Neurospora Contig Tables

Below are two tables containing the contig and supercontig data:

Supercontig Table displays length and contained contigs
Contig Table displays length and supercontig number

Supercontig and contig numbers are preceded by the version of the assembly. For example:

Contig 3.25 - refers to contig number 25 within assembly 3.
Supercontig 3.2 - refers to supercontig number 2 within assembly 3. Supercontig 3.2 contains contigs 3.18,3.19,..., 3.40.

You can also download these data in comma-separated files: supercontigs.csv, contigs.csv

See Neurospora Assembly for a description of the assembly and ordering of contigs and supercontigs. See Genetic Maps for details on linkage group assignments.

Supercontig Table

Supercontig	Contig number range [first-last]	Size of combined contigs (bp)	Linkage Group(s)
1	[1-17]	1829605	III VI
2	[18-40]	1774933	I
3	[41-57]	1387360	V
4	[58-81]	1357685	II V
5	[82-102]	1337149	I
6	[103-131]	1265702	VII
7	[132-141]	1079180	I
8	[142-156]	1005303	I
9	[157-172]	963993	I
10	[173-194]	957340	II V
11	[195-205]	893981	V
12	[206-215]	861552	I VI
13	[216-224]	852488	V
14	[225-234]	786596	IV VII
15	[235-254]	768614
16	[255-264]	679655	VI
17	[265-279]	666850
18	[280-289]	605907	II VI
19	[290-302]	578924	IV
20	[303-310]	566151	II
21	[311-317]	565452	VI
22	[318-329]	565105	III
23	[330-334]	537294	VII
24	[335-348]	534254
25	[349-356]	500218	VII
26	[357-364]	441123	III
27	[365-368]	431386	IV
28	[369-372]	429370	III V
29	[373-383]	418331	IV
30	[384-389]	376027	V
31	[390-393]	373382	II
32	[394-404]	366756
33	[405-409]	359475	IV
34	[410-415]	347373	VI
35	[416-419]	338200	III V
36	[420-424]	337603	IV
37	[425-433]	322436
38	[434-439]	321146	I
39	[440-447]	300699
40	[448-457]	298676	III
41	[458-462]	298114	IV
42	[463-470]	293518
43	[471-475]	282144	III
44	[476-480]	276483	IV
45	[481-481]	267167	IV
46	[482-487]	254604	I
47	[488-493]	248831	VII
48	[494-496]	244306
49	[497-499]	239452	IV
50	[500-502]	238229	I
51	[503-506]	220196	II
52	[507-515]	220100	II
53	[516-521]	218317	III
54	[522-528]	212617
55	[529-532]	195396	I
56	[533-539]	190596	IV
57	[540-541]	183085	II
58	[542-545]	182770	II III
59	[546-549]	181166	IV
60	[550-554]	176972	V
61	[555-557]	169137
62	[558-561]	167730	V
63	[562-564]	163209
64	[565-566]	157812
65	[567-569]	157000	I
66	[570-573]	153575
67	[574-575]	152852
68	[576-577]	150355
69	[578-579]	142997	I
70	[580-583]	140019
71	[584-586]	127800	I
72	[587-588]	125824
73	[589-597]	124893	I
74	[598-600]	124428
75	[601-604]	123957
76	[605-607]	118107	II
77	[608-612]	117949
78	[613-617]	115629
79	[618-620]	114175	VII
80	[621-624]	110890	II
81	[625-627]	110520
82	[628-630]	110196	V
83	[631-633]	99005
84	[634-635]	91952	I
85	[636-657]	90303
86	[658-660]	89789
87	[661-665]	89337	VI
88	[666-668]	83329	I
89	[669-671]	76816
90	[672-674]	72776
91	[675-678]	70383	VI
92	[679-679]	68536
93	[680-680]	68110
94	[681-682]	62173
95	[683-685]	59077
96	[686-687]	58080
97	[688-689]	57884
98	[690-692]	45794
99	[693-694]	43256
100	[695-700]	43072
101	[701-705]	40283
102	[706-706]	38390
103	[707-710]	37884
104	[711-718]	35988
105	[719-719]	27203
106	[720-720]	26372	VII
107	[721-721]	26020
108	[722-722]	25624
109	[723-723]	25408
110	[724-725]	24057
111	[726-729]	23134
112	[730-732]	20698
113	[733-735]	18220
114	[736-736]	17537
115	[737-737]	17404
116	[738-741]	17155
117	[742-745]	16926
118	[746-747]	16211
119	[748-748]	15582
120	[749-749]	14934
121	[750-750]	14319
122	[751-752]	13527
123	[753-757]	13478
124	[758-759]	13403	VII
125	[760-762]	13390
126	[763-763]	13105	I
127	[764-764]	12290
128	[765-768]	11849
129	[769-770]	11651
130	[771-772]	10223
131	[773-773]	9881
132	[774-774]	9771
133	[775-776]	8863
134	[777-777]	8635
135	[778-778]	8603
136	[779-779]	8194
137	[780-780]	8172
138	[781-783]	8008
139	[784-784]	6652
140	[785-786]	6516
141	[787-787]	5736
142	[788-789]	4762
143	[790-790]	4359
144	[791-792]	4087
145	[793-793]	4028
146	[794-794]	3804
147	[795-795]	3709
148	[796-796]	2975
149	[797-797]	2739
150	[798-798]	2685
151	[799-799]	2616
152	[800-800]	2600
153	[801-801]	2581
154	[802-802]	2565
155	[803-803]	2565
156	[804-804]	2551
157	[805-805]	2513
158	[806-806]	2459
159	[807-807]	2409
160	[808-808]	2333
161	[809-809]	2331
162	[810-810]	2318
163	[811-811]	2287
164	[812-812]	2282
165	[813-813]	2263
166	[814-814]	2259
167	[815-815]	2247
168	[816-816]	2237
169	[817-817]	2175
170	[818-818]	2108
171	[819-819]	2057
172	[820-820]	2047
173	[821-821]	2033

