrophic dysplasia gene encodes a novel sulfate transporter: positional cloning by fine-structure linkage disequilibrium mapping., Cell, vol. 78, no. 6, pp. 1073-87, 1994.
W. F. Dietrich, Miller, J. C. , Steen, R. G. , Merchant, M. , Damron, D. , Nahf, R. , Gross, A. , Joyce, D. C. , Wessel, M. , and Dredge, R. D. , A genetic map of the mouse with 4,006 simple sequence length polymorphisms., Nat Genet, vol. 7, no. 2 Spec No, pp. 220-45, 1994.
L. C. Hsu, Kennan, W. S. , Shepel, L. A. , Jacob, H. J. , Szpirer, C. , Szpirer, J. , Lander, E. S. , and Gould, M. N. , Genetic identification of Mcs-1, a rat mammary carcinoma suppressor gene., Cancer Res, vol. 54, no. 10, pp. 2765-70, 1994.
N. A. Lisitsyn, Segre, J. A. , Kusumi, K. , Lisitsyn, N. M. , Nadeau, J. H. , Frankel, W. N. , Wigler, M. H. , and Lander, E. S. , Direct isolation of polymorphic markers linked to a trait by genetically directed representational difference analysis., Nat Genet, vol. 6, no. 1, pp. 57-63, 1994.
W. F. Dietrich, Lander, E. S. , Smith, J. S. , Moser, A. R. , Gould, K. A. , Luongo, C. , Borenstein, N. , and Dove, W. , Genetic identification of Mom-1, a major modifier locus affecting Min-induced intestinal neoplasia in the mouse., Cell, vol. 75, no. 4, pp. 631-9, 1993.
C. Luongo, Gould, K. A. , Su, L. K. , Kinzler, K. W. , Vogelstein, B. , Dietrich, W. , Lander, E. S. , and Moser, A. R. , Mapping of multiple intestinal neoplasia (Min) to proximal chromosome 18 of the mouse., Genomics, vol. 15, no. 1, pp. 3-8, 1993.
K. Kusumi, Smith, J. S. , Segre, J. A. , Koos, D. S. , and Lander, E. S. , Construction of a large-insert yeast artificial chromosome library of the mouse genome., Mamm Genome, vol. 4, no. 7, pp. 391-2, 1993.
J. Hästbacka, de la Chapelle, A. , Kaitila, I. , Sistonen, P. , Weaver, A. , and Lander, E. , Linkage disequilibrium mapping in isolated founder populations: diastrophic dysplasia in Finland., Nat Genet, vol. 2, no. 3, pp. 204-11, 1992.
S. E. Lincoln and Lander, E. S. , Systematic detection of errors in genetic linkage data., Genomics, vol. 14, no. 3, pp. 604-10, 1992.
D. J. Goff, Galvin, K. , Katz, H. , Westerfield, M. , Lander, E. S. , and Tabin, C. J. , Identification of polymorphic simple sequence repeats in the genome of the zebrafish., Genomics, vol. 14, no. 1, pp. 200-2, 1992.
H. J. Jacob, Pettersson, A. , Wilson, D. , Mao, Y. , Lernmark, A. , and Lander, E. S. , Genetic dissection of autoimmune type I diabetes in the BB rat., Nat Genet, vol. 2, no. 1, pp. 56-60, 1992.
P. C. Groot, Moen, C. J. , Dietrich, W. , Stoye, J. P. , Lander, E. S. , and Demant, P. , The recombinant congenic strains for analysis of multigenic traits: genetic composition., FASEB J, vol. 6, no. 10, pp. 2826-35, 1992.
W. Dietrich, Katz, H. , Lincoln, S. E. , Shin, H. S. , Friedman, J. , Dracopoli, N. C. , and Lander, E. S. , A genetic map of the mouse suitable for typing intraspecific crosses., Genetics, vol. 131, no. 2, pp. 423-47, 1992.
H. J. Jacob, Lindpaintner, K. , Lincoln, S. E. , Kusumi, K. , Bunker, R. K. , Mao, Y. P. , Ganten, D. , Dzau, V. J. , and Lander, E. S. , Genetic mapping of a gene causing hypertension in the stroke-prone spontaneously hypertensive rat., Cell, vol. 67, no. 1, pp. 213-24, 1991.
A. J. MacMurray, Weaver, A. , Shin, H. S. , and Lander, E. S. , An automated method for DNA preparation from thousands of YAC clones., Nucleic Acids Res, vol. 19, no. 2, pp. 385-90, 1991.
A. H. Paterson, Damon, S. , Hewitt, J. D. , Zamir, D. , Rabinowitch, H. D. , Lincoln, S. E. , Lander, E. S. , and Tanksley, S. D. , Mendelian factors underlying quantitative traits in tomato: comparison across species, generations, and environments., Genetics, vol. 127, no. 1, pp. 181-97, 1991.
S. H. Hulbert, Ilott, T. W. , Legg, E. J. , Lincoln, S. E. , Lander, E. S. , and Michelmore, R. W. , Genetic analysis of the fungus, Bremia lactucae, using restriction fragment length polymorphisms., Genetics, vol. 120, no. 4, pp. 947-58, 1988.
C. Chang, Bowman, J. L. , DeJohn, A. W. , Lander, E. S. , and Meyerowitz, E. M. , Restriction fragment length polymorphism linkage map for Arabidopsis thaliana., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 85, no. 18, pp. 6856-60, 1988.
D. Barker, Green, P. , Knowlton, R. , Schumm, J. , Lander, E. , Oliphant, A. , Willard, H. , Akots, G. , Brown, V. , and Gravius, T. , Genetic linkage map of human chromosome 7 with 63 DNA markers., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 84, no. 22, pp. 8006-10, 1987.
H. Donis-Keller, Green, P. , Helms, C. , Cartinhour, S. , Weiffenbach, B. , Stephens, K. , Keith, T. P. , Bowden, D. W. , Smith, D. R. , and Lander, E. S. , A genetic linkage map of the human genome., Cell, vol. 51, no. 2, pp. 319-37, 1987.
E. S. Lander and Green, P. , Construction of multilocus genetic linkage maps in humans., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 84, no. 8, pp. 2363-7, 1987.