You are here

Bacterial Genomics Group: CRE papers

P. Ma, He, L. L. , Pironti, A. , Laibinis, H. H. , Ernst, C. M. , Manson, A. L. , Bhattacharyya, R. P. , Earl, A. M. , Livny, J. , and Hung, D. T. , Genetic determinants facilitating the evolution of resistance to carbapenem antibiotics., Elife, vol. 10, 2021.
C. M. Ernst, Braxton, J. R. , Rodriguez-Osorio, C. A. , Zagieboylo, A. P. , Li, L. , Pironti, A. , Manson, A. L. , Nair, A. V. , Benson, M. , Cummins, K. , Clatworthy, A. E. , Earl, A. M. , Cosimi, L. A. , and Hung, D. T. , Adaptive evolution of virulence and persistence in carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae., Nat Med, 2020.
M. D. Spencer, Winglee, K. , Passaretti, C. , Earl, A. M. , Manson, A. L. , Mulder, H. P. , Sautter, R. L. , and Fodor, A. A. , Whole Genome Sequencing detects Inter-Facility Transmission of Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae., J Infect, 2018.
G. C. Cerqueira, Earl, A. M. , Ernst, C. M. , Grad, Y. H. , Dekker, J. P. , Feldgarden, M. , Chapman, S. B. , Reis-Cunha, J. L. , Shea, T. P. , Young, S. , Zeng, Q. , Delaney, M. L. , Kim, D. , Peterson, E. M. , O'Brien, T. F. , Ferraro, M. Jane, Hooper, D. C. , Huang, S. S. , Kirby, J. E. , Onderdonk, A. B. , Birren, B. W. , Hung, D. T. , Cosimi, L. A. , Wortman, J. R. , Murphy, C. I. , and Hanage, W. P. , Multi-institute analysis of carbapenem resistance reveals remarkable diversity, unexplained mechanisms, and limited clonal outbreaks., Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 114, no. 5, pp. 1135-1140, 2017.