Contig Table

Contig	Supercontig	Size (bp)	Supercontig Linkage Group(s)
1	1	135650	III VI
2	1	60112	III VI
3	1	22391	III VI
4	1	18206	III VI
5	1	79399	III VI
6	1	166617	III VI
7	1	62474	III VI
8	1	100332	III VI
9	1	80786	III VI
10	1	2279	III VI
11	1	93300	III VI
12	1	522296	III VI
13	1	199770	III VI
14	1	101344	III VI
15	1	107714	III VI
16	1	62420	III VI
17	1	14515	III VI
18	2	84886	I
19	2	16988	I
20	2	57588	I
21	2	4107	I
22	2	119156	I
23	2	432923	I
24	2	100390	I
25	2	86769	I
26	2	66556	I
27	2	128680	I
28	2	27611	I
29	2	86019	I
30	2	12478	I
31	2	44041	I
32	2	121415	I
33	2	28587	I
34	2	2471	I
35	2	27297	I
36	2	16452	I
37	2	119209	I
38	2	151551	I
39	2	36892	I
40	2	2867	I
41	3	322911	V
42	3	102634	V
43	3	10812	V
44	3	10134	V
45	3	276316	V
46	3	33966	V
47	3	7752	V
48	3	51013	V
49	3	47036	V
50	3	54650	V
51	3	209184	V
52	3	40176	V
53	3	83633	V
54	3	28829	V
55	3	14637	V
56	3	55942	V
57	3	37735	V
58	4	42541	II V
59	4	9467	II V
60	4	40194	II V
61	4	29102	II V
62	4	105864	II V
63	4	33329	II V
64	4	120227	II V
65	4	66877	II V
66	4	62744	II V
67	4	89903	II V
68	4	14297	II V
69	4	7784	II V
70	4	8544	II V
71	4	47746	II V
72	4	67890	II V
73	4	118027	II V
74	4	49865	II V
75	4	163881	II V
76	4	39331	II V
77	4	89843	II V
78	4	5799	II V
79	4	33326	II V
80	4	94454	II V
81	4	16650	II V
82	5	33886	I
83	5	241343	I
84	5	64403	I
85	5	2360	I
86	5	75748	I
87	5	85804	I
88	5	123427	I
89	5	110311	I
90	5	48078	I
91	5	105148	I
92	5	22620	I
93	5	17310	I
94	5	45573	I
95	5	57675	I
96	5	4758	I
97	5	10113	I
98	5	31136	I
99	5	2422	I
100	5	82161	I
101	5	94631	I
102	5	78242	I
103	6	51138	VII
104	6	40562	VII
105	6	15106	VII
106	6	60478	VII
107	6	38534	VII
108	6	224275	VII
109	6	37676	VII
110	6	7913	VII
111	6	73574	VII
112	6	33934	VII
113	6	104947	VII
114	6	4191	VII
115	6	69257	VII
116	6	42534	VII
117	6	51140	VII
118	6	19137	VII
119	6	20924	VII
120	6	15405	VII
121	6	2953	VII
122	6	24403	VII
123	6	13884	VII
124	6	39697	VII
125	6	30023	VII
126	6	35448	VII
127	6	83672	VII
128	6	40518	VII
