Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_99994
Subject:
lacZ.1
Aligned Length:
1073
Identities:
990
Gaps:
53

Alignment

Query    1  --MID---PVVLQRRDWQNPGVTQLNRLAAHPPFASWRNSQQARTDRPSQQLRSLNGQWRFAWFPAPQAVPQSW  69
              ||.   .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MTMITDSLAVVLQRRDWQNPGVTQLNRLAAHPPFASWRNSQQARTDRPSQQLRSLNGQWRFAWFPAPQAVPQSW  74

Query   70  LQCDLPQADTVVVPSNWQMHGYDAPIYTNVTYPITVNPPFVPTQNPTGCYSLTFNVDQSWLQQGQTRIIFDGVN  143
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct   75  LQCDLPDADTVVVPSNWQMHGYDAPIYTNVTYPITVNPPFVPAQNPTGCYSLTFNIDQSWLQQGQTRIIFDGVN  148

Query  144  SAFHLWCNGRWVGYGQDSRLPSQFDLSAFLRAGQNRLAVMVLRWSDGSYLQDQDMWRMSGIFRDVSLLHKPTTQ  217
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  SAFHLWCNGRWVGYGQDSXLPSQFDLSAFLRAGQNRLAVMVLRWSDGSYLQDQDMWRMSGIFRDVSLLHKPTTQ  222

Query  218  ISDFHVATRFNDDFSRAVLQAQVQMCGQLRDYLRVTVSLWQGQTQVASGTAPFGGQIIDQRGGYADRVTLRLNV  291
            ||||.|.|.||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ISDFQVTTLFNDDFSRAVLQAQVQMYGQLRDQLRVTVSLWQGQTQVASGTAPFGGQIIDQRGGYADRVTLRLNV  296

Query  292  QNPKLWSAQIPNLYRAVVQLHTADGTLIQAQACDVGFRQVRIQNGLLLLNGKPLLIRGVNRHQHHPLHGQVMDQ  365
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  QNPQLWSAQIPNLYRAVVQLHTADGTLIQAQACDVGFRQVRIQNGLLLLNGKPLLIRGVNRHQHHPLHGQVMDQ  370

Query  366  QTMVQDILLMKQNNFNAVRCSHYPNHPLWYTLCDRYGLYVVDQANIQTHGMVPMNRLTDDPRWLPAMSQRVTRM  439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  QTMVQDILLMKQNNFNAVRCSHYPNHPLWYTLCDRYGLYVVDQANIQTHGMVPMNRLTDDPRWLPAMSQRVTRM  444

Query  440  VQRDRNHPSVIIWSLGNQSGHGANHDALYRWIKSVDPSRPVQYQGGGADTTATDIICPMYARVDQDQPFPAVPK  513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  VQRDRNHPSVIIWSLGNQSGHGANHDALYRWIKSVDPSRPVQYQGGGADTTATDIICPMYARVDQDQPFPAVPK  518

Query  514  WSIKKWLSLPGQTRPLILCQYAHAMGNSLGGFAKYWQAFRQYPRLQGGFVWDWVDQSLIKYDQNGNPWSAYGGD  587
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  WSIKKWLSLPGQMRPLILCQYAHAMGNSLGGFAKYWQAFRQYPRLQGGFVWDWVDQSLIKYDQNGNPWSAYGGD  592

Query  588  FGDTPNDRQFCMNGLVFADRTPHPALTQAKHQQQFFQFRLSGQTIQVTSQYLFRHSDNQLLHWMVALDGKPLAS  661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  593  FGDTPNDRQFCMNGLVFADRTPHPALTQAKHQQQYFQFRLSGRTIQVTSQYLFRHSDNQFLHWMVALDGKPLAS  666

Query  662  GQVPLDVAPQGKQLIQLPQLPQPQSAGQLWLTVRVVQPNATAWSQAGHISAWQQWRLAQNLSVTLPAASHAIPH  735
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct  667  GQVPLDVGPQGKQLIQLPQLPQPQSAGQLWLTVRVVQPNATAWSQAGHISAWQQWRLAQNLSVTLPSASHAIPQ  740

Query  736  LTTSQMDFCIQLGNKRWQFNRQSGFLSQMWIGDKKQLLTPLRDQFTRAPLDNDIGVSQATRIDPNAWVQRWKAA  809
            ||||..|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  LTTSGTDFCIQLGNKRWQFNRQSGFLSQMWIGDQKQLLTPLRDQFTRAPLDNDIGVSQATRIDPNAWVQRWKAA  814

Query  810  GHYQAQAALLQCTADTLADAVLITTAHAWQHQGKTLFISRKTYRIDGSGQMAITVDVQVASDTPHPARIGLNCQ  883
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||.|||||||||||||.||
Sbjct  815  GHYQAQAALLQCTADTLADAVLITTAHAWQHQGKTLFISRKTYRIDGHGQMVINVDVAVASDTPHPARIGLTCQ  888

Query  884  LAQVAQRVNWLGLGPQQNYPDRLTAACFDRWDLPLSDMYTPYVFPSQNGLRCGTRQLNYGPHQWRGDFQFNISR  957
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  LAQVSQRVNWLGLGPQQNYPDRLTAACFDRWDLPLSDMYTPYVFPSQNGLRCGTRQLNYGPHQWRGDFQFNISR  962

Query  958  YSQQQLMQTSHRHLLHAQQGTWLNIDGFHMGIGGDDSWSPSVSAQLQLSAGRYHYQLVWCQKTKGGRADPAFLY  1031
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.           
Sbjct  963  YSQQQLMQTSHRHLLHAQQGTWLNIDGFHMGIGGDDSWSPSVSAQFQLSAGRYHYQLVWCQKX-----------  1025

Query 1032  KVVDIQHSGGRSSLQGPRFQGKPIPNPLLGLDSTRTG  1068
                                                 
Sbjct 1026  -------------------------------------  1025