129	6	37241	VII
130	6	8388	VII
131	6	38750	VII
132	7	142147	I
133	7	282433	I
134	7	5807	I
135	7	129490	I
136	7	51556	I
137	7	44069	I
138	7	230006	I
139	7	145122	I
140	7	30538	I
141	7	18012	I
142	8	2836	I
143	8	81259	I
144	8	39157	I
145	8	55306	I
146	8	92249	I
147	8	15022	I
148	8	25252	I
149	8	9358	I
150	8	66021	I
151	8	45843	I
152	8	245389	I
153	8	227071	I
154	8	50048	I
155	8	35253	I
156	8	15239	I
157	9	10324	I
158	9	14819	I
159	9	32580	I
160	9	25563	I
161	9	67146	I
162	9	31407	I
163	9	2157	I
164	9	129031	I
165	9	67459	I
166	9	100470	I
167	9	191029	I
168	9	18559	I
169	9	20973	I
170	9	88547	I
171	9	69890	I
172	9	94039	I
173	10	2752	II V
174	10	32565	II V
175	10	89718	II V
176	10	67929	II V
177	10	114744	II V
178	10	16962	II V
179	10	5798	II V
180	10	103780	II V
181	10	52617	II V
182	10	75566	II V
183	10	11034	II V
184	10	13917	II V
185	10	30999	II V
186	10	28005	II V
187	10	25790	II V
188	10	30885	II V
189	10	110113	II V
190	10	12513	II V
191	10	16440	II V
192	10	59016	II V
193	10	48427	II V
194	10	7770	II V
195	11	9028	V
196	11	17629	V
197	11	28983	V
198	11	4101	V
199	11	202233	V
200	11	45334	V
201	11	271361	V
202	11	128910	V
203	11	148112	V
204	11	19962	V
205	11	18328	V
206	12	2006	I VI
207	12	3629	I VI
208	12	14162	I VI
209	12	30631	I VI
210	12	29346	I VI
211	12	91129	I VI
212	12	254234	I VI
213	12	91726	I VI
214	12	290923	I VI
215	12	53766	I VI
216	13	61878	V
217	13	185651	V
218	13	42710	V
219	13	141302	V
220	13	59095	V
221	13	154980	V
222	13	107748	V
223	13	86604	V
224	13	12520	V
225	14	71471	IV VII
226	14	27689	IV VII
227	14	59900	IV VII
228	14	253572	IV VII
229	14	33278	IV VII
230	14	137571	IV VII
231	14	118056	IV VII
232	14	41933	IV VII
233	14	35764	IV VII
234	14	7362	IV VII
235	15	69088
236	15	37621
237	15	13486
238	15	7931
239	15	83445
240	15	31506
241	15	14401
242	15	4757
243	15	10041
244	15	11200
245	15	184895
246	15	28929
247	15	104946
248	15	6536
249	15	57092
250	15	42531
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